与此同时，李辉彻底取消了军户制度，军户全部编入农业人口，宣布实现普遍义务兵役制，每家的十六岁到六十岁的男丁自动编入预备役民团，每逢农闲进行训练，战时则加入预备役民团，协助正规军作战，民中精壮以及退伍士卒编入地方军队，直接参与大规模战争。
各地优秀男儿，在每年春季进行遴选之后，择优进入正规军团，服兵役，保卫国家。为期三年，三年之后表现优异者转入志愿兵，其余人等发回原籍，不脱产，加入预备役民团，随时准备战争动员。
东山军最初的六个整编师则全年处于备战状态，士兵脱产训练，学习各种火器的操作和作战技巧，体能训练，作为国家常备军，时时刻刻做好牺牲的准备。
经过这一番改革之后，李辉将原本有些松动的军权又牢牢地掌握在手中，连黄宗旺的世忠军也要进行改制，这样李辉就可以以“不称职”等借口将世忠军中顽固中层将领拿掉，换上从抗清书院毕业的嫡系将领进行管辖。
如此一来，东山军锋锐营变成了东山军锋锐师，在军队中的编号就是东山军第一师，也即传说中的。潜龙营等依次排下来，排在最后的便是飞旗营，也叫飞旗师。
水军也改名为海军，镇海，伏波，平涛三个营自动升级为舰队，同师级序列。
同时带来的还有东山军的大规模换装，正规军手中落后的火铳全部被先进的燧发火枪代替，在蒸汽动力的使用下，东山军制造军火的水平大大提高，喜好专研的宋应星、戴苍等人已经开始研究机械冲床和蒸汽船了。
在崇明岛的一个角落，用帷帐遮盖起一块地方，里面不时传来丁丁当当的声音，大家都很好奇在生产什么，有知情人神神秘秘的附耳说道，“这里面在研究怪兽，可以压死人的怪兽”
大家也不明白这怪兽是什么东西，但一定是惊世骇俗的玩意，也就不去管它。
连珠铳这种吃子弹的怪兽武器也得到了广泛推广，按照新编制，每个营可以拥有两架连珠铳作为火力支援，碗口铳等近距离面杀伤武器也得到了扩大使用，借助于蒸汽锻压的广泛应用，大风弩的弩臂换成了钢制，威力大大增加。
经过这一番整军，东山军面貌为之一新，由一支古代军队一跃而成为大航海时代的近代化军队，实力大大增加。
李辉看着一队队手持新式燧发枪的士兵，心中感慨万千，四年前他有什么？不过十九个人，现在竟然有了这样一支庞大规模的近代军队，还有一整套完整的预备役制度，他也算过，如果今晚发生战争，明早他便可以从东山军控制区拉出一支五十万人的庞大军队来
为各地游击队的支援也大大增加，各地的游击队不但没有被撤销，反而得到了先进的神火飞鸦、大风弩、霹雳雷，还有淘汰下来的大量的火铳的支援，甘陕、直隶、山东山西各地反清起义屡屡发生，满清焦头烂额，不得已之下，已经有了撤回辽东的心。
辽东是说回就回的？
奉多尔衮的命令，阿济格率领正红旗大军五万，向辽东挺进，驻守辽东的东山军奋起反击，在蒙古骑兵和退役关宁军的支持下，将正红旗包围在残破的锦州城下，同时，刚刚改编完毕的平涛舰队远征而来，用重炮将满清打得狼奔豕突，溃不成军。
吕宋岛收入囊中之后，当地发展迅速，李辉在吕宋岛种植了大量的橡胶树，台湾岛上的橡胶树已经茁壮成长，不久之后便可以采收了。
橡胶是重要的工业密封件和减震材料，李辉对此高度重视，不但要求有条件的各地栽种更多的橡胶树，还特别设立了扶持基金。
