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小光与李子交战过后——
“现在开始，挑战者小智对道馆馆主李子的道馆赛，使用的宠物小精灵限为三只，任意一方的三只无法战斗就算比赛结束，但比赛中只认同挑战者更换宠物小精灵。”
经过小光的特别战斗，李子打起了精神，在第二天，小智开始了他的道馆挑战，小光穿着拉拉队队服给两人加油还有小刚在一旁观战。
礼司先生因为要忙饲育屋的事情没有时间来看小智的比赛，而孤叶并不想去看小智的比赛，因为他明白小智一定会拿到徽章的。
小智虽然生气孤叶不去看自己比赛，但是小智只是表面生下气，在信誓旦旦能获得徽章后，小智他们去了道馆挑战了，而孤叶正好喜欢悠闲生活的感觉，跟洁儿留在了礼司的家中，帮忙照顾一下他所被托付的宠物小精灵。
当时，礼司本来以为孤叶第一次帮忙照顾其他人的宠物小精灵，会手忙脚乱，但是当看到孤叶反而身边围着那些宠物小精灵嬉笑着，有些趴在孤叶膝盖上，孤叶怀中还抱着一只魅力喵抚摸着，都完全没有排斥的感觉，洁儿也是这样，礼司只能惊叹这两人对宠物小精灵的亲和力。
礼司来到孤叶面前说道：“多谢你了，要没有我今天肯定忙不过来了，怎么样，现在去看小智的比赛还来得及。”
其实孤叶一直分心用超能力注意着帷幕道馆那边的动静，而且也看到了帷幕道馆的天花板被炸掉的那一幕。
现在，孤叶抬头看看天，乌云缓缓飘了过来，孤叶说道：“不用了，我相信小智会拿到徽章的，而且快下雨了，我们回屋子里等他们的好消息吧！”礼司说道：“恩！”孤叶叫上洁儿一起回到了屋内，喝着茶水，聊聊天，直到黄昏······
“但如果打平的话给不给徽章啊！”小光对黑田先生问道。黑田先生说道：“那就得看道馆馆主的判断了。”李子说道：“也就是说只要我认同就行了是吧！”黑田先生说道：“是的！”李子说道：“这样的话，挑战者小智的战斗具有相当的水准，完全可以得到认同吧！”李子的宠物小精灵们点点头。
“那就决定了！”李子拿出一个方盘，上面摆放着图案是橘黄色的两个小长方形跟两个大长方形组成的正方形徽章。李子说道：“请收下吧！这就是圆石徽章（日：格斗徽章）！”小智说道：“可以吗？”李子说道：“当然了。”小智接过徽章说道：“谢谢啦！李子。”李子说道：“是我应该感谢你才对，托你的福，我终于有继续担任馆主的信心了。”小光说道：“太好了！”小刚说道：“好好干啊！李子。”小智说道：“好！我获得圆石徽章了！”
李子叹了口气：“终于可以放松一下了。”小智说道：“你在说什么啊！李子，明天还有一个挑战者呢！”李子一惊：“啊！还有挑战者，难道是小刚？”小刚摇摇头，小刚说道：“是孤叶，我们刚认识的时候，跟我们在一起，穿着白色风衣的那个人。”黑田先生嘀咕了一句：“孤叶？好像在哪里听过。”
李子说道：“他也是跟小智一样吗？”小智说道：“小叶，的确是跟我一样挑战神奥联盟的，所以，道馆赛肯定要来的。”李子立刻鼓起劲说道：“好期待啊！明天又会有怎样的比赛呢？”小智说道：“李子···”小智欲言又止，然后说道：“那我们先离开了，明天再见。”“恩！再见！”
当小智他们走掉后，黑田先生才对李子说道：“李子，明天的比赛你可要十分小心啊！那个孤叶很强大。”李子一愣：“黑田先生你知道吗？”黑田先生说道：“我只知道他很强，其他我不会多说什么的。”李子说道：“很强吗？不管有多强，我一定会全力以赴的！”黑田看着李子的样子点了点头——
夜晚——
成功获得了徽章的小智，在晚上，礼司先生带着小智一行去帷幕市的标志的陨石公园参观。孤叶早就带着洁儿去参观过了，所以，孤叶与洁儿在宠物小精灵中心呆着并没有跟着一起去。
小智一行跟着礼司先生参观完陨石之后，礼司先生回到了家中，而小智他们回到了宠物小精灵。小智宝贝的擦拭着徽章，小光说道：“状态不错啊，这样一来就有三枚徽章了。”
小智说道：“还早着呢！要参加神奥联盟必须有八枚徽章才行，我可没时间松懈啊！”小光说道：“也就是说还有五枚咯，小智你一定没问题的。”
小智说道：“但这第三枚圆石徽章并非赢了李子才得到的。”小刚说道：“李子是认同了你和她的战斗才把徽章给你的，你应该为自己感到骄傲才是。”
