某日傍晚，堤向津川河边，东京大学研究生木田彻与两个同伴带着工具出现。木田今年24岁，穿着蓝色上衣。两个同伴中，戴着眼镜的美女正是藤森香保留，24岁，穿着红色上衣，她也是东京大学天文学系的研究生，另外一人叫做三岛匠，24岁，同样是东都大学的研究生。远方的公路上，车流滚滚，金色的阳光洒射下来，夕阳美景，美不胜收。
草地旁，元太、文乃、光彦、步美4人结伴向回走，他们在讨论假面超人的卡通故事。元太抱怨，“就在这时打出了未完待续的字样。”光彦期待，“以后会怎样呢？”步美叫道，“真的真的，真是期待明天的假面超人yaiba！”文乃叫道，“因为这是假面超人与复活的鼹鼠怪的宿命决斗啊！”元太大声道，“绝对不能错过！”几个孩子回忆起假面超人的英姿，崇拜的不得了，“恩……真帅啊！”
这时，前面河边，传来藤森的声音，“我记得上次也是11月。”木田道，“嗯，今天是早上3点多。今年血之雨一定会降临。”4个孩子惊叫出声，“血之雨！？”元太扑倒在地，光彦3人也急忙效仿，4人匍匐前进，仔细聆听几人的谈话。元太低声道，“他们在说什么？”光彦示意噤声，他们看到二男一女在河边，不知道做什么。步美疑惑，“那个红色衣服的女人好像是藤森姐姐。”侦探团还是认识藤森的，他们很奇怪，不知道藤森在这里做什么。
木田递给藤森一张照片，藤森接过来，“真是厉害啊！”木田隐约说道，“……水星的巢……”另外一个男人，三岛隐约讲道，“……魔得拉……”4个孩子被唬的不轻，继续观察。木田递给藤森一个黑色团扇。由于汽笛声一直在响，后面的话，孩子们都听不清了，甚至谁在开口都搞不清楚。汽车的笛声过后，木田道，“那么午夜12点在车站集合，从那儿坐车去目的地。”三岛笑道，“加油啊！”说完话，3人就提着箱子一起离开了。
侦探团走出来，步美道，“藤森姐姐他们在说什么啊？”光彦道，“血之雨什么的，好像不大妙。”文乃发现地上有藤森不小心留下的照片，元太捡起来观看，“这是什么啊？”这是一张彗星的照片，但拍得有些模糊。光彦大叫，“我知道了。藤森姐姐他们准备去和怪兽战斗。”文乃吃惊，“怪兽？”光彦开始推理，“是的，11月的某一天，早晨3点多。宇宙怪兽魔得拉会来攻击地球。这就是它的照片。”元太摸着下巴，故作深沉，“这么说起来，他们刚才是说了水星之巢什么。”
光彦摆出一副渊博的样子，“水星是离太阳最近的行星，魔得拉的巢就在那里。”步美道，“那刚才那些人，还有藤森姐姐……”几个孩子叫起来，“真正的假面超人yaiba！”随后，几个孩子打电话给浅井成实，询问藤森与假面超人的关系。成实笑得肚子疼，只好随口忽悠他们，“不是啦，你们的藤森姐姐不是假面超人的地球伙伴。也许另有其人吧！我知道的话，一定会马上告诉你们，呵呵……”侦探团听完成实的解释，有些不相信。光彦认为，藤森将成实也瞒过去了，就像假面超人瞒着自己的青梅竹马的女友一样。
第二天放学后，步美将照片给柯南看。柯南也很头疼，一时不知道这是什么照片。灰原在旁边饶有趣味，“哦，还真的是很奇怪的照片啊！”步美笑道，“吃了一惊吧，柯南？”光彦故作高深，“本想把它作为只有我们4人知道的秘密。”元太笑道，“因为柯南和灰原都是少年侦探团的伙伴，所以……”文乃也道，“这可是藤森姐姐的大秘密，千万不要泄露哦！”灰原还没有见过藤森，“藤森姐姐是谁？”文乃简单讲了一下，“总之，是个很好很美丽的姐姐，非常有气质。”灰原一愣，“她是叫做香保留吗？”文乃点头，“是啊，灰原你知道她的名字啊？可是你好像没有见过她吧？”灰原只好道，“我是听千钧说的。”
