雏田与晶臧一组，雏田发现了一股奇怪的查克拉，二人就追踪过去查看。
鸣人站在河边发呆，小樱落在树上，发现是鸣人，才松了口气。这里雾气弥漫，小樱跳下来，鸣人疑惑，“小樱，你没和阿雪在一起吗？”小樱嗯了一声，“我担心阿玛鲁，让阿雪回去照顾他了。你在做什么，找到村民了吗？”鸣人指了指前面的雾中的建筑物，小樱吃惊，“那是什么？”鸣人道，“应该是神农大叔所说的遗迹吧。”
小樱和鸣人来到遗址这边，雾气中，阿玛鲁走过来。鸣人吃惊，“阿玛鲁，你怎么会在这里？”小樱也奇怪，“阿雪呢？她没和你在一起吗？”阿玛鲁抬头，眼睛变成红色，“吾乃零尾！世间充满战乱，人心陷入黑暗时，吾将复活！”小樱道，“你在说什么啊？你把阿雪怎么样了？”鸣人也感觉到危险，“阿玛鲁，你到底怎么了？”零尾道，“吾吞食人心黑暗而生，并无限成长。为让此世被黑暗所支配！”
海边，佐井依然在跟空忍们缠斗，不断有空忍被佐井击败。佐井已经换乘了猫头鹰，还有几个空忍在跟佐井纠缠。佐井拔刀闪击，又干掉一个空忍。剩下的一个空忍在后面猛烈开火，把佐井追到乱窜。佐井叫苦，“鹿丸，我拖延时间也到了极限。”
卡卡西在下面看出来，“佐井那边不行了，查克拉到极限了。幸好敌人只是以小队方式拦击他，如果出动大部队，佐井早就顶不住了。”鹿丸拦住卡卡西，“老师你留在这里，时间也差不多了。其余的由我来接手。”鹿丸跑出去，发射出信号。佐井松了口气，“我的任务终于完成了！”
佐井低空掠过，“接下来交给你了。”鹿丸道，“虽然很麻烦，但也没办法。”佐井落地后，迅速离开。鹿丸迎敌，敌机背对阳光，向鹿丸直扑下来，这是夺取视野的战术。可惜这次的对手是鹿丸，“真是训练有素啊！但这点对你很致命。”鹿丸结印，“忍法，影缚之术！”影子伸展过来，将空忍直接拖入了海中。空忍大惊失色，惊叫连连。鹿丸干掉了这个空忍，“差不多该反击了，拜托你了，四人组的第四位帅男！”
佐助穿行雨林，剑下多是毒蛇怪兽的尸体。异样的查克拉，佐助也感觉到了。
遗址前，阿玛鲁化身零尾，如同蛇一样的奇怪生物，跟电影中的异形非常相似，头上戴着零字的白色面具，体型巨大如一辆双层巴士。零尾运用身体组成的触手攻击目标，这跟阿雪的通灵兽白色巨蜥的攻击方式很像。之前，零尾已经把阿雪打晕了，扔在村子里。小樱义愤填膺，“开什么玩笑！”大叫着挥舞重拳打过来，零尾伸出触手般的手臂，轻易就把小樱打飞出去。小樱晕了过去，鸣人大怒，“混账东西！”
零尾变出许多触手，把鸣人团团卷住。九尾察觉到异样的查克拉，在水牢内咆哮起来。零尾道，“你还真是养了个有趣的怪物啊！为什么不使用这份力量呢？你所隐藏的这份力量，我想得到它。”零尾加大了力度，鸣人发出惨叫。
但鸣人不肯借用九尾的力量，“不行，这份力量伤害过小樱，伤害过晶臧，伤害过好－色仙人，伤害过大家！绝对不能依靠！”零尾**，“将邪恶的力量呈现在吾前，将你心中的黑暗！”鸣人大吼，“我要用自己的力量来拯救阿玛鲁！”
零尾冷笑，“这是不可能的，你应该比谁都清楚吧！”鸣人吃惊，“什么？”零尾笑道，“是叫佐助吗？你连那家伙内心潜藏的黑暗都不能照亮，你是无法拯救任何人的。”零尾挥舞触手开始虐待鸣人，鸣人终于暴走了，红色的查克拉气流升起来，挣开了束缚，直接开启了3尾模式。
