宋献策领了李自成之令，遂又立即再度乘船南下。北风吹送，船去如飞，数日后，便顺利到达南京城，随即受到了李啸的接见。
宋献策立即告诉李啸，说现在李自成已同意割让汉中与河南中南部，希望两国能尽快达成协议。
听完宋献策的话语，李啸十分高兴，若不顾及颜面，简直就想猛击一掌。
哼，李自成这厮，估计肯定是跟臣下大闹了一番，最终还是不得不同意自已的意见。
毕竟，这厮比自已更需要时间来恢复生气休养生息。在这个前提下，自已所提出的条件，李自成捏着鼻子也只能认了。
这样不费一兵一卒，就近乎空手套白狼地得到了汉中与河南中南部，实是一件十分令人惬意之事。
于是，李啸传令，准允唐军与大顺进行和平谈判，并派陈子龙为全权代表，与宋献策一齐在南京城中洽谈谈判事宜。
经过两天的仔细斟酌与具体商量，最终唐顺双方，达成如下协议，具体条款为：
1、大顺放弃汉中与河南中部南部，交给唐军治理管辖。两国在川陕之处，从此以秦岭为界。在河南，南阳府、汝宁府、归德府三处地界，划归唐军，而在开封府地界，则以登封、新郑、尉氏、杞县为界，南属唐军，北属大顺。
2、两国签定协定并交接领土后，从此息兵罢战，并设立几个关榷点，互相通商往来。
3、两国达成此项协定，最短停战和平时间为两年。
4、此协议一式两份，由双方全权代表签字后确认生效。
协议签定后，宋献策一脸欢喜地返回京城，便急不可待地向李自成禀报协议达成的消息。
李自成得到禀报，虽不作声色，心下滋味，却是难以言表。
这般割地求和，倒是比当日宋辽澶渊之盟，只怕还要惨些。
毕竟，宋朝当初没有割机让那么多的土地，也没只与辽国达成两年的和平期限，而是延续了足足一百年的和平。
李自成近乎直觉地想到，万一和平期限结束，那唐军该会立刻翻脸前来进攻吧。
更可悲的是，若唐军无赖，不待协议结束，便就此撕破协议，向大顺发动进攻，那自已也只能无奈应战，而没有任何办法来阻止吧。
饶是如此，这份并不踏实的协议，却也是李自成想要改变现状，而必须采取的唯一选择。
两年时间，也许不到两年，大顺若无起色与变化，那将来的可怕后果，李自成已不敢想象。
最后，这位大顺皇帝，在一声悠悠长叹，在协议书上加盖龙玺，正式确认。
有了唐顺两位最高统治者的确认，接下来的交接事宜，顿是十分顺利。
汉中以及河南中南部的大顺官员以及残余驻守兵马，在前来接收的唐军兵马面前，有如丧气的斗败公鸡，灰溜溜地全部撤走离开。各地的交接都是十分顺利，连半点摩擦都没有发生。
唐军顺利接收汉中与河南中南部，顺军便按先前规划，布防于秦岭北边，和河南划定的两军交接线处，与唐军两边对峙，倒是极有默契地保持了平静的局面。
唐顺双方至此，都获得了极其想要的和平。
在大顺国中，李自成采纳牛金星等人的意见，开始裁汰军中老弱，减轻财政负担，同时大力编练新兵，以备将来之战。
与此同时，他下令在全国范围内，大拓殖荒地以增加粮食产量，强制成年男女婚配以增加人口数量。
李自成亦下令，要学唐军的火器建军模式，开始组织国中技术人员，开始进行军械研究。准备也要与唐军一样，在火器方面大力研发，全面提升军队的火器作战能力，争取不至于落后唐军太多，最好能达到与唐军形成勉强的火器力量平衡。
而在唐军这边，诸如调派新任命的朝廷官员，安置新得地区的百姓，恢复当地的生产生活秩序，加紧整编训练新编的两镇兵马的工作，皆已是有条不紊的进行。
而除了这些之外，李啸决定，还是按原计划，下达了对整个西南地区的改土归流工作。
改土归流是指改土司制为流官制，始于明朝中后期，是指将原来西南地区统治少数民族的土司头目废除，改为朝廷中央政府派任流官。
简而言之，改土归流就是把少数民族土司管理的方式改为政府官员管理方式。土司即原民族的首领，流官由朝廷中央委派。改土归流有利于消除土司制度的落后性，同时加强中央对西南一些少数民族聚居地区的统治。
改土归流，自明代中叶以后便逐步开始。它是在土官与封建王朝的矛盾日益尖锐的情况下产生的。这个矛盾，唐、宋以来就长期存在。随着社会生产力的不断发展，土官制度越来越不适应社会的需要。
与此同时，土官又日益与朝廷闹对立，反对朝廷对它的管辖。这种有损于国家统一的行为，明王朝自然是不能容忍的。于是“改土归流“是势在必行。
而明朝的做法，其实是比较缓和的。如遇到土官绝嗣、土官之间互相仇杀或叛乱被平定、土官犯罪革职等.当地的土司制度即被废除，改由流官接任。
饶是如此，由于明王朝的举措，基本是与土司利益为对立面，故各地多有叛乱。其中，最大规模的便是乌蒙土司的叛乱，当然，最终亦被朝廷顺利镇压。
借鉴到明王朝的相关经验，李啸决定，在西南地区开始的改土归流工作，要根据土司具体情况，分成三大部份，分别对待并开展。
由于西南地域广阔，土司众多，李啸并没有急于求成的对所有的土司，来个一刀切的粗暴推进，而是首先将土司分成三个部分。
第一部分，是势力较小，兵马薄弱，但却与唐军关系较好，甚至在唐军征战西南，加入唐军或辅助唐军作战的当地土司。对于这部分土司，李啸决定，暂不对他们进行改土分流工作，而是继续保持原状。希望以这种方式，让这些土司继续维持与自已的友好关系。
这部份的土司改土归流工作，李啸打算最后进行，甚至在统一全国之后，再进行亦无不可。
第二部分，则是势力一般，兵马不多，与唐军关系也一般，在唐军攻伐西南时，采取中立态度的当地土司。李啸给他们限了一年的时间，准允他们逐步改进，让他们最终同意进行改土归流，让朝廷派驻官员，来代替一直实施的土司制度。
而第三部分，则是势力较大，兵马也多，但是却与唐军关系不佳，曾站于唐军对立面，后来却被迫臣服的当地大土司。对于这些土司，李啸决定首先拿他们开刀，要他们立刻整改，改土归流，不可违抗，以达到擒贼先擒王的效果。
于是，在李啸的密令下，西南各地的唐军各镇兵马，赶在朝廷召令前，悄悄来到了那些可能反叛的大土司之处驻扎安顿。