“公爵”杜克最近过得很不好！
签了生死状的他押运纳米弹头途中遇袭，所有成员只剩下他和“开伞索”活了下来。
虽然最终被霍克将军领导的特种部队救了一命，但纳米弹头还是丢失了。
这样一来，就不会出现麦卡伦为了找回纳米弹头，在特种部队秘密基地内重新激活弹头装甲箱信号的一幕。
虽然电影里最终抢回了弹头，却让霍克将军领导的特种部队怀疑到了麦卡伦跟袭击杜克和基地的神秘组织的关系。
王琦要的是一个隐藏在暗处无人得知的秘密基地，马尔斯公司也是他需要的，麦卡伦跟眼镜蛇组织的关系不能曝光，不然沿着麦卡伦这条线查下去早晚会被人发现蛛丝马迹，所以他带走了纳米弹头，导致杜克任务失败。
不过现在也有一个坏处，王琦还想要隐身衣，三角洲动力装甲等技术，就需要找到特种部队在埃及的秘密基地位置。
此时杜克已经加入了特种部队，他想要变强，需要队友，希望查出真相为战友复仇。
霍克将军一开始并没有同意他的加入，直到杜克把他和安娜的关系说了出来，以保卫家国为目的的特种部队同样希望查出袭击杜克队伍的神秘组织，这才同意了杜克的加入。
王琦命令麦卡伦直接以杜克押运失败为由，把他告上了军事法庭。
杜克不得不结束了在特种部队基地内的特训，出现在外界，应付到来的审判。
有霍克将军的帮助，加上王琦对麦卡伦的授意，这点麻烦很快就被摆平了，杜克重新获得了自由，就在他出了军事法庭，准备离开回归基地的时候，安娜出现了。
王琦通过控制器，让安娜出现在杜克视野，然后迅速逃离，杜克发现后不管不顾追了出去。
不仅因为他和安娜是曾经的恋人，还有他希望抓住安娜，找到真凶。
两人速度太快，特种部队派来接应杜克的人没反应过来就失去了他们的踪迹，不多久，安娜把杜克引到了一个偏僻无人的地方。
“安娜！”杜克神色复杂，“你这些年去了哪里，为什么要这样做？”
“你很快就知道了。”安娜看着杜克，话语虽然平静，脑海中却有一幕幕过去的画面闪过，内心不断挣扎着。
杜克还想要说什么，突然眼前一黑，失去了知觉昏倒在地。
王琦从他身后走了出来，“好了，任务完成，我们走吧。”
说着他提着杜克，带着安娜通过穿越回到了北极基地，把杜克放在了手术台上。
操控纳米溶液注射的器械十分简单，王琦已经完全能够掌控。
安娜看着躺在手术台上昏迷的杜克，无数零散记忆片段涌现在脑海中，眼神不断露出挣扎之色。
越来越多的散杂记忆终于拼凑成了完整的画面，安娜终于清醒了过来，纳米虫的控制被她压制下去，就在针孔要扎入杜克体内的时刻，一击向着王琦偷袭而来。
白幽灵如影子一样出现在安娜身侧，拦下了攻击，却没对她下手。
“不！！！”安娜痛苦大喊一声，看到纳米溶液针剂扎入杜克体内，一点点注射进去，她的眼泪不由自主噗噗掉落下来，瘫软在地。
王琦给杜克注射完后，走到了安娜身边，观察着她。
纳米虫不是万能的，就算是武力不高的安娜，也能摆脱控制，这可能是因为情感或意志精神等方面的原因造成的。
不得不说雷克斯很有眼光，能够发现自己的亲姐姐与众不同之处，甚至直接拿来当实验品。
若是雷克斯还活着，安娜现在的状态，或许能研究出点东西，或者做出改进，强化控制效果。
不过这样的人太危险了，王琦也不后悔杀了他，此时安娜仿佛失去了灵魂一样，瞳孔没有焦距。
“把她先关起来。”王琦对白幽灵下了命令，然后把一个未激活的触发信号装置放在了杜克身上隐秘处。
抓着杜克回到了之前追赶安娜的地方，扔在了地上，躲在某处，一直等到特种部队的人发现了杜克，他才离开。
回到基地，来到关押安娜的地方，此刻她已经恢复了神智，整个人像是生无可恋的样子，看到王琦后死死盯住了他，眼中放出的是死仇的目光。
“你这个恶魔，不得好死！”
王琦自嘲一笑，随后又露出不屑，冷漠反问道：“你还不知道吧，给你注射纳米虫的，就是你最亲爱的弟弟雷克斯，他也是眼镜蛇组织的医官，如果我是恶魔，那他又是什么？”
“不可能！”安娜惊叫起来，然后表情变得疯狂，冲向了王琦，“污蔑我弟弟，我要杀了你！”
王琦一招制服了她，拍了拍手，白幽灵带着雷克斯的尸体走了进来。
医馆的打扮安娜是熟悉的，直接就认了出来，有了王琦先前的话，她不顾一切挣扎起来，王琦放开了她，她扑在了医馆尸体旁，一把掀开了面罩。
啪嗒~
面罩掉落在地上，医馆被烧毁的面容出现在安娜眼前。
看着这张熟悉的脸，就算是毁了容，安娜也一眼就认了出来，这个人的确是她的亲弟弟雷克斯。
回想起自己被注入纳米虫的那个晚上，又有谁能够悄无声息潜入她房间？自己的经历又是谁安排的？
一幕幕回忆起来，安娜终于崩溃了……
王琦叹息一声，离开了这里。
没过多久，白幽灵出现在他身后，“她自杀了。”
王琦没说话，静静地发着呆。
电影里安娜没死，也不知道真相，虽然被监管在医院中接受治疗，却未必好到哪去，毕竟第二部的时候连公爵杜克开始就死掉了，她活着也许会更痛苦。
如今这样的结局，王琦也不知道是好还是坏，自己没有亲手杀她，却跟亲手杀了她没任何区别。
伴随着自己的力量越来越强大，经历越来越多，人生悲欢离合，酸甜苦辣，王琦总有一些特别的感触。