警卫工作自然还是交给林原平来做，在二十师时他就是警卫团的营长，这次重新调整，他自然要升级为警卫团长；手头上有了一个超编军，那自然不能当睁眼瞎，完全靠着上峰的信息和情报，组建特务团和侦察团是势在必行的事情，特务团的团长他打算让邓东平兼着，参谋长去管这些事也比较方便，而侦察团团长自然要交给吴林生，赖文力战死之后，孙玉民身边的侦察好手只有他了。
李天喜同样被任命为了新三十四副师长兼任一团团长，黄伟则被任命为了新三十四二团团长，王有财被任命为二团团副，再加上副师长兼七团团长的戴存祥，新三十四师将会是孙玉民最为倚重的力量，连他以前亲自担任师长的二十师也得排在新三十四后面，尽管孙玉民决心把二十师重新打造成甲种师。
还有一三九师，商震可能是考虑到如果原有的军官在的话，可能会对孙玉民的指挥造成影响，只留下了一个副师长把部队带来，其余的师部军官全都给调离了。
孙玉民本来就极度缺少军事干部，要不然也不会突发奇想，从那边要了一批参谋干事过来补充军部，现在一三九师也同样出现了这种情况，再加上一个新编三十四师，对于参谋干事和军事干部的缺口越来越大，他不好意思再向那边开口，也不愿意随便从别人那要一些过来，宁缺毋滥，省得让某些人安插一些人进来，那就得不偿失了，他寻思从基层军官中提拔一些，再从二十师和八十一师师指里匀一部分出来，这样的话至少是能先把部队的班子搭起来，有了骨架自然就会形成战斗力。
二十师和新三十四师原本就是孙玉民的起家部队，只要作好安排就不会有太大的问题，而八十一师展书堂，自己和他是有过交集的，虽然两三年未见了，可并不妨碍他们之间的关系，再加上提拔他担任了副军长，不出意外的话，指挥调动八十一师应该没有问题。这三个师都已经安排了合适的师长人选，惟独剩下一三九师一时找不到合适的人选，虽然说商震给他留下了一个副师长，可孙玉民并不打算直接提升他，原因很简单，没有在他手下立过战功的人，是不配坐在这么重要的位置上，至于417团团长王恒，孙玉民虽然较为欣赏他，也有心提拔他，可是又担心直接提拔他，会让422、423团的官兵不服气，思来想去，决定自己先暂时兼了这个职位，把王恒提为副师长，让一三九师变成和新三十四师一样，拥有两个副师长。
这样一来，十二军的架构算是完成了：军长孙玉民，副军长刘文智（未到任）、展书堂，参谋长邓东平；二十师师长张小虎；八十一师师长展书堂；新三十四师师长李铁胆，副师长戴存祥、李天喜；一三九师师长孙玉民，副师长史中华、王恒；还有暂时是孤家寡人的炮兵团团长董文彬，以及警卫团团长林原平，侦察团团长吴林生，参谋长兼任的特务团团长邓东平，刺刀分队队长周善军，后勤处主任钱进，电讯处主任唐春红，医务处处长苏婷。
因为新三十四师的扩编，原本孙玉民带来的一团还有被打残的二团，和元气未伤的七团给他提供了众多的骨干，特别是以前的那些连长们，纷纷被提升，虽然没有李天喜和黄伟这么大的幅度，但也已经是很快了，毕竟李天喜在二十师时就是主力团长了，而黄伟算是除去孙玉民原先的那些嫡系外，最受他信任的人，两人担当团长是毫无悬念的。而以前的一团三连连长许长庚被派到了一三九师四一七团担任副团，肖贵兴则被安排到了四二二团担任团副，而二团三连连长胡红卫担当了一三九师四二三团团副，他们自然不会孤身上任，加上他们带来的部分骨干，算是孙玉民为控制一三九师使用的一个小小手段，毕竟他是要亲自当这一个师的师长。而二团二连连长刘小山则升任了新三十四师一团团副，担当着李天喜的副手，二团四连连长许杰则担任了七团团副，跟着戴存祥绝对能学到不少东西。七团的那九个连长被提拔了三个到师部当参谋干事，升任了三个当营长，另三人孙玉民打算委派到了八十一师，同样要升他们的职，虽然和展书堂关系不错，但孙玉民绝不能容忍手下的某支部队里没有他的人，展书堂在军中混迹这么多年，自然会明白这一点，孙玉民也打算好了，如果展书堂硬是不同意，待八十一师到达修水后，他亲自去和这个“老朋友”谈。
