因为松果体细胞内含有丰富的5一羟色胺，它在特殊酶的作用下转变为褪黑激素，这是松果体分泌的一种激素。研究发现，褪黑激素的分泌受到光照的制约。当强光照射时，褪黑激素分泌减少；在暗光下褪黑激素分泌增加。而人体内褪黑激素多时会心情压抑，反之，人体内的褪黑激素少时则“人逢喜事精神爽”。由此看来，人的情绪受光的影响就不足为奇了。
其次，松果体是人体的“生物钟”的调控中心。由于褪黑激素的分泌受光照和黑暗的调节，因此，昼夜周期中光照与黑暗的周期性变换就会引起褪黑激素的分泌量相应地出现昼夜周期性变化。实验证实，褪黑激素在血浆中的浓度白昼降低，夜晚升高。松果体通过褪黑激素的这种昼夜分泌周期，向中枢神经系统发放“时间信号”，转而引发若干与时间或年龄有关的“生物钟”现象。如人类的睡眠与觉醒、月经周期中的排卵以及青春期的到来。新近发现，人体的智力“生物钟”以33为周期进行运转，情绪“生物钟”为28天，体力“生物钟”为23天。这三大生物钟的调拨也是由松果体来执行的。
松果体分泌的激素——褪黑激素能够影响和干预人类的许多神经活动，如睡眠与觉醒、情绪、智力等。很显然，松果体在神经信号与激素信号之间扮演着“中介人”的角色。因此，松果体在人体内执行着一个神经——激转换器的功能。这也是松果体的第三个功能。
然而，我们相信，松果体的功能远不至此，我们对松果体的认识还很肤浅。由于它深埋在颅腔内，使我们对它的研究增添了客观上的困难。但不管怎样，随着研究的深入，它的“庐山真面目”终究会显现在人们面前。
松果体作用现存的一些猜测：“预感能力”。现代生物的松果体都有一定程度的退化，其中人类属于退化较多的一类，自然界中的动物能对自然灾害提前作出反应，而人类通常毫无察觉，因此有人猜测松果体掌管着预感能力，而人类的这一能力退化了；也有人根据松果体能对光波做出反应，推测松果体同样能对某些射线做出特殊反应。此外，古时的神职人员常在头冠上对应松果体的部位镶嵌较大颗粒的宝石，进行占卜等仪式时，会让光线射向印堂或眉心天灵等处，皆指向松果体；眉心一直被当作精神力集中的地方，当人遇厄运时会称“印堂发黑”，不知这些是不是巧合。
不知过了多久，杨晓枫醒了过来。醒过来后的第一个反应就是自己眼睛还没有睁开，就好像看见了避风坑里的一切。他惊呀之余，眼睛立即一睁，他发现自己眼睛看东西确实比以前清晰多了，就是在自己漆黑的避寒坑中，所有的东西都是一目了然，这是他以前从来不可能做到的事情。此时，杨晓枫也感觉象是充足了电，浑身都充满了力量，欣喜之余连忙打开自己的手机，一看就实着让他吓了一跳，时间居然过去了三天，想再看看这个三天有没有人找，但手机因为没有电又自动关机了。