在萧震雷解决北洋第五镇靳云鹏残部的这几天时间里，孙文已经于1912年1月1日这一天在南京就任南京临时政府大总统一职，孙文提议由正在前线的萧震雷当任副总统并请17省代表举行选举通过，萧震雷得到电报之后回电婉言谢绝，说自己参加革命的资历尚浅，能力又不足，实在难以堪当大任，建议由鄂军都督府都督黎元洪当任副总统，武昌是首义之地，应当考虑到首义功臣们的情绪，予以尊重。
17省代表们看了萧震雷发来的电报之后都对萧震雷如此谦让的高风亮节的品德表示赞赏，这让萧震雷瞬间在革命党人眼中的形像高大起来，特别是在如今革命党和袁世凯方面都在竭力争权夺利的今天，萧震雷这种为了大局着想，放弃私利的高尚情操让很多革命党人、无党人士、立宪人士都认为萧震雷才是真心为了中国革命而没有私心的人，这些人的心渐渐向铁血救国党靠拢。
孙文、黄兴等人和17省代表们回电给萧震雷，高度赞扬了他的高风亮节，然后推举黎元洪为副总统。
接着各省代表团也联名致电黎元洪：“各省代表会于元月二日决议，选举临时副总统，即于三日上午十时开选举临时副总统大会。我公当选。除通告全国外，并由本会特派员赍各省代表签名书敬呈钧鉴！兼表欢迎。”
南京临时政府也致电黎元洪：“今日参议院选举副总统，经全数投票，举我公充任。共庆得人，谨为中华民国前途贺。”
1月1日晚十点。孙文就任临时大总统一职，宣告中华民国成立。并在大会上发表誓词：“倾覆满洲专制政府，巩固中华民国，图谋民生幸福。此国民之公意，文实遵之，以忠于国。为众服务。至专制政府既倒，国内无变乱，民国卓立于世界，为列邦公认，斯时文当解临时大总统之职。谨以此誓于国民。”
可是他拟定内阁名单之后，他就想起来自己把萧震雷和铁血救国党给忘了，他遇到了难题，按理说他是希望由黄兴来出任陆军总长兼参谋总长，毕竟黄兴的资历摆在这里。可现在革命军大部分兵权都掌握在萧震雷的手里，不仅如此，临时政府所在地也是萧震雷的地盘，黄兴手上并无兵权，如果让萧震雷任陆军总长兼参谋总长。恐怕黄兴心里会不舒服，其他同志也会有所不满，可如果让黄兴出任陆军总长兼参谋总长，军队会不会因此而不满？要知道现在革命尚未成功啊！
想来想去。孙文睡不着，将黄兴等人叫到自己的房间商量，就陆军总长的事情询问黄兴等人的意见。黄兴本人倒是不在乎陆军总长的位置，他道：“我于革命本身并无多少贡献。顶多就是多在外奔走了数年时间，相比萧寰宇率军北伐。光复神州沃土而言，我所做的实在太少，以我看，就任命萧震雷出任陆军总长一职吧？我愿为次长”。
同盟会其他人虽然有些不情愿，但当事人黄兴都这么说了，他们也不好再反对。于是孙文让人给萧震雷发去一封电报，任命他为陆 军总长。
萧震雷接到电令时正在与杨度拖时间，他看了电报之后让人回电说自己从军经历尚浅，指挥战斗的经历和经验都不足，而且年纪太轻，无法服众，电报上还说黄兴指挥过多次革命起义，在全国乃至全世界的军事界都享有崇高的威望，他推举黄兴为陆军总长，自己愿意为次长，否则不受！另外他推举萨镇冰任海军总长，程璧光为海军次长，汤芗铭为巡洋舰队司令，由于程璧光尚在国外，由汤芗铭暂领。
萧震雷的谦让再次赢得了革命党人和南方立宪人士们和各省代表们的高度赞扬，一回歉然没什么，别人也许猜测他是假惺惺作态，可连续两回谦让，这就不是嘉惺惺作态了，这是真正的尊重革命元老和前辈。
于是孙文当即任命黄兴为陆军总长，任命萧震雷为陆军次长兼参谋总长。内阁九部九为部长和次长当中，同盟会、铁血救国党和立宪人士各占了三分之一。
萧震雷看到回电之后当即任命蒋百里为参谋部次长，让他率卫队南下南京组建总参谋部。
