冯明珠案与斩兽首 故宫政治挂帅
上任百日之际，台北故宫新任院长林正仪曾向媒体表示，基于博物馆专业，两岸仍维持「正常交流」。然而，从卸任院长冯明珠受聘担任北京故宫研究院顾问却受到调查，到影星成龙捐赠给故宫南院的复刻12兽首在匆促的咨询后就急于「斩首」，莫不是「文化台独」的政治操作。
冯明珠卸任3个多月后，受聘北京故宫研究院顾问，在她看来原是文化交流美事，也是为台湾学界争光，但陆委会等单位认为有违法之虞，要求台北故宫启动行政调查；外界以可能「泄密」来看待此事，林正仪更表明「不适合」，最终冯明珠决定向北京辞去顾问职。
冯明珠辞去顾问职、接受调查，几个月下来并无具体违法情事，立委陈学圣日前也曾指出，陆委会早有相关规定，不限制退休公务人员担任国际间的义务职、荣誉职，「如果冯前院长没有违法，必须还其清白」，然而台北故宫迟迟还未还她公道。在中国社科院台研院综合研究室主任金奕看来，从冯明珠受聘受阻一事，即可看出蔡英文当局的强烈政治目的。
从设立之初就备受争议的故宫南院复刻12兽首，更是在匆促间便拍板决定拆除，所谓「咨询过各界意见」却始终未公布过程和名单，而被拆除的12兽首去处也还未有方案，台北故宫便急于「斩首」，陈学圣便指出，据其了解实是受到地方政治人物要胁，若兽首未在半年内处理完毕，故宫高层将有人被迫下台。
故宫南院摆放复刻的12兽首，艺术性、代表性固然可讨论，除了咨询过程「黑箱」，连「游客意见调查」也未如实呈现，陈学圣指出，调查结果有5成民众反对移置，赞成者只有2成多，但故宫却将3成多无意见票数灌入赞成比例，这样的「斩首」行动，为的就是去中国化。