在这次朝会后的第二天，朝廷正式发布了太子李贤谋逆被抓获，并对其处理的诏令。
诏令中宣布，除李贤的太子位，废其为庶人，剥夺一些职爵，禁于宫中；改立英王李显为太子，并大赦天下。
这份诏令中的意思已经是武则天退让的结果了，最初她是要“杀”李贤的，后来也是准备将李贤流放至岭南，但李治不同意。李治原本是想将李贤降为郡王，这意见武则天不同意，最后李治只能屈服。可以说是诏令中的意思是两人各退了几步的结果，这样的处理意见让李治非常的难过，很受打击，再次卧床不起了，武则天却是精神饱满地处理起李贤谋逆的善后事宜来。
李贤被废，没任何根基的李显当了太子，李治又卧床不起，很多大臣们又全都战战兢兢中，生怕李贤的事牵连到自己，武则天做起事来顺手顺脚了。
从东宫搜出来的数百件武器甲胄被运往人流最密集的西市当众焚毁，并将焚毁的原因以布告的形式张贴在长安城内各往，武则天就是要让普天之下的人都看清楚和她作对会有什么样的下场。
李贤身边的近臣非常多，大多都是反对武则天干政的，原本她就对这些人非常看不顺眼，借着李贤谋逆的机会，武则天借机发动清洗，所有曾和她不合的宰相及其他重臣无不波及。
太子心腹，位列政事堂的左庶子、检校中书令张大安首先被重处。左庶子、检校中书令的位置自然不保。被革了职，并被降了爵位后，张大安再遭流放，贬为普州刺史。
因李贤谋反未成形，对其仆从者的处罚也相对轻一点，像张大安这样的大臣，是不会处以极刑了，要是谋反开始付诸行动了就不一样，就如李承乾时那样，作为主要仆从者侯君集就被杀了。
尚书右仆射兼太子宾客戴至德也被罢相，降职为户部侍郎。戴至德是贞观时候的名相戴胄之后，生怕耿直，为官清廉，在任时候做出了许多让人称道的政绩，这也是他能继续在朝中任高官的重要原因，但不再位列政事堂，在朝中的发言权大大地下降了。
同情李贤，曾在朝会上为李贤求情、并私下议论过此事的郝处俊罢政事，只任太子少保。
同样不希望重责李贤的李义琰被迫辞相，并申请致仕，告老还乡。
侍中张文瓘也被免了宰相位，但因为其名声非常不错，多年以来为官的政绩也不俗，在此次李贤谋逆的事件中并没什么参与进去，罪责不大，改任其为大理寺卿。
参加审查此案的高知周虽然没有被涉及，但因为内疚，随后就提出了辞呈，告老还乡去了。
积极参与太子谋逆之事的太子洗马刘讷言被流振州，而赵道生等人则被斩首示众。
太子李贤交游广阔，王公大臣中好友众多，这些人也都逃不过武则天的报复清洗。
曹王李明、蒋王李炜、东阳公主，乃至一众开国功臣的后人都被牵连进来，全部流放出京。
曹王李明、蒋王李炜都是李治的弟弟，其中曹王李明因与李贤过于亲密，在担心留有后患的武则天逼近下，自杀身亡。说来曹王李明还是武则天表姐巢剌王妃杨氏唯一的儿子，武则天此举也算是将大义灭亲做到了极致，丝毫不顾及什么“亲戚之情”。
蒋王李炜被降封为零陵王，贬至黔州，就是后来贵州那地方。
东阳长公主是李世民的第九女，下嫁高士廉之子高履行，因为长孙无忌之案，东阳公主已经被处罚过一次，此次因为高家再次被牵到李贤的案中，被剥夺邑封，和两个儿子徙置巫州。
而武则天对高家的处置，堪称手段达到了极致。
高士廉是长孙无忌和长孙皇后的舅舅，长孙无忌一案中高家已经受了一次打击，但世家大族毕竟根深叶茂，后来李治也有意和解，所以还是有不少人担任高官。高士廉生有六子，其中高履行、高审行、高真行在朝中任要职，长孙无忌案时候，高履行被贬，死于永州刺史任上。
高审行现在任户部侍郎，高真行为左卫将军。高真行之子高政为太子典膳丞，被牵连到李贤案上，武则天顾及李治的“面子”，也不多说，把高政交给其父高真行处理。
早被皇后铁血手段吓怕的高家已经是惊弓之鸟，为了保全自己，保全高家，每个人都在惩治倒霉亲戚家人方面表现出人性中最残忍的一面。为了表示自己的“忠诚”，他们用最血腥的方式来表示和参与谋逆的至亲划清界限。