萧震雷之所以不当这个陆军总长，是因为他早就知道南京临时政府没钱，在光复南京的时候，张人骏、张勋、铁良等人早就把官府的官银卷走，再加上同盟会林述庆等率先入城又进行了大肆收刮，临时政府哪里还有钱？临时政府新上任的薪水都发不下来，各省当然不可能把财权交出来，既然没有地方政府的财政支持，临时政府又没有存款，政府机构要运作起来就困难重重，毕竟谁都不可能高尚到把自己家钱拿出来倒贴。
既然政府官员们都发不出薪水，军队的军饷等费用就更加筹措不出来了，当任陆军部总长这个职位完全就是坐在火炉上，军队要军饷当然只找陆军总长，萧震雷才不会傻到坐在火炉上烤。
何况他早就知道跟同盟会合作，完全就靠不住，同盟会内部斗争激烈，太过复杂，与这些人合作不仅得不到任何好处，反而会被他们拖后腿，既然同盟会想当老大，萧震雷就决定让他们当老大去与袁世凯干架，等他们干不过袁世凯纷纷跑路之后，他再来收拾残局，到那时候再重新组建政府，就没有人再拖后腿说闲话了。
与杨度的谈判拖拖拉拉进行了三天后，萧震雷才一本正经的与他展开谈判。现在靳云鹏的第五镇已经彻底没了，在通往京城的路上已经没有能够足够抵挡联军的军队了，萧震雷甚至可以一直打到紫禁城，不过后勤上不允许，而且经过这一个多月高强度的作战，将士们都极为疲倦，必须要让部队休整，否则很容易出事。
1912年1月5日，萧震雷正式坐在了杨度的对面，杨度代表袁世凯与萧震雷展开谈判。
实际上，袁世凯一开始只是认为萧震雷是个不错的军人，并且他找到蔡乃煌当后台。蔡乃煌便将此事报告袁世凯之后，袁世凯派人对萧震雷做了专门的调查，认为萧震雷这个人值得培养，因此他还暗中对萧震雷的升迁之路进行了帮忙，可没想到到最后萧震雷竟然脱离了他的掌控，强大到他都要正面对待的地步，这不能不说是一种讽刺。
萧震雷提着茶壶分别在杨度和自己的茶杯到上开水，放下茶壶坐在杨度对面道：“杨先生，我看你也等得着急了，咱们就开始吧，首先就由我来抛砖引玉吧，我只有四个条件，第一，华东六省归我。名义上我还是受大总统领导。第二，袁公任大总统之后，如果进行全国军队整编，我华东六省要二十个师的番号。第三，海军方面已经投入我的麾下，不可能再交给袁公，如果袁公想要组建海军，让他自己想办法，不要打我的主意，我是不会交的。第四，皇帝必须退位，此后再无皇帝，就这四个条件。如果袁公答应，我立刻下令部队停止进攻，并尊袁公为中华民国唯一大总统，双方立即签署停战协议。”
杨度闻言脸色剧变，萧震雷提出的这四个条件前三个都超出了他的权限，而且在他看来，萧震雷的胃口太大了，如果满足萧震雷的条件，萧震雷就完全成了名副其实的东南王，日后必然成为尾大不掉之势。
杨度端起茶杯喝了几口水，平复着心里的情绪，才开口道：“萧总司令提出的这四个条件，只有第四个条件我可以答应，前三个条件都超出我的能够做出的权限，你看这样行不行，我需要向袁公请示一番，等袁公答复我之后，我再跟你详谈！”
萧震雷当然不会不答应，点头道：“好，杨先生如果有什么需要，可以随时开口！”
杨度离开之后立即带上随从去了济南洋人开的电报公司，在那儿向袁世凯发了一封电报，将萧震雷的条件一一进行了汇报，并且请袁世凯尽快做出决定，明确能够付出的底线代价。
在京城的袁世凯接到电报后看了萧震雷的腰间气得差点吐血，直骂萧震雷是狼羔子，不但不知道感恩，还反过来狠咬一口。
气归气，但这个决定还得尽快做出来并且给杨度发去电报，因为袁世凯也撑不住了，跟武昌革命党的交战已经把他的北洋六镇的财政和弹药储备都打空了，再也没有余力跟萧震雷继续打下去，而且萧震雷的嫡系军队所表现出来的战斗力实在让他心有余悸，尽管在山西他还有第六镇，但是第六镇也才刚刚与阎锡山等人干了一仗，实力有所下降，最主要的是弹药储备已经严重不足，打不下去了，如果让萧震雷的军队打到京城，他做大总统的美梦只怕要破碎，是想来去，他还是做出了最后决定，并给杨度发电报说了自己的底线。