“现在很多日本人也想种植橡胶树，我的王爷，我此次来就是为他们乞讨一些橡胶树苗的。”今村秋野看着高高在上的李辉，脸上笑成了一朵花。
“今村，别来无恙？”李辉看着这个忠诚的走狗，也难为了这小子，三月前银州暴发日本矿工暴，他在东山军没有授权之下悍然下令，将数万名日本矿工全部屠杀，尸体堆成一座山。
“这是我的职责。”面对死在他手下的同胞，今村没有表现出一丁点的同情心，“如果不杀掉他们，我们大明人就要为他们付出更大的伤亡。”
“今村，你做的不错”李辉笑了笑，“现在日本的那帮贱民们对我们可有异议？”
“回王爷的话，”今村跪在地上，连连叩头，“现在那帮矮萝卜乖极了，有王爷的大军驻扎在那里，他们哪敢多言再说有胡说八道的，属下已经送他们去阴曹地府报告了。”
“很好，很好。”李辉再次表扬，“你要配合沃顿船长加紧向南洋巴达维亚等地贩卖劳工，作为我们清除劣等民族，出口创汇的重要手段。现在你可以正式加入东山军了，祝贺你”
大厅中传来稀稀拉拉的鼓掌声，今村激动得涕泪并流，“谢，谢王爷您的大恩大德小的永远不会忘记”
“起来吧”李辉看着这条忠实的狗，“建功立业的机会就摆在你的面前，你要努力”
“是”今村站起身，擦擦眼泪，太激动了，全身都在乱颤，“请王爷放心”
跟随今村秋野前来的还有几个随从，这几个日本人穿上大明人的衣服，却怎么也穿不出大明人那种清逸洒脱，倒好像穿上衣服的猴子，不伦不类。
夜晚降临了，这几个随从却不睡觉，在屋子里叽叽喳喳的在密谋些什么。
月上柳梢头，清冷的寒夜将街上的百姓都冻得缩脖子跑回家，这几个日本人却推开窗子，跳了出来。
“李辉的房间就在前面。”一个留了一撮小胡子的小鬼子低声说道，“现在是我们关西武士会报仇的时候了”
“山田君，如果杀掉李辉，我们大日本帝国就可以恢复往日的荣光，是么？”一个身材较瘦的日本人压低了声音问道。
“当然，杀掉李辉，我们就可以恢复帝国的旗帜，或许我们还可以趁着中原大乱的时候发兵占领中原，一统天下”山田太郎的一番话说得众人热血沸腾，握紧了手中的太刀，看来大日本帝国的未来，就掌握在我们的手里了
前面的屋子里仍然亮着一盏烛光，本来众将领劝说李辉使用石灯照明，但是李辉认为“上有所好，下必从之。”为了杜绝贪腐之风，断然拒绝了众人的好意，依旧使用最简陋的油灯。
李辉正在屋子里看书，这本可不是《》，而是唐人的《碾玉观音》，旁边还摆着王阳明的《知行录》、普鲁士冯.卡伦爵士送给他的《圣经》原本。
“大哥，该睡觉了。”李莹推门进来，“这么晚了还不睡，今天素玉来了么？”
“来，来了。”李辉想要撒谎，不知怎的就却又说了实话，李莹看到他那副窘态，不由得抿嘴一笑，“大哥，来就来了嘛你怎么还脸红了？”
“也是，说的也对，来就来了，反正我们之间什么都没发生，真的，我没说谎。”李辉越描越黑，很不自然的搓搓手，“天晚了，丫头你还不回去睡觉？难不成……”
李莹看着李辉，粲然一笑，“大哥，你这张嘴，口没遮拦的胡说天色不早了，早点睡吧”她走到李辉面前，吐气如兰，“闭上眼睛。”
