硝烟弥漫，招式的碰撞伴随着无数人和神奇宝贝的死亡，虽然才开始不到十分钟，但是，冰层上已经覆盖上了一层血，冰层在缓缓融化，要知道这是酋雷姆的冰，就算是终结古拉顿都需要时间来融化。
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“九字阵，可以将九只神奇宝贝作为献祭，而九字阵的力量就是这九只神奇宝贝相加。也就是说，现在这个阵的力量是4600。只要战斗力低于4600的进到阵中会被瞬间毁灭。而且可不是4600那么简单，这个阵会吸收这个战场上战死的人和神奇宝贝的灵魂，进而不断提升能量和范围。来吧！让我看看你要怎么应对。”赤日看着佑树说到，脸上带着的表情似乎在说：“这场战争我们赢定了。”
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“黑暗洛奇亚，它可不是神奇宝贝，不，应该说不是普通的神奇宝贝，一只洛奇亚带着对人类的怨恨而死，它的怨恨变成了黑暗的具象化，只要这世界还存在黑暗，他就拥有无限力量、不死之身。”拉姆达说道，虽然他一副小混混的模样，但是，在说出这些话时却是无比严肃，小枫可以听出他话语中带着的怨念。
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“现在雷吉奇卡斯拥有可以牵动大陆的力量了，甚至是一拳打炸大陆，但是，还不止如此，因为雷吉奇卡斯慢启动特性，一段时间后它才能使出全部力量，到时候就是一拳打炸这个地球了。”赤焰松说到，阿豪甚是不解，赤焰松作为熔岩队首领不是应该扩张大陆吗？为什么连整个地球都要打炸？
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“世间生灵逃不过生死轮回，六道轮回的力量，就是审判！而现在，胡帕就是这审判官！”比夏斯对灵历说道，在比夏斯看到，操纵生死这种事任谁听了都会害怕，然而，灵历听了不害怕反而大笑着说道：“审判官？巧了，我也是！”
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“世界无非就是秩序与混乱，就像五行一样相生相克，看上去是秩序，但同时也是混乱，基格尔德作为守护秩序的神，在有人破坏秩序时就会出手消灭它，这本身也是混乱。现在基格尔德拥有毁灭世界的力量，也可以说是破坏秩序与混乱的力量，你，选择秩序还是混乱？”弗拉达利说道，阿冰沉思着，弗拉达利这些话说出了魔兽世界的本质。
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“世界初始之树，他之所以能平息战争是因为能控制生命的心灵，同样，它也能使战争恶化，不过还不止，雪拉比的这个树人可以使用草系神奇宝贝所有招式，在草系招式中有一招叫做根深蒂固，能吸收土地里的营养恢复自身体力，想象一下，作为世界初始之树所化的树人使用这招的情形。没错，地球土地里的养分会被树人吸收，土地炸裂，大海枯竭，在地球中心的岩浆接触到大量的空气产生超新星大爆炸，轰，的一声，一切就都终结了，不止是地球，整个太阳系都将消失，世界回归初始！”雅典娜对娜姿说道，据她所知，娜姿只有一些超能力，这并不会妨碍到她。