小智说道：“正因如此，今后的战斗才更不能给李子丢脸啊！皮卡丘，再继续努力吧！”“皮卡皮卡”小刚说道：“恩！就是这股冲劲，那么话说···”小刚打开了在屏幕上打开了神奥地图，说道：“接下来该去挑战哪个道馆呢？”小智说道：“恩！也对哦！”
这个时候，乔伊小姐过来说道：“从这里出发的话不如去湿原市（日ri：野濑市，位于帷幕市西南方向）的道馆怎么样？”小智嘀咕道：“湿原市···”乔伊小姐说道：“在途中还会经过一些观光疗养的设施，想在那里放松一下的话也不错哦！道馆馆主貌似是使用水系宠物小精灵的。”
小智说道：“水属性啊！好极了，那就去湿原市吧！”“皮卡”小刚窜到了乔伊小姐身边，说道：“湿原市真是个好地方啊！就和小生一同沉浸深渊吧！然后再一起度过在观光时的时光···”“嗤”不良蛙的毒刺戳中小刚，“麻···麻了，嘣！”小刚倒地，被不良蛙拖走了。
小智跟小光都是苦笑着，小智问道：“对了，小光你下一场华丽大赛有什么打算？”小光强颜欢笑说道：“喔！那个啊！我还在考虑新的配合···”波加曼有些担心的看着小光。
没过多久，在陨石聚集的陨石公园方向，出现冲天的光芒，第一时间吸引了许多人的注意，可是没等多久便消失了，孤叶在房间中也看到了，孤叶说道：“看来今天晚上有事情要发生啊！”洁儿说道：“孤叶，刚刚那个是什么？”孤叶说道：“是陨石那边，应该是陨石的光芒，但是，突然在这种时候发光，肯定是有事情发生了。”
突然，孤叶听到外面有些吵闹，在房间窗口中也看到了小智一行跟着李子跟路卡利欧跑了出去，孤叶说道：“洁儿，你在房间等我，我去看看这次又有什么大人物在搞大动作。”“恩！”
其实对于清楚的记着前世所看的，孤叶知道这次应该是神奥地区的大型组织登场了。孤叶叫出了超梦，让超梦隐去了孤叶与超梦自己的身形气息，在阳台上飞了出去，马上就来到了陨石处，也看到了三架直升机跟一些穿着特殊制服的人，身上的黄色标志很像是字母“g”，毫无疑问这是神奥地区的秘密阻止——银河队！当孤叶跟超梦飘在空中呆了没多久，看着火箭队三个活宝被打后，小智他们也赶到了。
小智喊道：“火箭队！”李子看着陨石说道：“陨石被他们给···”小光说道：“那些是什么人？”小智说道：“火箭队，是你们的同伙吗？”
武藏说道：“才不是呢！”小智看到了攻击火箭队的那只宠物小精灵拿出图鉴说道：“那只宠物小精灵是···”
图鉴音：“毒骷蛙，毒刺宠物小精灵，不良蛙的进化型，经毒囊里调制的剧毒可通过手臂传到拳头上的毒刺上。（日：图鉴）”而且对方的还是闪光的毒骷蛙，本来的毒骷蛙应该是蓝色的，而对方的却是绿色的，但是这种时候，大家也都忽略掉了。
喵喵说道：“那些穿着华丽的家伙们打算把陨石都偷走。”小光说道：“华丽装束···”小刚说道：“记得以前也说过吧！”小智说道：“对啊！在百代市也是。”
小光说道：“在随意遗迹里也是···”带头的直双角发型蓝发的女人说道：“毒骷蛙，黑暗波动（日：邪恶波动；国：恶波动）！”
李子说道：“路卡利欧，波导弹！”路卡利欧的波导弹与毒骷蛙黑暗波动相撞，在旁边的火箭队虽然没被击中，但是也被爆炸的劲风给吹飞跌在一旁。
李子说道：“好强的力量啊！”那直双角发型的蓝发女人说道：“作为城市的标志又有何意义，这些陨石只是回归它们原有的姿态而已。”
小智说道：“什么？”小光呢喃道：“原有的姿态。”带头的女人继续说道：“一切都是为了我们所向往的新世界。”小智嘀咕道：“新世界···”“皮卡”
这个时候，君莎小姐骑着摩托车飞过来了，在谢过李子的即使通知后，看着银河队说道：“你们打算拿陨石干什么？干扰电波也是你们搞的鬼吧！”
带头的女人淡然道：“你说呢。”小刚说道：“那破坏宠物小精灵中心的设备也是你们咯！”君莎小姐说道：“并不单单是宠物小精灵中心，整个城镇的技能几乎全部瘫痪了。”“诶！”
“你们最近的各项秘密活动，以为我们神奥特搜机关不知道到吗？在神奥地区暗地里活动的组织，就是你们银河队吧！”小智说道：“银河队···”
