最终，宇智波一族人为了恢复家族的名望和地位决心发动叛乱，其中鼬的父亲宇智波富岳成为叛乱的策划者与领导者，他逼迫鼬成为暗部一员替宇智波一族获取木叶上层情报，鼬不得已只得进入暗部，而木叶上层利用鼬热爱和平，不忍战乱的心理逼迫其监视宇智波。从此，鼬成为了一名在木叶与宇智波政治夹缝中权衡利弊的双重间谍。
他将族人叛变的计划透露给了木叶上层，团藏给他下达了灭掉宇智波一族的残酷命令，并威胁他说，如果你不动手的话，将会由我们（暗部根）动手。在一族与木叶村乃至于整个忍者世界的和平之间权衡利弊，鼬最终痛苦地接受了这个机密任务，因为他不忍心让更多人经历战乱，面临家破人亡妻离子散的悲哀。难以想象鼬当时的心情，因为他要执行的任务是杀掉和自己生活多年的族人，还有自己深爱的亲人，甚至有自己发誓要保护一生的弟弟佐助。
第三次忍界大战，鼬年仅四岁就目睹了太多的死亡，对于这么小年纪就经历战争的他来说，战争简直就是地狱，这个创伤使鼬厌恶战乱，从此成为一个热爱和平的男人。他将村子的安定放在第一位，为和平尽心竭力，没有被一族的瓶颈所束缚，成为一个热爱村子的忍者。此时此刻他面临着和平与挚亲之间的选择，最终他还是选择忍痛亲手降下宇智波一族的帷幕，背负弟弟对他的憎恨和间谍的使命离开了村子。
听完猿飞的详细讲述，鸣人的心情非常沉重。晶臧问道，“那么，当时真的是仅凭鼬一人之力摧毁了宇智波一族吗？”猿飞道，“不，后来经过查探，证实了有个神秘人帮助了他。而这个人很可能就是……”晶臧道，“宇智波斑……对吗？”猿飞道，“没错，以现在的情况推断，那个人应该就是你们所说的阿飞。”鸣人握紧了拳头，“为什么……为什么会变成这样？”猿飞叹气，“事情弄成这样，责任都在我这个火影身上，我本来想谈判解决的……”
晶臧正式向三代火影提出给宇智波鼬平反，“毫无疑问，鼬是一个英雄，但他只能以杀死一族罪名被人们所知晓，他用一生来维护忍者世界的和平，并为亲爱的弟弟佐助付出了一切。”猿飞有些踌躇，“可是真相完全公开，可能会在木叶造成混乱，尤其是宇智波一族反叛的事情。”晶臧道，“那就别让宇智波一族背负这个污名。木叶只要把宇智波一族灭门惨剧都推到宇智波斑身上就行，而鼬只是奉命打入晓的间谍，木叶的英雄。宇智波一族依然是木叶的名门望族，也从来没有背叛过。”
鸣人迷茫，“这样可以吗？”晶臧道，“我觉得这样公布这个消息，对宇智波一族、对鼬和佐助他们，都是非常有益的。这样一来，木叶就为佐助打开了一扇光明之门，无论他是否接受这个所谓的真相。不过，三代大人怕是又要担责任了。”猿飞道，“宇智波的惨案，责任本来就在我这个火影身上。没有保护好宇智波一族这个重大责任，自然还是由我这个老朽背负吧！”
鸣人感动，“三代爷爷……”猿飞道，“好了，鸣人。你可是要成为火影的男人，不要这么婆婆妈妈的。作为火影，不仅要有保护村子的心，更要有背负重大责任的觉悟！有的时候妥协和退让，都是必要，这就是政治，鸣人！”三代火影以身作则，给鸣人上了一课，告诉他火影不是那么简单的。猿飞道，“我会跟两位长老统一口径，剩下的事情就交给我了。打起精神来吧，接下来的忍界大战才是对你们最严峻的考验！”