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“你知道为什么酋雷姆被称为境界神奇宝贝吗？三界并非是你们所说的人神鬼三界，而是断离灭三种境界，现在的酋雷姆掌握着这三种境界，它可以毁灭世界。龙脉可以说是地脉、水脉的起源，也就是说，它可以控制水脉和地脉，和世界初始之树一样，可以让整个宇宙回归初始。”魁奇思说道，宋博天笑了笑，脱去了上衣露出强壮的身躯：“你最大的错误就是把大地之剑传送到这里，我，宋博天，大地家族第六十四代皇子，起誓，必将谨遵家族使命，再次镇压邪龙！”
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“人们都说水火不容，那么又是哪来的这颗星球，水与火；始源之海与终结大地，最终会葬送在现在，你知道为什么波尔凯尼恩作为水系神奇宝贝不会自己造水吗？因为，它不是自然神奇宝贝，而是人造神奇宝贝，人类在蒸汽时代创造了它！所以，也可以说是毁灭于人类之手！”水梧桐说道，小韵不以为然，她作为永恒之花知道人类是最接近恶魔的生物，但是，这都无所谓，有他的世界由她来守望！这就够了！
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“神奇宝贝世界的创造神阿尔宙斯，与时空之神、反物质之神合为一体，才是正真的初始之神，你知道阿尔宙斯正真的力量吗？这个世界是它创造的，它就是这个世界的神，它现在可以随时创造出其它神奇宝贝为它作战！也就是说，你面对的不是一只神奇宝贝那么简单，而是整个神奇宝贝世界。”坂木异常的话语多了起来，他可以从何鲲身上感受到强者的气质。
何鲲听着坂木的话语不以为然，挥动着他的魔术权杖说道：“现在是你的回合，到我的回合你的一切就结束了！不，应该说是我们整个十三殿的回合！”
……
阿桂静静的看着整个战场的一切，面无表情，即使看到各种世界危机也无动于衷，他吸收了紫苑以后知道了一件很不得了的事情，现在在十三殿里躺着的紫苑是紫苑的另一半意识，而她，之所以在大墓的紫阳苑里是为了守护某样东西，这样东西远比眼前的这些世界危机危险。
坂木的意图阿桂看出来了，那就是通过这里的九个大阵和另一半紫苑解开大墓中的十方封印，也就是说，如果十三殿打败了这九个大阵就会解开十方封印释放大墓中某个危机，而如果没有打败这九个大阵世界也会回归初始，能布下如此大局，看来大墓中的危机才是正真的危机。
……
佑树看着九字阵，手中紧紧的握着一枚八角形金属片，这似乎是它最重要的东西，他看了看正在缓缓扩张的九字阵，又看了看阿桂，朝阿桂看了看，手一挥，将那片八角金属片丢给阿桂并说道：“如果你未来能遇到她，请代我跟她说，我已经不爱她了！”在说出这话的同时佑树的眼角已经湿润，阿桂和欣悦知道，他只是想让她不要为他的死去而伤心。
阿桂点了点头表示一定会，但是，此时战争能不能活着也是个问题，只要还活着遇到她一定会代他跟她说的。阿桂把八角金属片放在胸口前，八角金属片化为一道光没入阿桂的胸口，成为了他的第三个心脏。
“我愿一生成为她的钢之壁，守护她！”佑树看着远方说道。同时，阿桂想起了这个八角金属片是什么，这不正是钢铁徽章吗？
……
水晶洞穴
蜜柑在这里已经很多天了，自从阿桂离开后她就一直在这里，她不相信没有阿桂自己就捕捉不了水晶大岩蛇，于是天天在这里挑战大岩蛇。想在她也正在挑战水晶大岩蛇，对于关东的战争也完全不知。
她经过这么多天的摸索，终于知道了阿桂当初问她有没有大晴天这招的用意，水晶洞穴到处都是水晶，而在洞穴顶部又有一个洞口，可以使用大晴天照射在水晶上，然后反射在水晶大岩蛇身上，起到灼伤效果，对于怕火的水晶大岩蛇来说是无比致命的。