灰原有些恍惚，她记得藤森与姐姐明美是极要好的朋友，自从明美改名为广田雅美后，她们也十几年没有来往了。灰原现在都不大记得藤森的样子，同样，藤森也不可能还记得十几年前的那个小女孩。如果是宫野明美出现在藤森面前，藤森可能还有印象。当然，自明美变成梅琴后，因为千钧的关系，梅琴与藤森已经是好朋友了。藤森却丝毫没有发现梅琴就是国中时代的好朋友。
柯南打断了灰原的沉思，“谢谢啦，但这并不是什么怪兽。”侦探团4个孩子不信。柯南没好气，“假面超人yaiba只是电视节目……”光彦立即反驳，“不，假面超人yaiba是真实存在的。至少那些知道魔得拉的人中应该会有。”文乃道，“我们可以去问问藤森姐姐。”光彦道，“她肯定会说不是的，电视上假面超人的地球伙伴的身份也都是保密的。”元太附和，“不错，真正的假面超人yaiba一共有3个人，还带着黑色的团扇。”柯南纳闷，“黑色的团扇？”步美问道，“柯南，如果这不是魔得拉的照片，那又是什么？”
柯南道，“这个……我总觉得在哪里见过。”灰原笑道，“如果这真是怪兽的照片，大家又要怎么办呢？”光彦立即道，“当然要去为与怪兽战斗的假面超人yaiba打气。”文乃叫道，“我会成为假面超人最坚实的后盾！”步美也握紧拳头，“如果可以的话，我也想一起战斗！”元太大喝，“当然，我也是！”灰原无语了，柯南大汗，“喂喂，不是说过不对了吗？”光彦道，“为了逼迫藤森姐姐说出真相，一定要查清11月的什么时候魔得拉会降临到地球上，确切说是日本的什么地方。”元太、步美、文乃大声附和。
柯南叹气，“喂喂，你们几个……”步美道，“柯南，你不相信也不要紧，因为我们会调查下去，知道找到真相。”文乃也赞成，“元太、光彦，我们走吧！出动，少年侦探团！”4个孩子跑了出去。柯南大叫，“喂喂，你们几个，等一下……”很可惜，柯南失败了。柯南垂头丧气，“这群蠢材！”
路上，元太问道，“但是，该怎么调查呢，光彦？”光彦想了一下，“是啊，找情报的话，首先就要找媒体。去报社和电视台看看吧。”4人很快跑走了。柯南吐槽，“真是拿他们没办法啊！”灰原忍不住笑出声，柯南问道，“有什么奇怪的吗，灰原？”灰原笑道，“就连名侦探也缺少这方面的知识啊！”柯南问道，“那么，你知道那些照片是什么吗？”灰原笑道，“线索是1986年和2062年，提示是千钧与藤森的共同点。”柯南撇嘴，“什么嘛，千钧那家伙与藤森小姐根本没有任何共同点……”
千钧穿着蓝色上衣，精神抖擞出现在二人前面，“小哀，柯南，有没有兴趣去天文台观星呢？”灰原很高兴，“好久没有跟你一起去看星星了。”千钧赞叹，“小哀，你今天这身淡黄色上衣加上绿色的短裙，更帅气漂亮，太完美了！”灰原露出喜色，“那是当然，我亲自选的衣服怎么会有问题。你现在的装扮也蛮酷的嘛！”柯南终于反应过来，“等一下，如果说共同爱好的话……原来是这样，这就是说，步美他们正在找的是……”灰原笑道，“大概是这样吧。但是关于黑色团扇的意思，我也不清楚。千钧，天文观测中有类似这样的仪器吗？”千钧笑道，“当然有，黑色团扇是天文摄影的常用工具之一。”