“哦，好”李辉听话的闭上双眼，李莹脸色一红，却费力的向前一步，一双柔若无骨的手搭在李辉的肩膀，嘴唇轻轻的在李辉的脸上印了一下。蓦地满面羞红，逃也似的快步走到门口。
“好，莹儿晚安，”李辉看着李莹走向门口的背影，摸摸刚才被亲吻的脸庞，嘿嘿一笑，看来这丫头还挺解风情的。准备熄灯睡觉。就在此时，门“吱呀”的被推开，一身紫衣的李莹被两个矮萝卜日本人用刀架着推到屋子里来。
“你地，李辉的是？”日本人扯下脸上的黑巾，向李辉询问。汉语水平很明显不过关，“我们，大日本关西武士会，来杀你”
李辉也是一哆嗦，他没想到敌人会这样悄无声息的混进自己的院落中，还被他们顺手劫持了李莹，但是面上却不能表现出任何的恐惧。他深呼吸一口气，回想起往日的血腥征战，再看看眼前这小场面，精神反倒平静下来，“什，什么关西武士会？我和你们有什么深仇大恨，却来杀我？”
“你，你这个恶棍，你率领你手下的东山军杀掉我们大日本人民，还把我们贩卖到南洋去做苦力，开垦我们的银矿，累死了我们很多同胞，你这个恶魔，今天我们大日本的侠客就要，替天行道，杀掉你为他们报仇”这个日本人似乎很激动的样子，连拿刀的手都在颤抖：“李辉，受死吧”
“呼”锋利的日本太刀从李辉的头顶直劈下来，李辉闪身躲过，却被太刀擦伤了肩膀，鲜血顿时汩汩流出来，李莹见状，惨叫一声，“大哥”
用刀架在李莹脖子上的那个鬼子色迷迷的大量李莹，“呦西，花姑娘的”将太刀又往李莹的脖子上压了一下，丝丝鲜血顺着刀刃流下来，“不要动，再动就流血了，不美了”
一旁，李辉和持刀的那个日本鬼子头，被唤做山田太郎的打在一起，李辉趁着他进攻的空隙，跳到床头，伸手拔出挂在床头的腰刀，和迎面劈过来的太刀撞在一起，他顿觉手臂发麻，握刀的手差点就松开。但是他咬了咬牙，顶住胳膊传来的剧痛，和山田太郎打斗在一起。桌子也遭了无妄之灾，书本都被扔在地上，一片狼藉。
山田太郎没有想到李辉竟然如此难缠，耳听得外面喊杀声阵阵，敌人的援兵看起来不远了，他情急之下，将长太刀对准掷出，从腰间抠出三把飞镖，“嗖嗖嗖”连射过去，封住李辉的上中下三路，看你怎么躲得过去
李辉躲过横飞而来的太刀，见敌人的手掏向腰间，心知这小鬼子要用暗器，一着急，错身钻到了桌子底下，正巧三只飞镖飞过来，李辉顺手抓起一本书，挡在胸前，正好挡住了飞来的下路飞镖，李辉一甩手，将手中的那本书扔出去，正好打在山田太郎的脸上，山田太郎伸手一划拉，将书本抓在手里，眼光一扫，咦？？
日本人的好色是举世闻名的，为了刺杀李辉，他们进行了为期数月的封闭式训练，在这几个月中，太郎都没有沾到女人的边，早就yu火焚身了，现在又被这春宫画一刺激，心头一阵邪火窜起，偷眼看看被当做人质的李莹，这个花姑娘不错，等会要好好的和她雅蠛蝶一下。
战场局势瞬息万变，就在山田太郎一走神的功夫，李辉已经从桌子底下钻出来，手中腰刀斜劈过来，山田下意识的横刀一拦，却感觉轻飘飘的没有任何效果，他猛然想起，长刀已经被他掷出，现在手里拿的是不到三寸的短刀
所谓一分长，一分强，李辉手中的五尺腰刀马上占据了上风，刀光闪闪，没有花架子，都是战场上真刀实枪学来的杀招，将山田太郎逼得毫无还手之力，一步步败退。