“大钢蛇，大晴天。”蜜柑自己的大钢蛇使出大晴天，果然一切都如她所想，阳光照射在整个洞穴的水晶上，然后折射到水晶大岩蛇身上，水晶大岩蛇表现出很痛苦的样子。
就在蜜柑以为自己要成功时，就在水晶大岩蛇以为自己要被收服时，在水晶大岩蛇脑海中一个声音响起：“我愿一生成为她钢之壁，守护她！”这句话出现在脑海的同时水晶大岩蛇身上散发着白光，这正是进化的光芒，但是，还不止这样，在水晶大岩蛇身前还出现了基因图案，这是mega进化的图案。
按理来说水晶大岩蛇是不可能进化的，因为水晶物质的水晶大岩蛇不可能进化成钢物质的大钢蛇，而此时却发生了，而且还直接进行了mega进化，它的mega进化不同于普通的mega进化，它的mega进化是永久的，而不是一时的。
水晶洞穴里的水晶仿佛被超能力操控一般，漂浮而起环绕在水晶大岩蛇，不，应该说mega水晶大钢蛇周身，因为，光芒散去，一个史无前例的mega水晶大钢蛇呈现在蜜柑眼前，水晶洞穴现在显得比较拥挤，mega水晶大钢蛇巨大的身躯占了洞穴三分之二。
回过神来，蜜柑发现因为水晶都在mega水晶大钢蛇周身悬浮的原因，大晴天的折射战术失效了，而且现在的mega水晶大钢蛇比之前强不至十倍，原本火系对它有八倍伤害，现在只有2倍。
她知道自己又要失败了，就在这时mega水晶大钢蛇猛的朝她冲来，她没反应过来，之前就算是蜜柑被它打败它也不会再继续攻击蜜柑，而现在突然就冲了过来使她不知所错。在她认为自己要完了时，mega水晶大钢蛇在她面前停下，用它巨大的水晶额头抵在蜜柑额头上，mega水晶大钢蛇庞大的身躯化为一道光没入蜜柑体内，她晕了过去，在她额头上一个八角金属片的图案闪烁……
……
“来吧！感受钢铁的意志吧！”佑树对九字阵怒吼着，放出了自己的所有神奇宝贝：“我愿以身为铁壁，守护这世界！”佑树身躯渐渐坚硬，变为钢铁，变为一面铁壁，他的神奇宝贝们也随之变为铁壁，它们融合成一根巨大的铁柱，穿过七彩祥云从天而降，震碎了九字阵！
赤日口吐鲜血，这是九字阵被震碎的反噬，他用最后一口气说道：“这铁柱的彼端或许就是没有心灵的世界吧！”说完，他身体在战火的照耀下灰飞烟灭。
阿桂看着这一幕很是痛心，佑树也是陪自己一路走来的劲敌、朋友、伙伴，但是，他知道这是他的选择，既然如此，何不坦然接受，同时，阿桂感觉到那颗八角金属片的心脏已经开始跳动……
……
“我听到了钢的意志！”小枫虽然看不到，但是能深深的感受到佑树那钢铁的意志，那守护她的意志，小枫一身了无牵挂，他对阿桂说道：“阿桂，你还记得当初我跟你说我幼年被毁光明吗？”阿桂点点头表示记得，小枫边说话，边脚下加持风的力量躲避黑暗洛奇亚的攻击。
“其实那并不是被毁的，而是我自己毁的，我不知道什么时候有了一双很奇特的眼睛，这双眼睛可以把一切都看的很清楚，甚至看到了风的痕迹，我遇到了她，她叫梦，梦常说喜欢木叶飞舞样子，因为，可以随风而去！她或许并不知道，我喜欢她……然而……我亲手杀了她……我父亲在我刚出身时就死了，在我六岁那年，母亲也死了，我哭了很久很久，眼睛不知道为什么很痒，等我回过神来时我发现周围已经变成了一片废墟，我不知道发生了什么……”说道这里，小枫停顿了一下，手放在胸前，阿桂感叹：“风无象，梦无痕，犹豫到头憾一生！”
