颛顼继承人皇之位，被众尊为黑帝，统领人族，有轩辕黄帝打下的基础，又有截教弟子鼎力相助，再加上颛顼本身才能，人族稳步发展前进，越发兴盛起来，如果一直这样保持下去，颛顼绝对会成为一代明君，即使比不上神农，轩辕这些证得人皇果位皇者，也是人族少有大贤。只是随着时间推移，颛顼变得野心勃勃起来，一心做出超越轩辕黄帝之功绩，所以他把主意打在大巫九凤带领的九黎部落上，轩辕黄帝在位是一直没能收服这支部落，若是自己将其收服或铲除，那么至少有这方面胜过轩辕黄帝。
颛顼找来多宝道人商量此时，顿时把多宝道人吓了一跳，自从经历上次刑天的打击之后，多宝实在不愿再去招惹巫族，连忙劝导颛顼放弃此事，只是颛顼被超越轩辕黄帝的功绩迷昏了头，一意孤行，非做不可，多宝只得答应下来，帮忙想办法，不过多宝道人特别声明不会亲自动手，一切还要靠颛顼自己。
多宝和颛顼经过多番商议，总算拿出一个计划来，要想彻底铲除九黎，首先要对付九凤，颛顼以人皇身份向九凤求亲，声明原与九黎和平共处，此时九黎部落之人在深山老林过得甚是艰难，而且巫族驻地那边的资源也越来越少，若是能与人皇结亲，那么这一切都很得到改善，为了巫族，为了九黎，九凤大巫想也没想就答应下来，只是她哪里知道自己已走进多宝和颛顼设下的陷井。
多宝道人知道九凤答应婚事之后，便去了北俱卢洲的妖族驻地，与白泽，鬼车，盘王等几个妖族高层秘谈一番之后，从盘王手中拿到了一幅以蛊虫尸体秘制的毒药，巫妖之间的仇恨由来已久，能够打击巫族的机会妖族从来不会放过，更何况这次不用自己出手。
成亲当日九凤喝下毒酒，全身酸软无力，十成功力发挥不出一成，又被颛顼提前埋伏好的众多人族高手围攻，形势岌岌可危，就在九凤即将丧命之际，一直追随九凤的两个大巫忽然全身带伤的杀了过来，救缓九凤，原来两位大巫也身中剧毒，被人围攻，自知绝无幸存可能，便决定拼上性命设法救出九凤，两名大巫冲到围攻九凤的人族高手之中同时自爆，将包围圈破开一个缺口，九凤趁机冲了出去，然后化为九头凤凰形态的大巫真身疾速向巫族驻地飞去，颛顼等人追之不及，最终被九凤逃掉。
九凤勉强飞回南部瞻洲的巫族驻地便昏了过去，祖巫祝融亲自出手，费尽心力才将九凤体内的蛊毒焚化掉，将九凤救回，九凤醒来之后将自己的遭遇一说，顿时整个巫族群情激愤，一个个吵着要去找颛顼算帐，不过被祝融阻止了，没办法势比人强，现在己经不是当初巫妖称霸天地的时代了，人族实力已经超过巫族，所以巫族受了委屈也只能忍着。
九凤回到巫族驻地之后，祝融原本不打算再让她出去的，巫族的顶级大巫已经没几个了，除了后羿就属九凤三五个大巫实力最强，而后羿偏偏因为射杀九只金乌而被整个妖族惦记，不敢让后羿离开驻地，生怕被妖族暗害了，九凤这类大巫在巫族之中更显珍贵，实在损失不得。只是祝融忽略了女人任性，几天后的一个夜晚，九凤违反祝融的禁令，偷偷离开了驻地。
双翅扇动，九凤在漆黑的夜空飞翔，脑中想起颛顼丑恶的嘴脸，想起为救自已而死的两位大巫，仇恨之火在九凤胸中燃烧，越烧越旺，纵然倾四海之水也不能将之熄灭，心中狂吼着:我要报仇。九凤虽然恨意滔天，但还没有因此失去理智，她明白自己现在去找颛顼绝对会被多宝等人斩杀，而且颛顼身为人皇，因果牵扯太大，若真的杀了他，一定会给巫族招来大难。在巫族驻地的几天，九凤一直思考报仇之事，总算想到了一个办法，既然不能亲自出手，那就从人族内部做手脚，她身为巫族大巫，有诸多限制，但九黎部落中的人却没有，因为说到底他们也是人族，只要运用好这支人马，绝对能给颛顼带来大麻烦，至于之后会怎样九凤也顾不得了。
九凤回到九黎之后，立即招来九黎高层议事，将自己被颛顼算计之事道出，并宣布与颛顼开战。九凤这些年领导九黎发展，深受众人爱戴，开战之议一出，立刻引起整个九黎的支持，在九凤的安排下，分成十几支队伍，借山林地势之利，频频出击，偷袭人族部落，造成巨大伤亡，整个人族人心惶惶，颛顼几次派兵围剿，只是九黎人马甚是警觉，一发现不对立即撤退进入山林之中，颛顼的兵马也曾追入山林，只是随后便就九黎借地利优势袭击，损失惨重，吃了几次败仗也就不敢追了。
颛顼被九黎弄得万分头痛，去找多宝道人救助，却遭到拒绝，因为修行之人不能随便对普通人出手，否则杀戮过重，业力缠身，那就麻烦了。不久之后，颛顼毒害九凤之事传了出来，而且特别出明九黎袭击人族部落乃是为九凤报仇，讨回公道，如此一来颛顼威望大跌，整个人族都对他不满起来，质疑他的领导能力，无奈之下，颛顼只得退去人皇之位，在东海金鳌岛附近一座仙岛隐居，托庇于截教，从此以后潜心修炼，追求仙道。而多宝道人也够义气，没有因为颛顼失去利用价值而将他置之不理，还专门向通天教之求得一对先天宝剑腾空，画影送他，另外还有一套功法，可谓仁至义尽。
颛顼被逼退位之后九凤的怒火消了许多便不再让人袭击人族部落，只是仇恨已经结下了，在之后的日子里，九黎其他人族部落冲不断，时有争斗，彼此伤亡惨重，仇恨越积越多，之后几位人皇对他毫无办法，而且因为颛顼毒害九凤之事多宝也参与其中，人族开始对截教门下不待见起来，而截教之人也不愿忍气吞声，纷纷返回金鳌岛，很长一段时间，人族发展的兴盛之势被打断，直到尧帝时期才得以改善。
尧出生时霞光万丈，紫气弥漫，其异像立刻被圣人发觉，五圣立刻明白拥有人皇紫气之人出世了，五圣商议一番之后，决定由接引圣人的弟子药师道人负责教导尧，受西方教众生平等教义影响，尧帝一开始就对九黎表现出自已善意，经过努力最终得到九黎认可，与其它人族部落和平共处，自此人族再次进入一个高速发展时期，尧帝也因此威望大增，受人族爱戴。