佐渡本间家自从归顺以来格外恭顺，羽茂城城主本间高信，杂太城城主本间泰高、太田城城主本间秀氏、久知城城主本间与十郎，等本间一族每人轮换一季长驻春日山城，作出一副十分恭顺的态度。
事实上他们不恭顺也不行，佐渡港掌握在吉良水军的手里，九鬼重隆一年的时间起码有五个月驻守佐渡港，在吉良家的大力建设下，佐渡港比以前扩大两倍有余，佐渡港町内的纯木制结构也换成土木式结构，敷上三合土的草葺木屋比原来更结实暖和。
吉良水军的主力常驻新的佐渡港，把佐渡的本间家及国人众压的喘不过起来，出海的重要港口被捏住，佐渡水军主力被剿灭残部被收编，本间家以及佐渡国人已经无力反抗，只要吉良义时愿意，完全可以把他们全部抹去。
生存的压力迫使本间家全体臣服春日山城，接受长尾家的军役和税赋厘定，接受检地和农业改革，整个佐渡两万石土地需要负担一千五百军役，其中五百名常备被安排在新潟町的下越国人常备军团内接受训练。
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根据弘治二年吉良家常备法度的要求，整个越后的军役帐将进行新一轮改革，常备军团的提议也在半年前被酝酿出来，以军役帐的三分之一为常备军团，接受长期专业化训练，常备足轻并非世袭，而是以两年为标准在军役帐内进行轮换，在负担常备军役期间食宿由各家领主大名统一支付，具体费用在每一年的财政预算中单独列出。
这个常备军团的主要含义在于快速机动的职业军团，确保在任何情况下都能有常备足轻随时调用，各常备军团的大将由长尾家谱代众担任，备队大将根据军役及国人众分部情况统一确定，这个军役体系完整的囊括整个越后各个阶层，职业化常备军团，职业化足轻。半职业化同心众，预备役少年各梯次都有足够的兵源，其主要战力还是前两者，后两者暂时作用不大。
九鬼重隆的小儿子元服名为九鬼隆持，年纪虽小但厮混水上的行伍时间却接近十年，甫一元服就担任水军组头，作为吉良水军的代表负责监督在建十艘的安宅船。以及八十艘关船的建造进度，很显然他父亲不单单想让他做一个水军大将。
佐渡岛的金山开采对佐渡国人来说意义不大，金山开采的多寡与没有他们一分钱关系，相比之下农业改革更让人兴奋，佐渡岛受到北部日本海的海洋性气候影响，农业发展一直缺乏建树。诺大的一个岛石高只有两万石。
但佐渡岛上实际耕地面积却有七千町步，初步探查实际可耕作的农田有一万一千町步，其中没有包括高山，森林以及沙滩，以及城池等不可耕作的土地，如佐渡海港附近的一千五百町步土地，半数以上是沙化严重的的极下田。通常这种土地耕作意义和价值太低是不作为耕地计算和使用的。
另外不到半数的土地里仍有一半是沙土下田，一小半多才是中田，上田一共也才一百多町步，所以实际上给吉良家的土地有一大半不算耕地，只有大约七百町步是真正意义的耕地，不过吉良家需要的是佐渡港以及重建港町，附近的这些耕地都属于附送性质的到也无所谓。
那么一万一千町步是什么概念呢？整个越后如今的耕地面积还不到十万町步，虽然这与越后农业开发有极大。但初步估计整个越后的耕地面积大约有二十五万町步，其中新潟地方就有十万多町步的耕地，其耕作潜力是巨大的。
佐渡岛上的耕地面积相对狭小的岛屿来说是非常多的，七千町步就是七万反耕地，在几年前的越后怎么也能产出七、八万石粮食，但在佐渡岛才只有两万石粮食，这其中虽然有海洋气候的因素影响农时。但更主要的原因还是佐渡不会耕作，甚至根本不怎么耕作。
佐渡作为罪囚流放之地，历来就不被人重视，镰仓时代派驻地头也是粗放式管理。到如今千年的时光，佐渡岛还是停留在刀耕火种的水准上，有些国人撒上稻种就不管不顾了，到秋天有多少就收多少，一反土地秋收才能收到四五斗粮食也是常有的事，有些惫懒的领主自家野草比稻子长的还旺盛，也不知道他们种的什么田耕的什么地。
吉良家的农业改革进入佐渡后做的很彻底，撤并新村，拆除支城，一个小小的佐渡岛上密密麻麻的城砦有六七十个，能称得上城堡的也就四座，其他大一些的算是土楼山寨的标准，更小的连强盗野伏的山寨都不如，一把火就能把小木寨给烧掉的水平。
