几年后，石广廷偶遇神针门人，被认出自己就是失踪的长老，其时神针门已经发现了石东元的尸体，并怀疑是逃走的石广廷所为，当由于没有证据，所以也没有向外界公开，只是吩咐门人寻找石广廷。石广廷惊惧之下，将这门人杀死，匆匆离开了s市。
临走前，不知是否真的和叶之秋有了师徒之情的关系，石广廷把神针门一无心法的入门第教给了叶之秋。他顾虑到自己行踪败露后，可能会拖累孙女，所以将石芷容托付给叶门，然后开始了四处流浪和秘密试验的生活。
石广廷在一次偶然的机会下被青龙所擒，青龙正好同过易娟得到了邪云宗的魔人秘典，在得知石广廷的才能和经历后，将秘典给了他，表示愿意提供完备的实验场所和一些所需设备、试验品供他试验。石广廷大喜，当下表示愿意效忠青龙，青龙给了他一点力量，并让他四处招揽医术人才研习完善和制造魔人的方法，就这样，石广廷成为了青龙麾下的魔帅。
石广廷的经历听得叶之秋目瞪口呆，叶之秋此时方才相信自己当时在七宝妙境中修炼精神力量时，所看到的往事中师父那阴冷的反面形象居然是真的。石芷容这才知道自己父母竟然是爷爷亲手所害，当场晕了过去，醒末后躲在叶殿怀里泣不成声。看着这位昔日封自己有恩的师父，叶之秋欲言又止，叹了口气，任由叶门弟子将石广廷押走。
与青龙的激战已经告一段落，现在急需的不仅仅是追查青龙的下落，更重要的是恢复基地的研究，并尽早研制出破解D病毒的方法。
这次大规模袭击事件也引起了全世界广泛的关注，浮出水面的D病毒灾难制造者——青龙也受到了全世界各种与论的谴责，当然，这种俗世的与论对青龙来说简直是对牛弹琴，除中国外，各国那些自发组织起来对抗青龙的修士们自然也不放在他的眼里。经此一战后，青龙成为了全世界各国的头号公敌——拥有控制数十万甚至是全部变异人类、自身还拥有不知名异力的可怕邪魔是任何一个国家都不敢姑息或轻视的，许多联合抵抗青龙的非官方组织也纷纷出现，然而，人们最关注的是被青龙袭击的中国“抗D”研究基地，虽然中国政府封锁了消息，但这并不能影响媒体的炒作和宣传，一时间弄得沸沸扬扬，很多想像力丰富的人甚至猜测基地已经研制出能够有效解决D病毒的有效药物，所以才会让青龙不惜暴露身份发动大规模袭击。
国内对这次事件也相当重视，在重建基地的同时也增派了大批精锐部队保护，统一配备了具有大规模杀伤力的先进武器，修真者们也加强了驻扎基地的人手，抛开正邪道的成见，成立了守望相助的“灭魔联盟”。
就在适时，让叶之秋遗憾的消息传来——苏冷月要走了！
苏冷月离开基地的理由是，要回去坐镇水月流，防止青龙突然袭击，动摇门派的根基。但圣者同盟中人都知道，她离开的相当一部分原因是因为迫在眉睫的三门约战。
苏冷月虽然选择离开，却特意将苏芳云师徒、若曦和雪宗弟子留了下来，让唐凌十分高兴，苏若曦的留下也给了在与青龙的暗示对抗中的黄浩最大的动力。
叶之秋此前在基地中虽然多次想找苏冷月谈心，却都被避而不见，实在是在路上碰见了，苏冷月也只是冷漠地点了点，形同陌路。然而，在这临别之时，叶之秋却意外地得到了苏冷月的接见。
这次见面的时间出奇的短，事后据一旁的水月流弟子透露，从头到尾两人几乎没说什么话，基本上都是一种对视默然的状态.“这个……给你。”叶之秋将一个晶莹的东西交到了她的手中。
苏冷月目光一闪，飞快地扫过那东西，点了点，说道：“很好！你果然已经具备了这种力量，我已经听说你在叶门的身份了，我期待着，你在三门约战上的表现.”
