阳明交大合校案传「黑箱作业、利益输送」 校方澄清：不排除采法律行动
▲阳明大学澄清，合校依民主程序，过程透明公开，并无黑箱作业。（图／记者徐斌慎摄）
阳明大学与交通大学上月通过教育部同意合校，已报请行政院核准，但有媒体指出，阳明大学校长郭旭崧「黑箱并校」、「疑似利益输送」等。对此，阳明大学稍早发声明指出，阳明尊重言论自由，并尊重校友对母校关心，但对于不实言论，校方已委请律师，如有损及校誉将采进一步法律行动。
阳明指出，自2018年重启合校讨论，皆秉持公开透明原则，不仅有教师会代表与学生代表参与，重要事项亦邀请校友会列席，所有会议纪录皆公开上网，期间并召开至少七次公听会与说明会，并透过录影直播供师生校友参与，媒体也能直接观看直播。对于部分校友因公务繁忙无法参加而有所误解，校方深表遗憾。
阳明也说，合校乃重大事项，校务会议依民主程序，除2018年9月26日校务会议讨论启动合校采记名表决以示负责外，包含选择合校优先对象、通过合校意向书、通过合校计划书等重大事项皆采无记名投票。报导指称「合校计划书不给师生过问 全都校长说了算」乃错误讯息，特此澄清。
阳明也重申，部分校友关心合校经费，校方予以尊重。但教育部已表示，智慧健康大楼规划由公共建设预算逐年编列。合校的目的除可健全大学发展外，也肩负替台湾培养跨领域人才及新世代公民的愿景。阳明自创校以来肩负国家社会发展之使命，校方信任政府培养人才、提升国家竞争力的决心，这也是合校受到校内师生与社会多数支持的原因。