在确定浅井的威胁暂时消除之后，信长转而向宗教势力开刀。既是为了报去年本愿寺、延历寺的一箭之仇，也是为了更加孤立浅井朝仓。
此时，三好方面的举动实在有些令人玩味。他们不知是闲得无聊还是怎么回事，竟然在河内战事尚未结束的当口，又去招惹毛利这样的西国一霸，等于把毛利推向织田一边。
当然，他们在河内方向的战事也非全无成就，并引起了摄津的混乱。荒木的崛起不但将信长在此设置的权力体系彻底打乱，还吸引了信长部分兵力。
不过总的来说，元龟二年还是相对平静的。信长和包围网的主力浅井朝仓之间，并未发生大规模战斗。
暴风雨的前夕一般都是这么平静的，只有这样才能映衬暴风雨的激烈。暂时稳定了摄津的混乱之后，信长开始谋划着对浅井的进一步的战略进攻。
元龟元年九月稍作修整的织田军于再次出击，这次信长挑了个比较软的骨头：江南一向一揆。
乌合之众的江南一揆军这次完全不是对手，据点志村城很快陷落。顺道织田军在浅井家小谷城附近劫掠了一番。
九月十二日，织田信长为报比叡山协助朝仓浅井联军的一箭之仇，出兵包围了比叡山。
比叡山是佛家圣地，对许多日本人来说此地之神圣不亚于犹太人心目中的耶路撒冷。
织田信长带兵抵达比叡山附近的时候，留守京都的佐久间信盛急忙赶来，拦住了织田信长，说道：“主公大人，不可啊！比叡山可是佛家重地，不管怎么说，也不能出兵攻打啊！”
织田信长铁了心要给一向宗一些教训，对于佐久间信盛的劝告哪里听得进去：“滚开，要不是比叡山这群和尚，本家又怎会遭遇前一年的困境！”
佐久间信盛连忙说道：“主公大人，这件事情都是显如的过错，和比叡山没有太大的关系啊，毕竟朝仓浅井两家的联军势大，比叡山也是委曲求全。”
“可恨！”织田信长拔出佩刀直指佐久间信盛，说道：“你是谁的家臣，竟然给比叡山求情，就是因为这群和尚，本家才不得不向朝仓义景屈服。
该死，说起这件事情，吾就恼火，朝仓义景是个什么玩意，吾击败了他还得向他屈服！你可知道吾这一年来的煎熬！”
佐久间信盛旁边一名武士握住了织田信长的佩刀，他害怕织田信长太激动一刀砍死佐久间信盛，武士哭道：“主公大人冷静啊，佐久间大人也是为了大人考虑！
毕竟比叡山的影响力太大了，攻打这里的话，本家会出现更多的敌人，与一向宗就不能缓和了。”
织田信长冷笑一声：“呵，一向宗的那群和尚能把吾怎么样？今天吾那就要拿下这比叡山，看看这天下能把吾怎么样！”
他抽回佩刀，完全不顾武士的伤势，转头对身后的家臣们喊道：“目标比叡山！全部杀掉，一个都不留，山上的一切随意处置！”
佐久间信盛一听到这个命令，吓得魂都没了，正想上去劝告呢，直接被织田信长身边的近侍拖开了，不管佐久间信盛的哭喊，织田家大军冲向了比叡山。
“冲啊！杀啊！”织田信长传下去的军令刺激了所有织田家的足轻，乱捕在战国是很常见的事情，足轻们都靠这个发财，上杉谦信更是做起了人口买卖，这些都是乱捕抢来的。
如潮水一般的织田军冲上了比叡山，比叡山上的寺庙了只有不到一千人的僧兵，其他都是普通僧人，还有妇女儿童等等。
一千僧兵在数万织田军面前不过是一颗小小的水花，一下子就被淹没了，比叡山上很快陷入一片炼狱景色，火光逐渐出现。
一队队足轻冲入民房，抓出里面的居民，反抗的男子被杀死，然后足轻砍下他的人头，作为自己的军功，不管是老人小孩，都可以作为军功。
随后一间房子里只剩下一地的尸体，以及两名女子，她们已经被其他的足轻抓住了，在痛苦的哭喊中看着自己的丈夫，父母，儿子被杀死。
随后几名足轻笑嘻嘻的收起首级，将武器放在一边，然后冲上去办事。不管女人们的喊叫，办完事后，足轻们将年长的女人杀死，割下首级带走，随后让一名足轻将绑好的年轻女子抗走。
悲剧在一个又一个地方发生，织田军在别人的惨叫声中狂欢，他们杀人掳掠无恶不作之后，然后丢上一把火付之一炬，将罪证烧毁。
史载比叡山死者多达四五千人，尸体横七竖八铺满了整座山。
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比叡山上稍有姿色的女子以及女童都存活了下来，当然这不是织田信长仁心宅厚，这些全部被他赏赐给了自己的军队
织田军还纵火焚烧了延历寺中的根本中堂和山王二十一社，百余年珍藏下来的佛像、经文都被烧得一干二净。可怜繁华的比叡山，鸡犬不留。
看着远处的大火，佐久间信盛失魂落魄，而织田信长抬头大笑，他只觉得心中的一片怨气消散了许多。
织田信长的暴行震惊了全国，本愿寺的显如和尚发布宣言，大骂信长为“佛敌”。
从此织田信长于“尾张大傻瓜”外，又多了一个外号：“第六天魔王”。（佛教将世界分为“色”“欲““无色”三界，而“欲界”又分六天。所谓欲是指物质的五欲─微妙的色声香味触，男女的**。欲界分五天，从最下层起“四大天王”“忉利天”“夜摩天”“兜率天”“化乐天”“他化自在天”。此处的第六天魔王是为织田信长生造的）
织田信长此举坚定了武田信玄上洛的决心。同时成为佛敌后的织田信长，又将一向一揆以及浅井、朝仓方面的再度出兵。
武田正信在得知织田信长火烧比叡山之后，兴奋道：“好啊！出兵越前的时机就快到了！不愧是我的盟友，我把金泽御坊烧了，他居然把一座闻名天下的古寺烧了！哈哈哈！”