“梦找到在废墟中哭泣的我，她最后一声叫出我的名字，在我抬头看向她的那一刻，她在火焰中灰飞烟灭……”说到这里，小枫手插进胸膛，鲜血流出，但是他依旧一脸坚定，他对阿桂说道：“你能成为我的光明吗？”阿桂点了点头，小枫露出了微笑，双手撕开了胸膛，没有想象中的心脏在跳动，而是一双眼睛。
阿桂想起当初跟小枫对战时，他的比雕就是一只心眼特性的瞎子，从刚才的故事不难看出，他后来是把自己的光明毁了，将这双眼睛代替已死的心。在看到这双眼睛的同时阿桂知道了真相，这是双有着血红色虹膜和漆黑瞳孔的眼睛，正是写轮眼，写轮眼在自己所爱之人死去时就会进化成万花筒写轮眼，在小枫失去母亲时他的写轮眼进化成了万花筒写轮眼，原本连写轮眼都不会控制的他，突然拥有万花筒写轮眼，这让他更不会控制，所以周围成为了废墟，所以在看向梦时她灰飞烟灭。
那一双万花筒写轮眼在小枫的控制下渐渐融合为一个永恒万花筒写轮眼，阿桂很是震惊，据他所知万花筒写轮眼要想成为永恒版的必须是宇智波血脉的人通过移植兄弟的万花筒写轮眼才能进阶为永恒版的，没想到却被小枫这个连写轮眼都不会用的人两只一样的融合为一只永恒版。
但是，阿桂很快发现了不对劲，小枫的身体正在一点点化为飞烟，阿桂突然想到了什么，万花筒写轮眼的确是需要宇智波血脉的人才能进阶为永恒版，但是，那是在人身上的时候，如果是不在人身上呢？
“天照！”小枫身体都化为了飞烟随风飞去，最后只剩下一个头时小枫喊出了这最后的一招——天照，这是一种黑色的火焰，梦就是死于这种火焰的，这种火焰不会在对方灰飞烟灭前是不会熄灭的。
黑暗洛奇亚是黑暗的化身，是不死之身，那么，就让这黑色之火燃烧这黑暗到永远吧！黑暗洛奇亚身上出现了一团团黑色的火焰，就像万蚁噬心一般，黑暗洛奇亚在哀嚎！
“神威！”小枫最后的头也消散了，但是，不知从哪传来了这声音，神威，可以使时空扭曲，把人或物传送到异空间去，他现在就要将这永恒燃烧的黑暗传送到异空间去。黑暗洛奇亚周围的空间出现扭曲，黑暗洛奇亚消失在众人视线中，在那异空间中燃烧到永远。
“哈哈！我愿称你为最强！”拉姆达笑着说道，在他身上也出现了黑色火焰，他也化为飞烟随风而去……
阿桂看着这一切，沉默了许久，手一挥，永恒万花筒写轮眼朝他飞来，阿桂接住放在自己胸前，永恒万花筒写轮眼没入胸膛，成为了他第四颗心脏：“从现在开始，你的世界由我来照亮！”
……
“哈哈！时间到，现在开始一拳时间。”赤焰松看着雷吉奇卡斯说道，阿豪和他的众神奇宝贝一边躲避雷吉奇卡斯的攻击，一边寻找机会攻击雷吉奇卡斯，但是，一靠近雷吉奇卡斯就会感受到它周围因力量而扭曲的空间，让人喘不过气来，更别说是攻击，而现在雷吉奇卡斯的慢启动时限过了，现在的雷吉奇卡斯拥有可以一拳打炸整个地球的力量，阿豪能清楚的看到它身体散发着的火红热气和周围时空相互碰撞产生的电光。
“没有什么是一拳解决不了的，如果有，那就两拳！雷吉奇卡斯，百万吨拳击！”赤焰松脸上充满了疯狂，雷吉奇卡斯一拳朝阿豪和他的神奇宝贝打去，阿豪对艾路雷朵说道：“艾路雷朵，攻击平分！精神切割！”
艾路雷朵使出攻击平分，把自己的攻击和雷吉奇卡斯的力量相加然后平分，紧接着艾路雷朵使出了精神切割，双手覆盖能量与雷吉奇卡斯的拳头相碰撞。
“轰！”
一声犹如***爆炸的声音响彻整个战场，大地都在颤抖，艾路雷朵在雷吉奇卡斯拳下爆炸，这一幕很是让阿豪心痛，阿豪不知道为什么明明已经平分力量了还爆炸了？
“哈哈！你以为雷吉奇卡斯的力量是艾路雷朵能掌握的吗？”赤焰松对阿豪嘲笑道，阿豪顿时明白，艾路雷朵并不是被雷吉奇卡斯打炸的，而是自爆的，雷吉奇卡斯力量太过强大，艾路雷朵的身体根本承受不了，就是雷吉奇卡斯都是需要时间来启动自己的全部力量。
