一亿年后，天第六界大改，八荒六合四海焕然一新，天地有了新秩序，六界有了新变革，并且六界也得到了重新划分。原本的四片大陆，也因玄武神君的入魔，合为一整片大陆，名唤神州大陆。
原本处于云层之上的九十九重天宫，现已成为新世界的一个标志，而并非天宫神界唯一存在。还是云层之上，皆为天空世界，也称天上世界，故称之为天界。
地府原本就是神界与鬼界联合，现已自成一界，名为地府世界，故称其为地界。
而其他世界依旧不改，天界依然统管其余五界。天界之主，依然是六界共主，也称天地共主。
除天地两界，其余四世界，生灵肉体生命皆有限度，那些生灵肉体消亡之后，神魂皆归地府，按其生前功过对错，安排神职鬼差，或是再次进入六道轮回，忘却一切，重新修行，亦或是循环往复，永世轮回。
如此，天界和地界，也都新增了不少神仙鬼差。
天宫之中就有太白金星、四海龙王、风雨雷电等数千万神仙。而地府之中便有了十殿阎罗、四大判官、黑白无常、牛头马面、孟婆等数千万鬼王鬼差。
六界虽有新气象，却也有心劫难。
玄武神君所造那些生灵，东华帝君，他们一众创世之神，观察了两万年，发现并没有什么异常，于是破除封印，就将其放出。可后来因为玄武神君心中不忿不满，化身为魔，后在黑龙协助之下，一统妖魔两界，并且自封无上魔君，成为女娲等神劲敌。
灵宝天尊刚开始随玄武神君来到扶桑大陆之时，电兽玄武神君体内黑龙魔气影响，体内浊气变无限放大，赫然离体，化身为通天，并承下灵宝天尊所有神法，灵宝天尊本身自此陷入昏迷，通天将灵宝天尊带回碧游宫，并将其封印于宫中，然后自命为截教新任教主，故称通天教主。
这也就是为何当初，灵宝天尊刚到扶桑大陆不到一日，便回了碧游宫，这也就是为何当初，灵宝天尊回碧游宫之时，并未去向东华帝君他们言明之真实缘由了。
后来，也就是在东华帝君他们破除封印放出那些森林不久之后，灵宝天尊的最后一次神魂飞入到了创世众神梦中，并将事情原委告知于他们，他们也方才明白，为何会发生如此变故？
原来玄武神君早已心怀不轨，并且早已被体内魔气所控。只是当他们得知这一情况之时，已经为时已晚，再也无可挽回。
没过多久，也就是在东华帝君等神得知真情之时，通天教主将玄武神君带入天外天，放出黑龙。
之后东华帝君等神及时赶往天外天，并联合天外天众神，与黑龙和玄武神君大战，后玄武神君大败，黑龙则再次被削弱其大半神力，如今黑龙，实力早已大不如前，甚至连玄武神君这等，都无法战胜，加之这次大战，有众大神助力，黑龙神石与意志尽数被毁，已经彻底沦为一头傻龙。
玄武神君又通过天外天特殊灵气，将黑龙融于自身体内，彻底化身为魔，之后吸纳天外天所有灵气，并将天外天世界彻底毁灭。
玄武神君与众神抗衡不敌，逃出天外天，并且运用无上魔功征服了妖魔两界所有生灵，并将其带回到扶桑大陆。玄武神君在扶桑大陆设下了极为强大的保护结界。
就算东华帝君他们神法再怎么强大，也无法在短时间内功课扶桑大陆，这便给了他们调息之机，休养生息之法。何况他也知道，如今东华帝君他们也并没有那个精力来管他们这些妖魔。
之后，玄武神君便开始做起了自己的无上魔君，他现在已经征服妖魔两界，将来他还想一统六界，就像是东华帝君、西王母和女娲他们那般，既然那些人可以掌管天下六界，那他无上魔君一样可以，甚至要比他们做得更好，将来有朝一日，他要一统天下万灵，彻底掌管这八荒六合四海。
而事实也确实如无上魔君所料，这创世诸神根本没有精力来与他们这些妖魔争斗。天外天世界被毁，天地万界陷入动荡，万界生灵也借此开始发动战乱，他们都希望自己能够一统万界，能像昔日天外天世界那般辉煌。
自此，东华帝君以西王母是卸任天地共主，他们也带着太乙天尊、陆压道人和天宫大半神兵神将，开始征战天下八荒，维护世间和平。
而无上魔君所造出的那些生灵，如今也都有了自己的名号。
其中最为有名的就是十二祖巫。这十二祖巫分别为:金之祖巫——蓐收、木之祖巫——句芒、水之祖巫——共工、火之祖巫——祝融、风之祖巫——寒凉、雨之祖巫——玄冥、雷之祖巫——强良、电之祖巫——白闪、空间速度之祖巫——帝江、时间之祖巫——烛九阴、天气之祖巫——奢比尸、土之祖巫——黄沙。
十二祖巫魔力无穷，乃无上魔君坐下最得力助手。除开这些，在这些生灵当中，剩下的便是魔军与魔兽。