情报部，卡卡西把香燐交给伊比喜，“这个忍者原本是大蛇丸的部下，在成为佐助的伙伴之后，曾以晓的身份活动过。”伊比喜道，“也就是说，知道很多内幕吧！”伊比喜凶巴巴的脸，加上恐怖的目光，香燐有些肝颤，急忙躲在卡卡西身后，“要好好对待我啊！”卡卡西道，“而且她目睹了团藏与佐助的战斗。”伊比喜道，“你看到他们二人对决了吗？”香燐不满，“在这里就开始审问了吗？”
伊比喜已经得到了他想知道的的答案，“很好，这家伙就交给我们情报部了。我会问出她所知道的所有。”伊比喜吩咐一个部下，部下甲抓住香燐就走。香燐嚷嚷，“真是讨厌啊，我不会跑的了！”香燐显然没有做俘虏的经验，大吵大闹，“放开我，真是的！口干死了，给我拿些饮料来！”总算把香燐弄进去了，卡卡西摇头，“话说回来，纲手大人情况如何？”伊比喜道，“依旧昏迷不醒。”
卡卡西说要去跟上级汇报，就准备告辞了。伊比喜道，“卡卡西，木叶村现在杂乱无章，得尽早有人站出来稳定大局。”卡卡西道，“我知道。”
趁着空隙的时间，晶臧用逆通灵术返回了异界的恐龙神殿。鼬依然在昏迷中，那些恐龙对鼬的眼睛和病情一直束手无策。晶臧把团藏留下来的那3只写轮眼和夺回的白眼交给了中华龙鸟等恐龙去研究。中国鸟龙则让晶臧尽快把另外一个人带走，晶臧大喜，“自来也的伤势完全恢复了吗？”中国鸟龙道，“是的，恢复的很顺利，已经完全康复了。为了不让他知道我们的秘密，我们用特殊的药物还让他在昏迷中。”
中华龙鸟也道，“快带他离开吧！再过大约几个个小时，药效一过他就会自动苏醒。”晶臧再三道谢，马上带着自来也通灵返回了木叶村。由于自来也还在昏迷中，晶臧就先把自来也安置在自己家中。晶臧疑惑，“白不在家啊……哦，想起来了，鸣人说让鹿丸召集伙伴的。我也赶快过去吧！”
晶臧赶到集合地点时，大家都已经到了。第七班、第八班、第九班、第十班、第三班大集合，当然各位带队上忍都不在。八云道，“晶臧，你怎么现在才来啊？”紫苑道，“你迟到了，晶臧！”晶臧连声抱歉，“有点事情耽误了一下。”鸣人和小樱已经把佐助的事情给大家讲述完了，鹿丸道，“佐助竟然做出这种事情。”志乃道，“难以置信！”千夏吐槽，“听你们两个的语气，根本没有惊讶的意思！”
鸣人道，“所以，佐助的事情交给我们处理吧！”天天叫嚣，“你要一个人对付佐助？你明知道我们不会同意的吧！”干笋道，“正如天天所说，鸣人。我们不能任由你耍性子！”志乃道，“要问为什么的话，这可是事关村子的大事。”鸣人道，“这才不是耍性子。”牙抱怨，“说什么回来之后会详细说明。我还在想你会说些什么呢！”梁襄道，“我们也下了了结佐助的决心啊！”
晶臧哈哈大笑，牙怒道，“你笑什么？”晶臧道，“笑你们坐井观天，就凭你们也想了结佐助。说实话，以佐助现在的实力，连我和鸣人都没有把握打败他。开启了万花筒写轮眼的佐助，可不是你们能够对付的。还说什么大话，去了结佐助，别笑死人了！”梁襄怒道，“晶臧，你说什么啊！不只是你们在进步，我们也努力修行了！你少看不起天才了！”阿空也道，“对哦，我现在已经不输给鸣人了！”
