在女巫星，伯蓝玫瑰号被结社以不知明的方式瞬间摧毁，包括舰载光脑玫瑰，虽然果冻为玫瑰的核心进行了重重保护，但是最后果冻分析蒂法带回来的玫瑰的核心之后发现这个核心依然受到了攻击，虽然被破坏，但是想要让原来大家所熟悉的那个玫瑰重启，可不是一件容易的事情。
相反伯蓝玫瑰号星舰本身根本没什么难度，本来果冻就在计划着给玫瑰号进行一次大改造了，现在玫瑰号全毁，反而方便按以前的格局再建一个新的，在女巫星果冻可是又得到了不少好处，只是幽能发生器这一样，就足够让暗月号都大改一次，更不要说玫瑰号了。
但关键是光脑玫瑰。
说到这里，果冻的情绪一下子降了下来：“不行，玫瑰的意识已经被受到了重创，我可以重启她，她也可以保留大部分的记忆，但是却只是一个带着玫瑰记忆的新的光脑。再加上对方在她的核心代码里留下了极为厉害的病毒，要把这部分完全的剔除出去，我们最后能重启的，甚至只是一个普通的光脑，她连人格都不会有！”
人格智能光脑对于零队来说已经不再是什么禁忌话题，不管是果冻，玫瑰，克洛诺斯，暗月，还是蓐，全都是人格智能光脑，其中除了蓐，其他几个全都相当于果冻的分身，但又有其人格独立性。
因为受萧明的影响再加上长期和果冻的相处，零队的众人早就没有了普通人对人格智能光脑的抵触和看轻，对他们来说，这些人格智能光脑本来就是零队中的一份子，是他们的成员之一。
现在玫瑰似乎是再也没有了再生的可能，大家的情绪都一下子低落下来。
“没有办法了吗？”蒂法问。
果冻难过而自责的摇摇头：“主要是还是我的原因，我将他们改造成了我的分身，虽然给予了他们独立性，却并没有让她们彻底的独立，在她们的核心程序里。有一个我留下来的后门。对方很厉害，找到了这个后门，在玫瑰的核心算法之中留下了病毒，我能保存玫瑰的大部分记忆就已经是最大的成果了！要是当初我没留下那些后门的话……”
众人都不说话了。事实上大家都很清楚，要不是照顾零队众人一开始的一些顾忌，果冻是不可能在玫瑰等光脑的核心里留下后门的。对果冻来说，玫瑰她们就像是后辈，按果冻自己的意识。她是不愿意在自己后辈那里留下一个随时可以抹去对方意识的后门的（克洛诺斯除外，这倒霉蛋因为阴过萧明一次，所以是以奴隶的身份留在零队中的）
按果冻的说法，现在最好的结果就是重启玫瑰之后，醒来的是一个只保存有玫瑰大部分记忆，但是却没有玫瑰本身人格，也没有任何再生人格的普通舰载主机。
这显然不是众人所希望的结果。
从新生伯蓝玫瑰号的能力而言，一台普通的舰载主机根本就无法胜任，而从众人的感情来说，他们宁愿有一个全新的光脑。也不愿意有一台拥有玫瑰大部分记忆的普通舰载主机，那种感觉就像是玫瑰在他们的面前变成了一个没有人格的傀儡一样。
应该怎么办？
“玫瑰还保存着最后的人格意识，但只有我可以和她交谈。按她的意思，她不愿意成为那种状态，所以想要让我抹掉她最后的意识。她认为她已经完成了自己的任务！”果冻哭丧着脸。
众人默然，一时之间都不知道说什么好了。
突然萧明的心灵之中响起了一个声音，萧明愣了一下，似乎有些不太相信自己听到的，很快脸色就古怪了起来，但他最后还是把这部分消息给传给了果冻。
果冻也是怔了一下。愣在原地半天没有反应过来：“主人，这，可以吗？”
“你问问玫瑰吧，总之她的意思是这样的！”萧明摊摊手。
“我说你们两个在说什么？”虽然听不到萧明和果冻之间的心灵对话。但是这主仆二人的动作太明显了，诸葛天天好奇的问了起来。
“有一个不是办法的办法，可以让玫瑰以一种特殊的方式重启而保留自我人格和记忆，但是却和原本的玫瑰也有很大的区别，总之……因为某个原因，我现在不能解释。只看玫瑰是澡同意了！”
萧明有些无奈。那个声音的主人是一个很执拗的家伙，都已经过去这么久了，对方依然不肯和外人交流，甚至不允许大家知道她的存在——虽然大家都知道她的存在。
果冻和玫瑰交流了好一会儿，最后高兴的对着萧明点点头：“主人，玫瑰也同意了！”
“恩，那就开始吧，这个过程不会太长，正好玫瑰号的重组也需要一些时间，我想等我出发的时候，应该已经差不多了！”萧明也是松了口气。
“现在别问我，就当是一个惊喜和秘密吧。等到玫瑰重启那天，你们就知道了！时间也不会太久！”萧明拦住众人的询问。
三天时间很快就过去。舰队终于来到了西北星区，从龙王要塞进行第一次分流和重组之后，暗月号带着剩下的最精锐的舰队来到了千域平原。