孙玉民在忙着调整人员结构的时候，一三九师的大部队已经到达了指定的集结地点武宁，随后几天，九战区奉命给新三十四师补充的新兵也陆续过来，可是武器装备钱进和戴存祥还未运到，致使近十天的时间里，这些新兵们只能拿着木棍操练，这让孙玉民哭笑不得。又过了十来天，展书堂的部队也陆续到达指定的集结地点修水，得知孙玉民在瑞昌，展书堂带着一个警卫连就赶了过来，孙玉民也给足了他面子，亲自迎到了门前。
老友相见，自然是有着许多话说，俩人从白天聊到了深夜，如若不是陈莱催促了好几次，让展书堂误认为是孙玉民的小情人不耐烦了，把他给赶走，否则真说不准俩人会秉烛夜谈到天亮。
孙玉民忙于调整部队，攻击九江的事情自然无暇顾及，而中井良太郎从情报上得知有大批国军向九江周边汇聚，哪里还敢出来生事，带着他的106师团死守在九江至南昌一线，大门不迈二门不出。
应孙玉民的要求，那边从新四军和八路军甚至是从总部调集了一些干部过来，孙玉民对这些干部非常的看重，对外宣称他们是自己留在扁担石的人，应自己要求被刘文智从扁担石派过来支援的。
这些都不算，最让他意外的是，那边经过唐春红向他转达，要他从把二十集团军的一个政治处副主任要过来，担任十二军的政治主任。还告诉他，有部分隐藏在国军内部的同志也会找借口往十二军调，让他设法接收。
若是换了其他人，肯定会拒绝这个无理的要求，所以唐春红在向他转达这件事情时，都有些担心他会翻脸。可孙玉民本来就打算带着弟兄们走上这条路，对于这些要求全都是欣然接受。但同时他也提出了要求，那就是从那边过来的所有人必须听从他的指挥，不允许有私拉山头的事情出现，再有就是所有的甚及到那边的活动都得秘密行事，因为毕竟十二军才刚刚新组，还指望着重庆政府的补给呢。
周善军带着人从扁担石带来了几乎全部的金银财宝，如若不是担心银圆太过于笨重，行动太不方便，刘文智甚至还让他把银圆都带上。知道孙玉民要用很多钱，那颗价值连城的翡翠白菜，还有三腿金蟾，玲珑金塔都被带了过来，这将是孙玉民组建装甲营和军属炮兵团的倚仗。
扁担石有了大功率电台，以后就能保持联络，这让孙玉民松了口气，毕竟那边是自己经营了两年的老巢，有着一个跟了自己许久的好兄弟，还有着自己的亲生女儿和不是亲生胜似的妹妹在那。
可没想到，电台里面刘文智说她们都很好，实际上让周善军把她们给带了过来，当孙玉民和陈莱看见小丫头和初九时，俩人都不敢相信自己的眼睛，特别是陈莱抱着小丫头和初九大哭起来。
周善军还带了两个好消息，这都是刘文智没说的事情，一件是王艳茹给周善军生了个女儿，另一件则是刘文智和谷红英走到了一起。
这都是天大的好事，周善军算得上是孙玉民极为看重的一个弟兄，他当了爹，孙玉民自然打心底里的为他高兴；而刘文智和谷红英走到一起，这倒是让孙玉民感觉到有些意外，毕竟谷红英有过不光彩的过去，这个不光彩的过去并不是说她当土匪头子的事，而是她当土匪头子时期的混乱私生活，而且谷红英还要大刘文智几岁。但总归怎么说，人家俩人愿意走到一起，作为他们最为亲密的人，自然要给予最真挚的祝福。