“可恶！”阿豪看着艾路雷朵被自己害死了很是心痛，艾路雷朵是自己的第一只神奇宝贝也是一只有着含义的神奇宝贝，阿豪是个格斗系神奇宝贝训练家，娜姿是个超能系训练家，艾路雷朵是超能系加格斗系的，在第一次他们相遇时娜姿送给他的拉鲁拉斯蛋孵出来的，过去的一幕幕在他脑海中闪过，他想起来了过去……
“云之彼端，梦想的地方！”这是阿桂在石英大会上对阿豪说的，阿豪抬起头，看到的只是硝烟弥漫的天空，但是，在空中挂着一轮彗星。阿豪顿悟过来，雷吉奇卡斯打炸地球的力量只不过是个假象，正真的破解之法就是这轮彗星。
阿豪看了看在另一边与世界初始之树战斗的娜姿，接着看向了阿桂，用只有阿桂听得到的声音说道：“我累了，想停下来休息一会！”阿桂点了点头，随即他听到阿豪的身体发出一阵齿轮转动的声音。
“时空齿轮！”阿豪喊道，在另一边战斗的大吾身体一愣，阿豪有两颗心脏，一颗是时间齿轮，一颗是空间齿轮，当两者结合时就会拥有操作时空的能力，看来阿豪对娜姿的爱已经超出了灵魂的深度，超越了时空的限制。“阿豪！”在与世界初始之树战斗的娜姿注意到了阿豪的状况，她知道现在他既然用处这招，就说明他想起来了！
……
四年前
此时的娜姿还是个可爱的小女孩，刚刚接触超能力，但这是她爸爸逼她的，她自己并不想学，她爸爸把她送到丰源地区卡纳兹市上学，在学校，她邂逅了阿豪，将自己沙奈朵的蛋给了阿豪，但是，不知道从什么时候起阿豪消失了，校方说他转学了，而她知道他不可能转学。
娜姿知道阿豪是得文制造有限公司社长的儿子，哥哥大吾更是冠军。她去问大吾，大吾却也用同样的理由回答她，而社长则是用公务繁忙来拒之门外。
从那之后娜姿脑海里都是在想他，心也越来越痛，于是她开始努力修炼超能力来麻痹自己，但是这还是改变不了她空虚的内心，直到阿桂在道馆里打败她，她才从梦中惊醒。
由于道馆被炸毁了，需要时间重建，她也出来旅行看看世界，或许在某个地平线上会有他的身影。当她在寻找他的旅程上走着时，身后传来了一个熟悉的声音：“前面的训练家，可以来一场神奇宝贝决斗吗？”
娜姿看到了熟悉的身影，但是，他也发现了，阿豪不记得自己了，还有，她用超能力发现了阿豪是机器人，但她敢确定这就是她所认识的阿豪。
后来娜姿找到了大吾，大吾这次不得不说出真相：“阿豪其实是得文制造的一个机器人，但是，在四年前，他生病了！”娜姿不解的问道：“这怎么可能，机器人怎么可能生病？”
“是啊！机器人怎么可能生病，而且使用了最先进的液态金属皮肤，可以万年不腐，有无限能量，可以永远运行下去……可是，还是生病了，因为，病名为爱！其实他自己也知道了他是机器人，他生病时整个机体都是在瘫痪状态，意识也是在沉睡状态，我们花了四年时间，最终给他换上了另外一颗心脏才将他修好了，但是，不知道为什么他所有的记忆消失了，包括他自己是机器人这点的记忆也消失了。”大吾说道，阿豪虽然是机器人，但是大吾待他如亲弟弟一般，他也是最清楚阿豪“病情”的人。
“但是，他在醒来后捂着胸口说，为什么这里好痛！我知道这病是治不好的了，我听说你在关东地区做馆主，于是就叫他去关东地区旅行。”大吾说道，娜姿早已是湿润了眼，于是她决定就算他记不起她也好，只要在一起这就够了。
……
“时空加速！”阿豪抬起手，对彗星周围的时空进行加速，彗星只能存在七天，也就是说一旦超过七天后雷吉奇卡斯的力量就会变回正常雷吉奇卡斯的力量，基拉祈也会因此沉睡1000年。