鸣人怒吼着，咆哮着。零尾道，“不错，就是这样。愤怒，更多的愤怒！”然而，鸣人的力量增长了，两条红色尾巴挥舞过去，把零尾揍得满地爪牙。零尾立即反击了，许多更细更坚固的触手突然射出来，击穿了鸣人的身体。
零尾嘲笑，“你什么也做不到。”鸣人愤怒，开启了四尾模式，变成了小型的九尾狐狸。再次摧毁触手，上前暴打零尾。怪兽争霸战开始了，零尾的触手不断地被狐狸摧毁，狐狸的红色巨爪终于抓住了零尾的本体。愤怒的狐狸，把零尾撕扯成两段。但是零尾的两截身体却奇迹般地重新组合在一起，恢复了原貌。自来也赠送的护身符落在地上，晶臧也赶到了，他射出了金锁，缠住了鸣人。
晶臧用力拉扯，用自己的查克拉压制鸣人。鸣人终于感受到了，开始恢复本性。等了一会儿，鸣人恢复正常，“晶臧！”晶臧松了口气，解除了忍术，“总算没事了！”晶臧捡起地上的护身符，其实就是压制鸣人九尾能力的符咒，递给鸣人，“把它收好吧。”鸣人接过来，“是好－色仙人……对了，我要用我自己的力量，带他回来。”
晶臧奇怪，“鸣人，这个怪物是从哪来跑出来的？怎么好像异形？”鸣人道，“什么异形？这是阿玛鲁，怪物自称叫做零尾。”晶臧无语了，“原来，尾兽里面还有一个零尾啊！可是鬼鲛不是号称零尾吗？难道阿玛鲁是零尾人柱力？”
零尾不动了，鸣人大喊，“阿玛鲁，快醒醒！”随后，鸣人发动了口遁，“你难道不是神农大叔的弟子吗？弟子就要遵循老师的教导！你难道不想让神农大叔称赞你做得很好吗？”口遁生效，阿玛鲁压制住了零尾，驱散黑暗，变回了人形。
晶臧松了口气，“看来不用使用八门金锁了。鸣人的口遁果然无敌啊！”鸣人问道，“晶臧，你怎么来了？雏田呢？”晶臧道，“我察觉这里不对，就急忙赶来了。雏田还在寻找那股奇异的查克拉。”
某处，神农自言自语，“鸣人先不说，连阿玛鲁内心的黑暗都消失了。足够启动了，只要能将世界卷入战争，内心的黑暗应该要多少有多少。”神农在地板上画下奇怪的符号，机关启动。神农大喊，“启动吧，安克尔－班迪安！现在正是歼灭忍者五大国，复兴空之国的最佳时机！”
外面，阿玛鲁很激动，鸣人扶起小樱，“阿玛鲁，你没事吧？做得很好，终于回来了。大概神农大叔也会这么说吧。”阿玛鲁擦了一下眼泪，什么也没说。晶臧道，“阿玛鲁，回头我帮你检查一下，看看你身上的封印。如果没有错的话，你应该也是一个人柱力。”阿玛鲁疑惑，“人柱力？”晶臧点头，把人柱力的秘密讲给阿玛鲁听。阿玛鲁这才知道自己有多么危险。
另一边，鸣人怀里的小樱也醒了。鸣人耍酷，“小樱，没事吧？”小樱回过神，发现鸣人的手摸在自己的臀部。小樱立即发飙，大吼一声，一记重拳打出，鸣人飞了出去。阿玛鲁闭上眼睛，晶臧摇头，“你真是挨打不够！”鸣人头上冒烟，“为什么一上来就打我？”小樱怒道，“因为你突然把脸凑上来，还用手乱摸！”
小樱问道，“晶臧，刚才到底怎么了？”晶臧道，“具体说的话，我也太清楚。就是巨兽大战后，他们都恢复了本性。”鸣人笑道，“总之，这件事情告一段落了。”话音刚落，地下传来巨大轰鸣声。
晶臧感觉不大好，鸣人道，“怎么了？”小樱怒道，“这不是什么都没解决吗？说不定雏田、阿雪和其他村民都在那里。”鸣人道，“小樱，现在你马上带阿玛鲁回村子去。这里交给我和晶臧处理。”晶臧道，“雏田、阿雪还有村民，我们一定会找到的。”小樱表示明白，“我会带着增援部队过来的。”小樱招呼阿玛鲁撤退，阿玛鲁有些犹豫。小樱急道，“怎么了？快来我背上。快一点，阿玛鲁！”