“太郎，我来帮你”话音未落，一个面貌姣好的日本女刺客窜到李辉面前，长刀一横，将李辉的腰刀架住，“李辉，我来杀你”
“去死吧，小鬼子”李辉不顾伤口疼痛，用尽全身力气，“嗨”一声断吼，将女刺客樱姬的长刀挑开，腰刀顺势一推，推至刀镡处，两人就在原地抗衡起来，樱姬虽然是女子，但是力气也是颇大，竟然不落下风
“樱姬，退下”山田这才喘了口气，“我们大日本武士从来讲究公平较量，今天我和李辉生死决战，不用你们来帮忙，如果谁敢插手，我就追杀他到海角天涯”
纵然李辉对日本人恨之入骨，心中也不由得赞了一声，是条汉子
“那个叫山田的，过来，咱们就好好比试比试”李辉撤力，看着一脸沮丧走开的樱姬，“你我二人公平比试，生死不论”
“哈伊”山田太郎一点头，扔下短太刀，李辉也扔下腰刀，两个人蹲好马步，虎视眈眈的看着对方，慢慢的积蓄力量。
“嗨”难的是山田，李辉眼见山田冲过来，猛的一拧腰胯，山田扑了个空，李辉趁机回手，抓住山田的腰带，猛的一扯，山田的腰带一下被大力扯断，哗啦一声衣服裤子都松脱掉地，只剩下兜裆布，饶是山田脸皮甚厚，不由得也是脸红，怪叫一声，向李辉冲过来
李辉顺手将山田的衣服抓在手里，见山田横冲过来，手一抖，山田的衣服“哗”的迎头罩上，山田本来想用刀劈开，却发现手头已经没有了刀，正在挣扎间，李辉的拳头雨点般砸下，白色的衣衫顿时被鲜血染红了。
门被一脚踹开，郑勇和司徒异率领大队士兵赶到，将屋子围得水泄不通，其他前来参与刺杀的日本人见事情败露，举起太刀切腹自杀。而一直用刀逼着李莹的小鬼子见此，就要对李莹下毒手，猛然间飞过几支弩箭，从他的左太阳穴穿过，将他整个人都钉在墙上。
而李辉还在狠揍那个山田太郎。
“王爷，下官来迟，还请王爷责罚”司徒异单膝点地，他们也不是有意为之，只是这些丫头有事没事总往李辉的屋子里钻，他们两人也就知趣的走开，没想到今晚竟然出了事
“擅离职守，等会再把你们军法从事”李辉精神松懈下来，这才感到胳膊上一阵阵绞痛传来，低头一看，右胳膊上被锋利的太刀划开一条一尺多长的口子，鲜血不停的往外冒，衣衫都已经被染红了。
“把他拉起来”被打得猪头也似的山田太郎被士兵们扯腿拽起来，伤口略微包扎一下之后，李辉开始连夜审讯，但是这个小鬼子并不像说真话，最后李辉动用了酷刑，这才让他开口。
原来自打天皇被杀致死后，日本人对大明的仇恨日复一日，却不敢公开反叛，于是这隐蔽的刺客组织——关西武士会便制定了刺杀李辉的计划，先派遣美女潜入今村秋野身边，利用他混入大明，之后再行谋杀。
“可惜了那个樱姬了”李辉看着地上倒着的几具尸体，“山田，你要是告诉我你们关西武士会还有多少人，在哪聚集，下一步有什么行动，我就可以考虑让你成为第二个今村秋野，你意下如何？”
“你杀了我吧天照大神的子民是不会向敌人投降的”山田梗着脖子，一脸英勇就义的模样。
“原来是这样，郑勇，虐待”
在一阵惨绝人寰的惨叫过后，山田终于屈服了，将自己所知的所有有关于关西武士会的事情一股脑的告诉李辉，还信誓旦旦的保证所说的都是真的。
“没有了？”李辉笑着问道。
“真的没有了，请你放了我”山田仰着脸，看着李辉，“我有一个要求。”
“说罢”