1993年，王立军升任铁岭公安局副局长，主管刑侦工作。他有个口号：“跟我上”。他甚至要求法医在出事现场时，不许戴口罩和手套，理由是会“影响嗅觉和触觉”。他本人曾经亲自跳进齐腰深的水塘，抱出一具腐烂的尸体。
王立军敢于打大仗，打别人不敢打的硬仗。他震慑着犯罪分子，被人们称为“东北虎的铁掌”。1997年，他被国际司法组织授予“打击有组织犯罪”和“犯罪心理学”成就奖。
但是，他的成功引起一些人的嫉妒。老资格的副局长王海洲就是不服，他大王立军15岁，在王立军还是普通民警时，已经是副局长了。
1999年3月，一名人力车夫状告王立军当街动手打人。最后，法院裁定：驳回原告的诉讼要求，王立军无罪。“虽赢犹输”，这是王立军对自己这场官司的评价。4个月后，王立军又被告上法庭，这次的罪名是刑讯*供致人死命。控告信甚至邮到了中纪委副书记手中。铁岭市纪委与辽宁省公安厅纪委组成联合调查组，对王立军实施审查。结果是，控告信所反映的问题全部失实。当年9月30日，已调任市司法局局长的王海洲被逮捕。对他的指控是：王立军遭遇的数次诬告，他都是幕后推手。
还有人在社会上到处散布谣言：“只顾打黑的王立军其实非常可怜，妻子、女儿被黑社会杀害、剥皮！并把杀害场面拍成录像寄给他本人……只有一把手枪和一身防弹衣与他形影不离。”这时候，他一家人的确承受了很大压力。但是王立军还是坚挺了过来，他相信法律，相信组织。最后，王海洲被判处有期徒刑两年，缓刑三年。
赢了官司，更加给王立军带来振奋的情绪。他虽然前后四次被调查、两次被立案侦查，甚至连公安部对授予他全国一级英模称号的审批暂缓了，但是在这些调查结束之后立即给予了他。
1999年11月16日，以王立军为原型的电视连续剧《铁血警魂》在上海电视台播出后，广大观众对他产生了浓厚的兴趣，非常想知道，这些天里王立军又立下了哪些战功。
也就是该剧开播的那一天，王立军率领刑警们，侦破了一起杀人案。
10日下午4点许，刑警队接到市种畜场秦家岗分场居民张伟新报案：其妻何亚荣被杀死在家中二楼的客厅里。王立军亲自赶往案发现场，指挥侦察员开展侦破工作。王立军根据被害人家中财物未遭洗劫，门窗也未被撬的情况，作出判断：作案歹徒与被害人相识，且系近邻。
侦察员经过周密调查，发现被害人邻居王海军有重大作案嫌疑，遂将其抓获。王海军交待，他系何亚荣的邻居，10日下午，见何家的房门开着，何的丈夫又不在家，邪念顿起，便来到何的卧室，要求与其媾合，结果遭到何的反抗。王海军丧心病狂地用砖头猛砸其头部，并用剪刀将其刺死。
当然最为人津津乐道的是，王立军1994年在铁岭的打黑行动。可以说，王立军是铁岭扫黑，一战成名。
这一年年，他亲自出马，指挥了惊天动地的“9.19”扫黑行动。
铁岭市以杨俊富、张洪俊、肖建军、何晶为首的四大流氓恶势力团伙，豢养了一批打手，划区割据，横行乡里，鱼肉百姓。这些黑社会势力渗透到了国家机关内部，有了保护伞，他们更加肆无忌惮。
1994年9月19日，“扫黑行动”开始。行动前夕，王立军写好遗书，交给战友。铁岭市委和市局确定了“秘抓秘捕”的行动方针，抓捕名单只有市委书记、公安局长和副局长王立军三人知道。然而才刚刚秘密抓捕了张洪俊，王立军便日夜不得安宁了。他走到哪儿，电话和人就跟到哪儿，都是替嫌犯说情的。
一天，一位社会名流来访，临走时说他有几本书明天让人送来。第二天，果真有人送书来了，王立军打开纸包一看，全是百元面额的现金，足有几十捆。那人转身要走，王立军把他喝住：“你立即把钱拿走，不然我把你也抓起来！”
软的不行来硬的，一个团伙的爪牙给王立军打来电话，威胁说：“几十万你不要，那命还要不要？”王立军义正辞严地说：“我王立军从当警察那天起，就没把自个儿百八十斤当回事！你要让我抓住，我肯定干掉你！”