阿玛鲁拒绝了，“我要遵循神农老师的道路，我想把大家带回来。”晶臧道，“但是就算你勉强留下来……”鸣人却道，“我明白了，跟我来。”小樱劝阻，“等一下，鸣人！”
鸣人带头奔向前面的遗址，阿玛鲁紧随其后，晶臧只好跟上。鸣人道，“没事的，我一定会保护好阿玛鲁的。”小樱劝阻无效，三人进入了遗址的入口。小樱苦笑，“真是的，只要他说出口，就再也不听劝了。”
小樱往回走，“现在重要的是先通知村子里。”忽然，地动山摇，森林倾覆，小樱大惊失色。巨大的城堡要塞拔地而起，天空之城出现。整个城堡平浮在空中，下面有坚实的地盘连接在大地上。天空之城起飞，脱离大地，飞到空中快速移动。小樱疾呼，“鸣人、晶臧！”
海边，卡卡西、佐井、鹿丸汇合，落水的空忍被附近的队员救起来。空忍们也发现鹿丸等人。空忍甲问道，“怎么办？再出击一次吗？”指挥官道，“没那个必要。快去加紧补给的速度。”手下应诺，马上去下命令了。指挥官冷笑，“等摧毁了木叶之后，再来对付这几个杂兵！”
卡卡西道，“差不多了吧？”佐井道，“敌人的补给应该完成了。我们应该会再次遭到总攻。”鹿丸道，“村子里应该做好准备了。”志乃如同水鬼一样，从水中出现，“你们不应该这么担心，因为我是不可能失败的。”
果然，空忍的航母开始停摆，各项技能出现紊乱。空忍们乱成一团，指挥官大惊，“是什么？”有的舰船开始爆炸，海面上出现冲天的火光。指挥官也发现了奇怪的虫子，这些虫子在吞噬查克拉燃料。空忍指挥官采取了紧急措施，终于制止住了剩下舰船的下沉。
但舰船和战机的查克拉全部被寄坏虫吃掉，漂浮在海面上成了活靶子。志乃露出微笑，鹿丸道，“真是的，对方的指挥官可不简单。这么快就稳定了局面。”志乃道，“我的虫子不可能吞噬钢铁。”佐井道，“可是那些东西都已经没用了。”卡卡西打开了写轮眼，“为了以防万一，还是不要留下后患。”鹿丸点头，“是啊，我们还不知道敌人有什么后手。要是木叶再被轰炸一次，可就什么都没有了。”卡卡西的写轮眼高速转动，“万花镜写轮眼，神威！”顷刻间，海面上出现巨大的时空黑洞，海水席卷着航母舰队倒灌而入。
空忍们乱成一团，惊叫哀嚎声中，整个舰队随着大量海水全部被黑洞吸入。卡卡西收回写轮眼，感觉还是有些疲惫。鹿丸称赞，“不愧是卡卡西老师，一招就解决了所有问题。”卡卡西苦笑，“我本来以为不需要我出手的。这个招数对身体负荷太大了。幸好敌人的舰船不能动，省了不少时间和查克拉。”鹿丸笑道，“总之，这次大家都有功劳。任务圆满完成了！”
巨大的天空之城在空中移动，里面也有很多空忍在进行巡逻。鸣人和晶臧、阿玛鲁三人都在里面，暂时还没被发现。躲过搜查后，晶臧道，“鸣人，这个遗迹在空中飞翔呢。”鸣人头疼，“真是的，这到底是怎么回事啊？”晶臧道，“这恐怕是太空堡垒的火影版。”鸣人抱怨，“听不懂你在说什么，一天让我吃惊心跳几次才算够呢！”晶臧道，“先想办法去找到控制中枢吧。这里似乎是空忍的空中基地。”
三人快跑行进，晶臧分析，“空中堡垒也是人造的，那一定是有人在操纵。”鸣人道，“不错，捉住这个人，就能阻止这个城堡。然后救出村里的人。”
很快，空忍们发现了三人，战斗打响了。鸣人直接结印，“多重影分身术！”变出一堆堆的影分身，冲上去应战。晶臧拔出金雷剑，“木叶流剑术！”剑光所到之处，所向披靡。3人一路冲杀，终于来到了城堡的中央。