叶之秋没有再说话，默默地注视了她一阵，然后告辞离开.在叶之秋走后，苏冷月盯着那颗有些象是莲子般的晶莹物件沉思了半天，终于招呼弟子启程离开.随着各地疫情的加重，基地内的研究人员也感到了肩上沉重地担子，好在有叶之秋的加入。大大地加强了基地内的研究力量。人们没想到，这位青衣门的长老不仅拥有超级的力量，而且脑中的知识也是包罗万象，毒术、医术、炼金术无一不精通，更兼有慕容浅静这样的超敞美女倾心，让人羡慕。
让他们惊喜的是，叶之秋的到来，不仅仅是解除了青龙攻击基地的威胁，而且还成为了破解D病毒地关键.叶之秋利用精神领域从石广廷的脑中获得了不少关于D病毒地信息，结合研究基地人员们的资料。最终确定D病毒竟然是一种带有法力甚至是智慧地细菌。这种“灵茵”具有顽强的生命力，能吸收人体内的奍分。并慢慢自我壮大，直至控制整个人体发生可怕的变异。更麻烦的是。它们不仅传播迅速，而且具有可怕的适应性和自我爱种能力，一般的药物根本无法奈何得了它们，就算是八斗和基地人员一同研制出地抑制药物，也只能暂时控制D病毒，一旦它们适应了这种药物，那么病情就能再次复发.与“灵菌”们适应的速度相比。八斗他们研制的新药物的速度要慢得多，就好像抗生素与病毒的耐药性关系一样。
叶之秋仔细查阅了《吕岳瘟经》，发现虽然D病毒与吕岳当年在封神之战时，散布在西歧的瘟疫有些相近，但却不属于《吕岳瘟经》中瘟毒地任何一种.当年的瘟疫相传是杨戬去火云洞求三皇中的神农相助才解除，如今上哪里去找这个虚幻地神农？
叶之秋也知道自己对西医并不精通。尤其是这种高难度的生物科研工作。但他没有气馁，一边学习的同时一边发挥自己中医方面的特长，居然以炼制法器的炼金术制造出一台相当于法器显微镜功能的阴阳观微仪.能以肉眼观察出放大N倍的D病毒的法力活动和阴阳平衡，让大家喷喷称奇。
虽然基地的研究人员花费了大量的心力，但破解D病毒的进度依然停滞不前，看来，这个魔帅石广廷口中“无解”的病毒，确实是相当厉害。此时各地不断传来抑制药物失灵的坏消息，而先前和魔军战斗过的修真者，也开始出现一些轻微的症状，身怀高浓度D病毒的乌龙状况却是一天比一天差劲，有几次甚至差点变异，黄浩的情况也很不稳定——这些都让众人的心中更加沉重。
怎么样才能对付这种讨厌的灵菌呢？
和基地的许多人一样，叶之秋看着一叠数据苦思着，这时候精神力忽然传来一阵奇异的波动，他知道又是琼霞在召唤自己进行那个融无双修了，不由一阵苦笑。
这段时间里，琼霞似乎是对双修之术食髓知味，就算没有到叶之秋帮卡罗琳女王以双修街稳固意识和力量的限定时间，她还是每天都要呼唤叶之秋进行融无双修街。更让人刺激的是，在双修时，由于琼霞会变化成卡罗琳女王或是雅典娜的模样，所以叶之秋经常要充当“一夜三次郎”的角色，也算是换了个形式享受了一把男人通常梦想的“齐人之福。”
卡罗琳女王虽然失去了身体，但也总算如愿以偿，可谓有得有失。
叶之秋犹豫了一阵，还是把这件事告诉了慕容浅静，气得知情的八斗在背后骂他蠢蛋。慕容浅静本来和卡罗琳女王就是好朋友，知道她舍身自爆的事情后，一直十分难过，现在听说了这件事情，虽然心中有些不是滋味，但也为好朋友依然健在的感到高兴.慕容浅静此时的力量已经达到一个相当的高度，再次与叶之秋尝试过双修融元之后，感觉效果非凡，不仅力量感觉有所增进，对那种美妙的感觉也不由有些迷恋。当然，她和叶之秋之间可并不仅仅是精神力量的交流，更多的是激情和柔情交替中的肉体愉悦。
慕容浅静知道琼霞和卡罗琳女王只能在精神上与叶之秋融合，而且这样对叶之秋的力量也是大有帮助，渐渐地，她放下了心中的不快。不过似乎是出于竞争或是迷恋那种奇妙感觉，慕容浅静和叶之秋双修次数也在不断增多，加上琼霞她们在内，有时叶之秋甚至要作“一夜七次郎”……所以不时受到八斗的取笑。害得他经常躲进七宝妙境里面双修完才出来。
搂到琼霞的召唤后，叶之秋马上进入了七宝妙境，此时关押在森林藤牢中地任天创已经那些蔓藤被吸收得几近虚脱，每天是只呆滞地看着周围的景物，连挣扎或叫骂的力气都没了。叶之秋对任天创深恨不已，所以并没有给他一个痛快。