见王立军软硬不吃，黑社会头目以20万元的巨款到本溪雇来杀手，准备伏击并炸毁王立军的汽车。那天深夜，王立军驾车从市郊“打黑”指挥部返回市内，在体育场转弯处，马路对面突然有人向他开枪射击，王立军即刻停车举枪还击。交火几梭子后，杀手自感枪法不如王立军，仓惶逃走。
当王立军赶去抓捕何晶时，他已得知风声逃逸了，一个月后才潜回住地。王立军得到情报后，为防止走漏风声，只带了一名警员，开着其他城市牌照的车赶到几十公里外何晶所开的奥林公司进行追捕。在楼下，王立军一眼就认出了何晶的“标致”505轿车。而此时，在楼上的何晶也发现了这辆陌生的汽车，他预感不妙，先让两名保镖上车发动引擎，随后自己突然从楼里冲出钻进车里，开足马力迅速逃跑。王立军立即发动车子死死地咬住他。这时，一辆拖拉机挡住了何晶的车，王立军知道机会来了，跳出车子追了上去。王立军先向何晶的两名保镖腿部连续打了两枪，最终用枪封住二人，制服他们。
就在两名保镖被制服的时候，何晶闪到王立军的身后，一把将其握抢的手狠狠抓住。两人在僵持中，王立军把枪倒到左手，狠砸何晶头部，一下就打开了花。由于用力过大，枪脱手了，何晶趁势向王立军面部猛打几拳。王立军的右腮里侧被牙齿完全硌烂，眼角开裂。何晶双手掐住王立军的脖子压在车上，沉重的窒息，让王立军第一次感觉离死神如此之近。也许自知占了上风而求胜心切，也许是王立军满脸鲜血的影响，就在王立军逐渐丧失意识的时刻，何晶的双手突然打滑松脱。王立军抓住这一线生机，瞬间做了一个翻身动作，将何晶扣在身下，将之生擒。
战友们赶到后，王立军把何晶的下颌端过来仔细看了一下。“当时我有两种想法，第一我终于把你拿下了。第二我心里在想，你确实很厉害。”王立军事后回忆说。
在抓捕何晶之前，杨俊富已在银州大酒店落网；3个月后，肖建军也被捉拿归案。“9.19扫黑大行动”取得了决定性的胜利，抓获了主要案犯及团伙成员110人，其中7人被判处死刑，缴获赃款200余万元。而涉案的19名国家机关内部的蠹虫，也被一网打尽。
一役让王立军威震全国警界，他被评为“全国十大杰出民警”，时任铁岭市长的李士文称他是“铁岭的镇市之宝”。
在铁岭任职近二十年，王立军从一名普通民警成为派出所所长、公安局局长，他和他的战友一共把800多名犯罪分子送上了刑场。这让王立军成为黑恶势力的眼中钉，黑社会曾出价500万买其人头。王立军身上贯通伤、骨折等伤有20多处，是中国公安界仅有的几位还活着的一级英模之一。最严重的一次，他头部受伤昏迷了10多天，单位把花圈悼词都准备好了。他的家人也饱受恐吓，甚至有传言说他“早年因为打黑，妻子、女儿被黑社会杀害，并把杀害场面拍成录像寄给他本人”。这虽然纯属捏造，但也反映了犯罪分子对王立军的仇恨。
王立军不仅是打黑除恶的急先锋，还是一个足智多谋、沉着应变的指挥员。2002年冬天，王立军带领他的战友来到一个他并不直接管辖的城市，抓获了十多名黑社会成员。就在他们对这些人进行突审的时候，王立军突然接到上级的情报，这个团伙的另外20余名成员，携带冲锋枪，正急速赶往他们驻扎的酒店。王立军当机立断，安排其他战友押送嫌犯先走，这时，那些歹徒已经到了酒店的后门，跳下车准备向酒店扑来。王立军带着他的助手，神情自若地从酒店四楼下到大堂，在咖啡厅旁的一张桌子旁坐了下来。
其实，这伙歹徒的内线已经提前赶到了酒店，为他们通风报信。王立军一到咖啡厅就意识到服务员是歹徒的同伙，他与助手交换了一个眼神，随后说道，“楼上20多人准备的怎么样了？楼的两侧要注意，防止歹徒冲上去，要做到一个人对一个人。”助手回答：“没问题。”王立军这样说，就是故意让歹徒知道酒店里已经做好了埋伏。王立军听到那个服务员往外打电话：“先不要往里冲，里面有准备！”窗外，正准备从马路对面冲过来的歹徒，被人推了回去。他感觉到与助手演的空城计奏效了，于是继续说到：“你马上挂一个电话，看那20多人到了没有，还有多远距离？为什么这么慢？”这一招更奏效，马路对面的歹徒立即上车逃跑。