晶臧冷笑，“竖子不足与谋！”他这句古文一出口，其他人都傻眼了，“什么意思啊？”“完全不明白！”干笋道，“晶臧，别卖关子！”晶臧只是冷笑不语。鹿丸猜到晶臧这句话可能不是什么正经话，“晶臧，你也赞成交给鸣人去解决吗？”晶臧道，“这是第七班的内部事务，你们就别管了。”阿雪道，“就算你们这么说……”鹿丸道，“鸣人，你该不会嘴上说一个人去处理，实际暗地包庇佐助吧！”
鸣人道，“不，我没有包庇佐助的打算。”宁次道，“大闹五影会谈，又跟团藏对决，即使佐助也很虚弱了吧！为什么你们没有一口起解决他？鸣人、晶臧，以你们的实力，联手干掉力竭的佐助，应该不困难吧！就像对战佩恩那样。”小樱生气，“你说得真轻松啊！宇智波斑也在，不是那么容易办到的。”白道，“以当时的情况看，就算我们都出手，也很难击败宇智波斑。”
牙嚷嚷，“那也不能眼睁睁看着他们逃走吧！你们都是很强的啊！连佩恩都给打倒了。鸣人你是打败佩恩的英雄啊！”鸣人道，“英雄？”牙道，“是啊，木叶的英雄。对付佐助也应该像那时一样。”鸣人道，“并非如此。”晶臧道，“牙，你不在现场就别乱说！”八云也批评牙，“就会在旁边说风凉话！我们都跑去帮忙，你却在树林里睡大觉！”牙气急败坏，“这能怪我吗？还不是小樱……”雏田急忙劝解一番，“好了，大家不要为了这点事伤了和气。”
晶臧道，“能够击败长门，多少有些运气的成分。其实最后还是依靠鸣人的口遁胜利的。”鸣人道，“可是现在仅凭这样是无法击败佐助的，这点我很清楚。他的内心也是一样……”丁次道，“你的意思是……”鸣人道，“总而言之，现在谁也不能跟如今的佐助交手。”宁次道，“什么意思？”鸣人道，“能够与之交手的只有我，就是这个意思。”干笋道，“这样根本没说清楚啊！”鸣人也在伙伴中表示，只有自己才有同佐助一战的资本。
梁襄道，“解释清楚一点啦！”宁次道，“到底发生了什么？”鸣人道，“时机成熟我自然会说。”晶臧道，“有些事实的真相很快就会披露。”阿空道，“你们又在打马虎眼啊！真是的！”千夏捶他一拳，“白痴，你又不认识佐助，在这里起什么哄啊！”小樱觉得鸣人和晶臧似乎隐瞒了什么。鸣人把手靠在头部后面，“就这么回事，拜托各位了！我肚子饿了，去吃拉面吧，晶臧！”晶臧和鸣人一起离开，大家议论纷纷。白摊手，“就相信他们吧！”
上层会议室，猿飞与小春和门炎商量了一番，尽管他们不同意，猿飞还是做出了最后的决定，按照晶臧所说的，给宇智波鼬平反，“这件事在五影大会已经闹得沸沸扬扬，瞒不住了！”小春道，“也罢，与其引起大家的不安和动荡，把黑锅都扣在斑的头上，也说得过去。”门炎道，“也算是给团藏保留了最后的面子吧！这个家伙做得还真过分！”由于咒印取消，山中风和油女取根向他们报告了一些关于团藏的事情，包括夺取写轮眼和移植初代细胞这些耸人听闻的行为。
这时，卡卡西进来汇报。听完后，转寝小春道，“团藏已经死了，猿飞，你看……”水户门炎道，“真是的，团藏这个家伙死之前还给我们留下一堆烂摊子！”猿飞道，“接下来赶紧召开决定火影会议的人选吧！”门炎道，“是啊，关于忍者联军的事情，没有火影也无法推进啊！”小春道，“这样下去也不是办法，猿飞又得为宇智波家的事情负责。”猿飞道，“我不可能再度担任火影的。所以我们决定了，推荐你为火影，卡卡西！”