这种破烂东西要他有何用？全部拆除成为必然之举，整个佐渡岛只留下四座城堡，久知城因为太小最终也被拆毁，本间与十郎用部分领地换来河原田城，本间家的所有国人全部迁入新村内设置居馆。
随着这次撤并新村的推行，佐渡岛内的知行地也进一步转封调整，打下河原田城获得的土地零敲碎打的不宜管理，这一次转封把各自的土地区域划分出来，各国人领主的耕地都集中在一起，减少发生土地纠纷和冲突的可能性。
吉良义时派出的奉行官与佐渡国人达成协议，吉良家将负责对佐渡岛内所有国人领主的农业进行改革，提高粮食产量达到越后的标准水平，同时要付出的代价是佐渡岛内开发的新田将全权归属吉良家。
天下没有免费的午餐，吉良家用农业改革换四千町步的耕地是你情我愿的交易，即使佐渡国人有心拒绝也没能力开发那些荒地，自家耕地都荒废的不成样子，开发荒地一点意义都没有。
初步要兑现的承诺的两年内使佐渡岛粮食产量提高到七万石，五年内，整座岛屿的总石高突破十五万石，这个难度其实并不高没有规定谁的土地，而是整个佐渡岛粮食总产粮，佐渡也没有什么干潟，少量沼泽直接建圩田就好解决，顶多规划一下河流的灌溉的河网，其实还是很好开发的。
五年内把整座岛屿的一万一千町步耕地开发出来没有任何问题，一万一千町步按照一石的标准产量就是十一万石，开发是很好开发，爆出一反产粮三石，或者稻麦两季轮作产粮五、六石是很困难的，也许需要十几年甚至二十年的时间悉心研究当地气候才能做到。
佐渡岛的真正大头其实不是耕地而是渔业，佐渡的渔民在北陆还是有些名气的，具有丰富经验的渔民甚至可以捕捉到鲸鱼，吉良义时有心发展捕鱼业，所以命令奉行众张贴公告招募渔民，组成几支船队常年在海上捕鱼。
普通的渔船不提，直江津港内的造船厂日以继夜的赶工制造安宅船、关船之外，还有建造安宅船标准的捕鲸船，这种安宅船形式的捕鲸船吃水大概一百五十吨到一百八十吨之间，捕捉普通鲸鱼是没有问题的。
另外吉良家正在佐渡兴建一个造船场，预计明年可以建成，到时候可以在佐渡本地建造安宅船、关船以及各式迴船、小早、渔船，对佐渡的扶持力度也是看得见的。
另外一个有利于佐渡发展的规划是屠宰肉类加工业，这个是比较秘密的行业，屠宰业是日本一种不算进户籍，不统计人口的族群在做的事情，在日本古代屠宰牲畜制作皮革是污秽的职业，他们叫做河原者，又被称作贱民。
河原者是个很悲惨的族群，他们不是某个种族或者某个姓氏，而是一群自古就有是贱民族群，他们被赶出城市村庄，整日居无定所以乞食、收尸、屠宰牲畜制作皮革，帮人挖井戸，卖唱卖笑卖肉的芸能者，猿乐师，出苦力抗打包的运搬工，籍籍无名的小商人，造园师等职业。
混的比较好的如造园师善阿弥，就是室町幕府八代将军足利义政的庭师，银阁寺的庭园就是他设计制造的，还有観世家的先祖世阿弥也是河原者，曾经就有人当面说他是贱民，基本上猿乐师出身的家族都是河原者。
他们也是河原者里混的最好的，混的比较差的就是收尸、乞食、屠宰牛马还有肢解死去的动物制皮，干点没技术含量的泥水活计，出把力气之类没人愿意干的工作。
吉良义时就通过吉良忍者，悄悄将关东、北陆地方善于屠宰的河原者聚集起来，在佐渡岛这个比较偏僻隐蔽的地方进行屠宰和肉类加工，这也是无可奈何的权宜之计，总不能让操刀子杀人的武士整天去宰杀牲畜，一次两次为了口腹之欲是可以理解的，若是长此以往让他们就专干屠宰牲畜的事情肯定是不行的，这会被当作侮辱和惩罚。
这个时代就是食素，偷偷吃荤绝对没问题，但前提是你自己动手，鹰狩就是给所有武士一个吃肉的幌子，说什么鹰狩锻炼弓马之道都是冠冕堂皇之词，如节省吝啬的德川家康就酷爱鹰狩，一生鹰狩上千次之多，具体那打来的猎物干什么了大家都能理解。
越后牧场里的牛养猪等动物会被运送到佐渡岛内进行屠宰，分割出需要的肉类排骨之后再封箱运回到越后的各个屋号里进行处理销售，虽然手续麻烦了点，但为了隐蔽和安全还是没办法的事情，有吉良水军给兜住也不怕走漏风声。。)