把小初九和财物安全送到了以后，隔天周善军就委婉地向孙玉民提出了辞呈，他觉得亏欠王艳茹母女俩很多，现在既为人父，自然要竭力照顾她们，这一两年跟随着孙玉民东征西战，也帮着训练出了一支类似后世特战分队的刺刀分队，又培养出了接班人刚楞子，也算是已经尽力了。虽然孙玉民很不舍，可他还是没有去挽留，因为他自己也是为人父，知道他所要承担的责任。好在刚楞子这段时间天天跟着他学习，再加上他本身也是个习武之人，虽然还比不上周善军，但总算是能担起这个责任，再加上这次回来时，把本已走散的刺刀分队带了回来，陈铁生和陈铁养俩人带的小分队都没有碰到戴存祥他们，在约定的地点等侯了一些时日后，便回到了扁担石，没过多久周善军就回来了，自然将他们这些“兵王”们带了回来。
原本还打算让周善军带着刺刀小队陪着钱进去一趟上海，德国人马克曾给了一个联系方式，孙玉民想要组建装甲营和重炮团，这无疑是目前所能够想到的最好的办法。可周善军现在要走，这事就只能落到刚楞子身上，可孙玉民怎么可能放心得下，只得决定自己跑一趟。可没想到，才刚刚和展书堂、邓东平、张小虎、傻熊他们一说，就遭到了集体反对，最后决定由邓东平和钱进走这一趟，刚楞子带刺刀分队的所有人去保护他们。
时间过得很快，待到把二十集团军政治处副主任还有那些申请调过来的人要来后，时间也已经来到了十二月底。调整工作已完成的七七八八，原本散沙一团的十二军四个师，立刻就焕发了战斗力，小试牛刀尝试攻击了一下武穴，没料到鬼子闻风而逃，压根就不敢正面接触，这大概是因为孙玉民这段时间的报纸上得频繁，中井良太郎得知自己的对手，是让土肥原这样的狂人都害怕的国军“战神”，把防线收缩了不少，重心挪向了九江，以及九江至南昌一线，才会让孙玉民几乎不费什么力气就夺取了武穴，也总算挨近了长江航道，为接收购买的物资做好了准备。
老蒋发动的冬季攻势也进入了收官阶段，原本寄予厚望的全军出击，除去孙玉民歼灭了101师团外，其他各处并没有什么拿得出手的功迹。
冬季攻势老蒋共抽调了约七十一个师的兵力，向日军发动了全面攻击，大出日军的预料。日军在作战役总结时也认为：这次冬季攻势的规模及国军的战斗意志“远远超过我方的预想，尤其是第三、五、九战区的反攻极为激烈。”
在老蒋和国民政府军事委员会拟定的进攻计划里，只有第九战区“向粤汉北段正面之敌攻击，重点指向蒲圻、咸宁一带，并向武昌挺进；同时攻击南昌及南浔铁路，进击瑞昌、九江之敌。”达成了预定目标。陈诚九战区所部曾攻克崇阳、靖安等地，并给予当面之敌——日军第十一军以沉重的打击。日军第十一军司令官冈村宁次回忆道：该军在冬季攻势中作战“非常辛苦”，守卫崇阳、通城的第六师团自始至终都受到国民党军队的“顽强、频繁反复进攻。”
而在这场历时三个多月的冬季攻势中，国民党军队直接参战兵力达五十五万余人，出击一千零五十次，与敌作战一千三百四十次，歼灭日伪军警两万多人，其中击毙日军中将一名、少将一名、大佐两名，俘敌四百余人，击沉、击伤敌运输舰船九艘，缴获各种火炮二十余门，步枪两万七千余枝。而这其中，孙玉民部的功劳几乎就成了整场攻势的功劳。
陈诚的九战区在1939年的这一年里，不仅取得了第一次长沙会战的胜利，而且在冬季攻势的作战中也大出风头，而孙玉民更被视为了土木系的又一支重要力量，不仅让李宗仁、阎锡山等地方军阀艳羡不已，连王耀武、胡宗南、俞济时等老蒋嫡系同样是大为佩服。