然而，为了面对这些妖魔界邪灵，创世诸神也都炼制出了各种神器法宝，它们就是先天至宝、先天法宝与先天灵宝，再加上混沌至宝与天外至宝的威力，也算是能够与其抗衡了。
而这些神器法宝具体名号也都极为独特。他们分别是:
太极图、盘古幡、诛仙四剑、三生石、混沌钟、混沌珠、八卦炉、造化玉蝶、玲珑宝塔（锁妖塔）、东皇钟、乾坤神剑（后世为轩辕剑）、天眼（阴阳眼），此为十二大大先天至宝。
打神鞭、定海神针、镇妖瓶、招妖幡、缚妖索、捆仙绳、紫金葫芦、芭蕉扇、七星鞭、穿云弓（后为射日神弓）、流星箭（后为射日神箭），此为十二大先天法宝。
五行旗（中央戊己杏黄旗、东方青莲宝色旗、南方离地焰光旗、西方素色云界旗、北方玄元控水旗）、乾坤鼎（后世为神农鼎）、十二品莲台、山河社稷图、河图洛书、七宝妙树、天书（封神榜）、地书、冥书（生死薄）、红绣球、昆仑镜、龙凤斩，此为先天十二灵宝。
还有之前盘古劈开混沌所使用的开天神斧，幻化成三清法宝的创世青莲这两件混沌至宝，白矖所拥有的法器玲珑玉笛、仙音所拥有的法器九天琵琶两件先天至宝。
先天至宝、先天神宝与先天法宝，以及后来创世之神所炼制的武器与各种器具，皆称之为上古神器与先天法器。创世之神以外的神仙所炼制出的武器器具，是为普通神器，抑或是普通法宝。
自天外天大战后，玄武神君收复黑龙，回归扶桑大陆，通天再次归入鸿钧门下。
东华帝君与西王母，各自带走了几件神器，去征战八荒。
而那些所剩神器，东华帝君与西王母让鸿钧道人进行合理分配。
东华帝君于西王母他们带走的神器法宝是东皇钟、乾坤神剑、天眼、穿云弓、流星箭、昆仑镜与开天斧。
天宫地府，众多神仙，也都各有有所事。
之后，青龙神君、朱雀玄女、女娲、鸿钧道人等众神将四片大陆合并为一片大陆，名为神州大陆，而原先的扶桑大陆，就是现在的妖魔两界。
而在凡间，经过数万年的风雨飘摇，一切犹如刚刚开始，生灵万物恰似焕然一新。
凡间有一天生圣人，名为伏羲，因为天生仁德，又身具慈善妙法，故早已成为人间统治者，带领人界万灵进入到了一个崭新时代。那便是从自由的无业散居时代，进入到有秩序有法则的聚居农耕时代。
之后女娲便从自己神魂之中，分离除三魂七魄来，注入一条灵蛇与一只神龟体内，并将其结合化为己身，下凡帮助伏羲治理人界天下。
可不曾料到，女娲将蛇龟所化之身投于凡间途中时，却被匆匆赶来的天蓬星君给撞离了女娲预定轨道，导致时空错乱，结果那副女娲之身，也不慎掉入昆仑山中，化作一株灵草，生长于大地之上，而此时的伏羲刚刚坐上人间至尊之位。
而这时空一旦错乱，便无可挽回，只有任其发展。在不得已的情况下，青龙神君他们也就只好请来鸿钧道祖相助，将天上的时间放慢了前进的速度，同时又将人界时间倒回去了几十年，然后将这之后所发生之事，解尽数抹去，使人间从伏羲登上至尊只为那一刻重新开始。
如此，也就有了天上一日，人间一年之说。
突发如此变故，女娲也就只好亲身下凡，于是她将天地共主之位传于朱雀玄女。
一切安排妥当之后，女娲便自封神法于体内，落于昆仑山，那株灵草生长处，你将自身的神魂与肉体，完全融入到先前所制造的身体当中，随之也成为了那株灵草，算是下凡历练。
而且，鸿钧道祖也告诉青龙神君和朱雀玄女，这是女娲该历最后一场大劫数，此次大劫之后，他便毁再次为这个世间立下滔天大功，此功劳无人能及，这也是命命中该有的劫数。
说完这一切之后，鸿钧便带着老君、元始天尊和通天教主，以及元始天尊座下十二仙人，去跟随东皇太一征战八荒了降服六合四海了。
天蓬星君犯下如此大错，又因为她是紫薇大帝坐下大神，故而紫薇大帝与鸿钧道祖、青龙玄女、朱雀玄女共同商议，给了他一个极为公正严明的处罚。
罚他去掌管天河，守护若水。并且命他在五百年内，招集十万新兵，在五百年将这十万新兵，训练成极为精锐的天河水兵，且不能有外力相助。
朱雀玄女登上天地共主之位以后，便敕封伏羲为人皇，其父燧人为天皇，降世女娲为地皇，且为大地之母，回归之后仍为天地共主，永享后世万代供奉。
如今东华帝君不在，天界便是由朱雀玄女、青龙神君与鸿钧道祖共同做主，然鸿钧道祖身兼统领万道之责，且又刚刚前去给东华帝君助战了。
故而四界之事，实为青龙神君与朱雀玄女做主，不过，朱雀玄女既然是如今的天地共主，那自然是要以她为主，青龙神君为辅。
一切皆已就绪，朱雀玄女将天宫暂且交由紫微大帝掌管打理。
之后，朱雀玄女便与青龙神君一起，去人间世界的昆仑山，同伏羲一起迎接大地之母诞生。