日卖新闻社，眼镜编辑很吃惊，“怪兽魔拉得？”元太纠正，“是怪兽魔得拉。”光彦附和，“对，是魔得拉。”眼镜编辑摆手，“不好意思，现在太忙了。下次再让我好好听一听吧。”总编辑的声音传来，“喂，晚报还没好吗？”眼镜编辑拿起一叠纸，“这就好了，马上就来。”没人搭理几个孩子，侦探团大为失望。
然后4人来到日卖电视台，元太道，“不会还是没人听我们说吧？”光彦道，“不，这次肯定没问题。”文乃和步美也看到了墙上贴的假面超人海报，大家充满了信心。果然，制作人小岛先生非常惊讶，立即跳起来，“什么？从水星来的怪兽？得紧急出动假面超人yaiba！”孩子们集体失声，感觉这位小岛先生有些神经质。小岛大笑，“啊哈哈，开个玩笑！哈哈……”侦探团众人气得鼻子都快歪了，显然小岛将他们的话当卡通故事来听了。
街上，千钧带着柯南和灰原边聊边走，有视频屏幕正在播报，女记者拿着话筒，“今天将采访孩子们的英雄假面超人yaiba的拍摄现场。”导演和摄影师使用的道具，以及有三个假面超人装扮的人，进行场景1的演练。灰原笑道，“原来假面超人yaiba真的有3个人啊！”千钧道，“那两人装扮有些不同，应该是假面超人的地球伙伴。”柯南看到了相关道具，明白了为什么元太会说假面超人里面也有黑色的团扇。
这时，侦探团垂头丧气走出了米花中央警察局。光彦道，“真是奇怪啊，大家是明明知道而装傻呢，还是根本不知道呢？”文乃道，“我总觉得他们好像在笑我们。”步美道，“知道这件事情的，只有我们和假面超人yaiba呀。”元太叫嚣，“这样的话，只能靠我们自己调查了。”文乃道，“藤森姐姐是天文学爱好者，又涉及到水星……”光彦马上反应过来，“如果要去调查宇宙的事情，就要去国立天文台。”
以前，千钧曾经带侦探团在晚上去过国立天文台，所以孩子们很快就来到这里。文乃道，“可是，这里白天似乎不让进来啊！”趁着警卫起身离开的时候，侦探团偷跑了进去。孩子们来到第一赤道仪室，看到巨大的望远镜，光彦道，“这个望远镜好旧啊！”文乃道，“我记得这个望远镜可以观测太阳并摄影。”看到旁边悬挂的太阳照片，步美笑道，“千钧哥哥讲过，这个是太阳黑子！”元太讥讽，“就像发了霉一样啊！”这里没有人，侦探团只好离开。
根据晚上观星的模糊记忆，侦探团又来到大赤道仪室，这里有一架巨大的天文望远镜，还有彩色的屏幕图像。步美问道，“现在怎么办，光彦？”光彦挠头，“不行，这些天文图我也看不懂啊！”一个男子走过来，“你们在查什么？”孩子们吓了一跳，回头一看，正是之前在河边见过的两个男子中的一个，木田彻。步美大叫，“假面超人yaiba！”元太很兴奋，“竟然在这种地方碰到，真是太幸运了！”木田好笑，“可惜我并不是什么假面超人。我是在这里做研究的东大研究生。”
光彦很是自负，摆出假面超人的战斗姿势，“我知道，东大研究生是在这个世界上活动的假身份。一旦发生什么事件，就会变身为正义的英雄……”柯南走过来，“他是不会变身的，光彦！”侦探团这才看到，千钧、柯南、灰原走了上来，阿笠博士和一位慈祥的老人跟在后面，老人正是国立天文台的台长。光彦吃惊，“柯南！”文乃道，“千钧哥哥也在！”步美也道，“灰原和阿笠博士也来了。”元太问道，“为什么你们会在这里？”柯南笑道，“啊，因为我太了解你们的行动方式了。”
;