“快阻止他！”赤焰松有些急了，立马命令雷吉奇卡斯攻击阿豪，然而，阿豪剩下的五只神奇宝贝挡住了雷吉奇卡斯的一拳，五只神奇宝贝被打炸，雷吉奇卡斯再次朝阿豪一拳挥去。
“虚数时空！”阿豪一边对彗星使用时空加速一边给自身使用虚数时空，这招可以让阿豪处在一个虚幻的时空当中，躲避现实时空的攻击，但是，雷吉奇卡斯的力量已经到达使时空扭曲的地步了，虽然阿豪没有直接受到伤害，但是时空扭曲带来的伤害还是使阿豪机体破损。
雷吉奇卡斯继续对阿豪轰击，阿豪周围的时空越来越扭曲，他的机体已经是被扭曲得支离破碎，娜姿看着这一幕早已是眼眶湿润她大声的喊道：“快停下，快停下……”阿豪笑着对她说出了最后一句话：“我生病了，不治之病，病名为爱！”
说完后，阿豪爆发出了自己全部的力量，彗星的七天时间已经到了，彗星消失，基拉祈化为结晶沉睡于地下，雷吉奇卡斯的力量恢复到正常力量，并沉睡过去。
阿豪的机体回到了现实时空中，然而已是破碎不堪，只有那时空齿轮还是完好无损，赤焰松则是在时空中泯灭，阿桂手一挥，时空齿轮飞进了他的身体里，成为他第五个心脏：“休息好了，就要上路了！”
娜姿停止了哭泣，对阿桂说道：“我想成为他休息时的大树，给他树阴和穿过叶间的阳光！”说完，她转向世界初始之树，眼神无比坚定：“心灵互换！”心灵互换这招如果是神奇宝贝使用的话就会互换自己和对手之间的能力变化。而如果是人使用的话就是真正意义上的心灵互换，或者说是灵魂互换。
世界初始之树现在有两个灵魂，一个是梦幻，一个是雪拉比，两只都是超能力系的幻之神奇宝贝，精神力无比强大。她要一次与这样的两个灵魂互换的话就会使她的精神力枯竭，超能力者一旦精神力枯竭就意味着死亡，但是，她还是选择这样做了。
梦幻、雪拉比和娜姿交换了灵魂，梦幻、雪拉比在娜姿的身体里，因为娜姿的身体正真意义上的已经死了的原因，就算是它们使用心灵互换也使不出来。
则进到世界初始之树里的娜姿发现自己已经没办法操作世界初始之树了，因为精神力枯竭的她能保持灵魂不散就已经很不容易了，这时，世界初始之树内一个声音说道：“波导与你同在！”一个人影在世界初始之树内浮现，正是波导的勇者亚伦。
由于阿桂帮他解决了那场战争，所以他并没有像剧场版《波导的勇者》里那样因为精神力枯竭而死，而是老死以后灵魂依附在世界初始之树上等待着某一天阿桂再来这里，要向他道谢。
此时阿桂也正在看着这一幕，精神世界里的泣忌也有些激动，阿桂没想到自己的一件举手之劳换来了这关键时刻的帮助，亚伦朝阿桂深深的鞠了一躬以表示当初的感谢，然后把手发在世界初始之树的核心上；“波导与我同在！”
亚伦将自己所有的波导力都交给了娜姿，亚伦的波导力也就是一种精神力的体现，精神力的表现有很多，超能力者、灵能力者、波导能力者……但是不管是什么，一旦精神力枯竭都将死去。
亚伦的精神力才只到娜姿原本的18分之一，这精神力操作世界初始之树比较勉强，但还是够了，阿桂从刚才开始就想分给娜姿精神力，但是，娜姿没有接受，而由于亚伦是直接触碰世界初始之树的，就算娜姿不接受也没办法。
娜姿没有丝毫犹豫，靠着这仅有的精神力操作世界初始之树，世界初始之树的树人外表开始收缩四肢和头部，变回了原来的树形，然后继续缩小，不断的搜小，从苍天大树变为大树，从大树变为小树，又从小树变成一颗种子。
种子朝阿桂飞去，没入胸膛变成了他的第六颗心脏，排列在时空齿轮旁，在没入胸膛的那一刻阿桂就感受到娜姿的精神力这次已经是彻底枯竭了！
……