倒霉的高政没受到朝廷的处置后，还以为得到了特赦，但他没想到的是，得“特赦”后刚一进门，他的父亲高真行就用佩刀刺向他的咽喉，接着伯父高审行一刀砍入他的小腹，高履行的儿子、高政的堂兄高琁挥刀砍下他的头颅，然后残忍的亲人们把高政这具残缺不全的尸体扔到了大街上，弃之不理，表示他们一家对高政这样大逆不道行为的痛恨，并马上上表向李治和武则天表功。
武则天是没想到过高家的人会做出此等血腥之事，但高家的事无须她再进一步处理，李治出手了。一向温和的李治被这样冷血、残酷和无耻的举动彻底激怒，马上下旨重处高家一脉，将高政的父亲高真行和伯父高审行及行兄的堂兄高琁统统贬出京。高真行贬为睦州刺史，高审行为渝州刺史，高琁则被发配到安西大都护府任一名郎将，其他高家的子弟及家眷也全被赶出京，东阳长公主也没能幸免。
武则天在高家这场残忍的闹剧中收获了她想要的一切，甚至超过了她最初的想象，她轻描淡写的一句话，就让高家子弟自相残杀，声名扫地，最后还被贬出京，煊赫一时的高家就这么破败下去，再也没有机会翻身了，高家一脉不仅在实力上，而且在精神上都被她完全击倒，而武则天根本还没有出手，就取得了远超她预期的效果，这样的心机和手段，普天下何人能及！
有人被清洗，自有很多人在这次宫廷巨变中得到好处，主查此案，迎合了武则天意的薛元超被提为中书令，裴炎因为在查案可表现非常出色，深得武则天的赞赏，被晋职为守侍中，和裴行俭这位同族亲威共同执掌门下省；而另一名武则天亲自提拔上来的能臣李敬玄，被授以为检校中书令，并被封赵国公!
贺兰敏之因为在查处李贤案中立下了超过所有人的功劳，自然被武则天重奖，原本武则天想授贺兰敏之亲王爵，并令他领尚书右仆射职，但贺兰敏之因为对李贤有点内疚，不想借李贤的事获得晋升，再加上他感觉自己所负的职事太多，身处的位置太高，一再推辞，但武则天不许，只答应不授他亲王爵，最后的授令为：贺兰敏之领守尚书右仆射，兼领兵部尚书、太子左卫率如故，并领左羽林军大将军，同中书门下三品。
贺兰敏之的一些亲信也被授以新职，狄仁杰以刑部尚书职参知政事，加同中书门下三品衔，并加银青光禄大夫，张柬之被授以礼部尚书，并同中书门下三品，骆宾王被授以御史大夫职。
尚书省六部中，裴行俭兼任吏部尚书，贺兰敏之兼任兵部尚书，狄仁杰任刑部尚书，张柬之任礼部尚书，刘审礼任工部尚书，崔知温任户部尚书，原本反对武则天的人差不多都没有留任了，唯一一个对武则天不太感冒的刘审礼因为此次跟随裴行俭出征，没有被波及，依然官任原职，而且其兼任的检校左卫大将军中的“检校”两字也被除去。
原来宰相班列中戴至德、张文瓘、张大安、郝处俊、李义琰因故被除相位，新补李敬玄、裴炎、狄仁杰、张柬之，加上留任的侍中裴行俭，尚书右仆射刘仁轨，黄门侍郎来恒，改任中书令的薛元超，户部尚书崔知温也挂了个同中书门下三品，再加贺兰敏之，人数依然没变，不过其中的结构发生了巨大的变化，被除相位的都是反对武则天干政的人，新补的基本都是支持，或者不反对武则天干政的人。
可以说在这次宫变中，武则天得到了她想要的一切。
太子李显主要的幕僚有：左庶子、尚书右仆射刘仁轨，中书令、左庶子薛元超，右庶子、黄门侍郎来恒，右庶子、侍中裴炎，太子宾客李敬玄、狄仁杰、张柬之等人。可以说太子的属官大多都是武则天的亲信。
此次过李贤的事件，朝中反对武则天干政的大臣被去了大半，那些不赞成武则天干政的大臣，暂时也收敛了性子，无论在朝会时候，还是其他时刻，都不敢站出来反对武则天。
可以说，武则天在这次事件中取得的收获，比她原来预计的要多出好几成。
而贺兰敏之也在此次事件中收获颇多，不但两位亲自栽培的人狄仁杰、张柬之位列政事堂，骆宾王任御史大夫了，其他不少人也被授以了新职。因他举荐，李多祚任检校右羽林军大将军职，程务挺任左武卫大将军，李谨行任右卫大将军，刘冕为左千牛卫将军，李敬猷为右千牛卫将军，黑齿常之为右武卫大将军。其他不少的亲信也被安插在长安诸卫中，职位从将军到中郎将都有。
对于武则天来说，一个崭新的时代开始了，对贺兰敏之来讲，也可以用新的时代已经到来形容……