君莎小姐说道：“到底策划着什么想要偷取陨石。”带头的女人说道：“你们这些俗人自然不了解我们伟大的计划。”孤叶在空中听着这些犹如论神者（也就是神棍）一般的语言，浑身不自在。带头的女人下令道：“毒骷蛙，黑暗波动！”
小智：“十万伏特！”小光：“泡沫光线！”李子：“波导弹！”三招技能迎向了黑暗波动虽然爆炸挡住了，却还是有些黑圈飞散开，特别有一个飞向了小刚。
这个时候，不良蛙出来，使出瓦割（国：劈瓦）挡下来了。小刚说道：“不良蛙，谢谢你！”这个时候，不良蛙跟毒骷蛙恶狠狠的对视着，两只宠物小精灵的表情倒是挺恐怖的。
君莎小姐说道：“这里不久后即将被包围，不要做无谓的抵抗，准备乖乖的蹲大牢。”
带头的女人说道：“把他们都驱逐出去。”身后的队员六名队员每人都抛出了六颗精灵球，一共三十六只宠物小精灵，而且都是大嘴蝠。
小光拿出图鉴说道：“这些宠物小精灵是···”图鉴音：“大嘴蝠，蝙蝠宠物小精灵，超音蝠的进化型，借由其夜光习性而飞翔在夜空中搜寻猎物。（日：图鉴）”大嘴蝠使出了真空斩（国：破空斩），无数蓝色的风刃袭向小智他们。
不良蛙跟毒骷蛙还在那边拼呢，带头的女人说道：“搞什么呢？毒骷蛙，快干掉它！”
小刚下令道：“不良蛙，瓦割！”毒骷蛙躲过了不良蛙的瓦割把不良蛙打飞出去，偷溜的火箭队刚巧不巧，变成了在不良蛙与毒骷蛙之间，两只宠物小精灵都狰狞着脸，小刚下令道：“不良蛙，毒针！”
带头的女人下令道：“毒爆弹（日：毒浆炸弹；国：臭泥爆弹）！”毒针与毒爆弹在火箭队面前相撞爆炸，火箭队悲剧的飞走了。
直升机收取着陨石，但是，众人都被大嘴蝠困住了，君莎小姐说道：“数量太多了，必须想办法靠近直升机才行。”这个时候，一只大嘴蝠在皮卡丘跟波加曼身后，开始凝聚影子球，但是一道威力十足的电击打飞了那只大嘴蝠，一看是礼司带着电击兽赶来了。
礼司说道：“大家没事吧！”在知道了事态的情况后，说道：“恩！只有集中宠物小精灵们的招式来破坏那机械了，电击兽，在前往真嗣那之前先做个热身吧。”“雷普”君莎小姐说道：“首先得想办法对付这些大嘴蝠啊！”
小智说道：“知道了，皮卡丘，十万伏特！”礼司说道：“电击兽，再来一次，打雷（日：落雷）！”小光下令道：“波加曼，泡沫光线！”
三只宠物小精灵的一波攻击打败了一些大嘴蝠，但是还有不少呢！礼司说道：“大家快追上去。”带头的女人说道：“毒骷蛙，毒爆弹！”
这个时候，不良蛙正趴在毒骷蛙头上，毒骷蛙不管头上的不良蛙，直接转过头，使出毒爆弹炸倒了电击兽，电击兽跌倒在地上，被大嘴蝠围着，三只大嘴蝠凝聚影子球的时候，皮卡丘冲了过去，打飞了三只大嘴蝠。
但是，竟然有个大嘴蝠跌落后，还是将影子球硬给发射出去了，皮卡丘以为自己会被命中，但是，电击兽用闪电拳（国：雷光掌）挡下了。两只电系宠物小精灵并肩作战所发挥的电系组合威力非常强劲，将剩余的大嘴蝠都给击落了······——
宠物小精灵图鉴——
不良蛙，毒刺宠物小精灵，毒系与格斗系宠物小精灵，特性：预知危险/干燥皮肤，隐藏特性：毒手，身高：0.7m，体重：23kg，可以通过身上带有的毒刺来释放毒素，脸颊两侧的共鸣袋不断鼓起，给人一种不悦的感觉。
毒骷蛙，毒刺宠物小精灵，不良蛙的进化型，毒系与格斗系宠物小精灵，特性：预知危险（拥有预知危险特性的宠物小精灵出场时，能预知对方是否拥有对自身有威胁的技能。能触发预知危险的技能为：属性克制自身的技能；一击必杀技，剪刀断头台、尖角钻、地裂、绝对零度。对觉醒力量、审判之石或其它使用后才改变属性的技能无效）/干燥肌肤（拥有干燥肌肤特性的宠物小精灵受到水属性技能攻击时不会受伤，并回复hp最大值的1/4。拥有干燥肌肤特性的宠物小精灵受到火属性技能攻击时，攻击方技能威力提高25%。天气为雨天时，干燥肌肤宠物小精灵每回合回复hp最大值的1/8。天气为晴天时，干燥肌肤宠物小精灵每回合损失hp最大值的1/8），隐藏特性：毒手（拥有毒手特性的宠物小精灵使用近身攻击技能时，有30%的几率令目标中毒。与技能的特效叠加。毒手在技能特效之后判定，如果技能特效已经对目标造成了异常状态，毒手不会发动），身高：1.3m，体重：44.4kg，它的爪间有一个剧毒的腺体，甚至擦伤都会致人于死地。