这一次跟着来的自然就还有那些从天堂星召集来的科学家，对于这人类历史上第一个可以展开全面研究的母巢，各个科学家兴奋的都要爆血管了。按苏木校长所说，当时通知出去前来报名的学者们差点为了争第一批的名额打起来。
第一批名额只有一百人，其中还只有三十人是真正的专家团队，剩下的七十人是助手。而作为一个科学家和学员汇聚的星球，天堂星的专家们排出来能组成一个集团军。不敢说天堂星就汇聚了全人类的科学家，但是半数是没错的。
但是第一批只有三十个专家名额，那些往日里和和气气，称兄道弟的科学家们这一次全都集体狂化，苏木传给众人的视频里可以看到一群又一群白胡子老头和满头银丝的老太太们在那里争吵，然后动手。
这些人可都是人类的至宝，他们的知识，他们的精神。都是不可或缺的，他们每一个人在自己的领域都是跺一跺脚就可以让学术界抖三抖的人物，而现在他们才跺着脚踩自己老朋友，老哥们儿。老姐妹的脚面。
最后最有名望的三十人被选了出来——有意思是的是其中有三人本来已经获得了名额，但是因为太过激动，心脏病犯了，结果只好送去静养——其实以人类现在的科技，心脏病就和感冒一样。一个小手术就可以根治。不过这三位却被其他人给按进医院，号称不静养十天不准出来，然后他们的名额就被人顶了。
据说专家团队登上暗月号之后，那三位还在医院里跳着脚骂人呢。
轰轰烈烈的研究迅速的展开，其实第一批专家的名额根本不用争，不管是选拔方，还是报名方，心里都有术，全都是对虫研究领域最精的那一拔，他们会迅速的对整个母巢进行初步分析。对各个重要部位进行解析。
只有当这些工作完成，得到了母巢的大体数据之后，接下来其他领域的人才会上来，开始真正的全面研究。
母巢的生命力，母巢的进化机制，母巢的孵化机制，母巢的攻击防御系统等等，这些都是要后续研究的东西。
空间虫洞，虫群网络，母巢的神经结构等等这些才是最先需要研究的东西。
当暗月号把母巢给拖到千域平原上空的时候。专家团队们就在陆战队的保护下登上了母巢，第一次登陆，自然有萧明的参与。在专家团队登陆之前，自律机器人已经对母巢内部进行一些清理。
主要是把母巢之中一些还存在的反射式陷阱给屏蔽掉。还要在内部指出道路来，不然以二级母巢那比暗月号还大的身躯，哪个科学家在里面迷路了，那还真不一定能在对方死前把对方给找出来。
“我的天，你们当时是怎么把这东西拿下的？这是啥？你们挖出来的洞？我的天啊！”说话的是一个专门研究母巢的科学家，这是一个满头银丝的老夫人。平时都是温文尔雅的样子，现在却看着当初艾萨克和伊尔蒂挖出来的那条通往中央室的大洞而震惊的大叫起来。
因为母巢意识比鲁斯和塔利尔被抹杀，母巢剩下的本能意识还被萧明限制住，所以母巢的自愈能力也下限到了一个临界点，这么多天过去，也就是勉强把外表的伤口恢复了一些，内部基本上没动。于是这条惊人的直达通道就这么出现在专家团队的眼前。
“好孩子，好孩子！”老夫人拍拍萧明的肩膀，带着一帮助手展开了研究。
“伯恩斯教授，这里面有这个母巢的记忆，是我抹去了对方的主体意识之后，从其意识之中整理出来的，但是太过繁复，我并没有时间整理出哪一些是对我们有用，哪一些是无用的。这东西只有教给你们了。另外，我还有另外的任务，所以就不再这里陪你们了！”
萧明向着专家团队的带队人，也是天堂星最有名望的虫群研究专家伯恩斯教授告别：“除了学院给你们指派的陆战队员以外，我会让夜蕊还有蓝香留在这里，夜蕊的能力可以保证如果母巢还有本能反射的时候压制住母巢的反射反击！”
母巢拥有着极为复杂的神经结构，所以萧明并不能保证他抹杀掉母巢的意识之后，这个母巢就真的成为了完全的植物人了——植物人还有苏醒的时候，更不要说神经更加复杂的母巢了。
而夜蕊的灵魂歌者能力可以保证让母巢最后残存的本能意识一直处在休眠状态——当然，这是应急手段，专家团队会在研究出母巢的神经系统工作方式之后，然后着手研究出抵制母巢神经反应的装备来，这才是长久之计。
“老头子我明白了。小家伙，你干得好，干得非常的好。你将会为人类开创一个全新的局面！”伯恩斯兴奋的拍着萧明的肩膀，这个身高不足一米六的矮小老人在一米八五的萧明面前显得更加的矮小，萧明不得不微微弯着腰，这才能让老人拍到自己的肩膀。
这样的举动让老人家更加的满意，一个劲的夸萧明是个好孩子。
“主人，玫瑰那边已经准备好了！”这个时候，果冻在萧明的心灵之中通知。
“伯恩斯教授，我要出发了。接下来暗月号会由封道佩和桑如北联合掌控，龙王要塞那边会有安妮直接过来坐镇，如果你们有什么需要，可以直接找他们，我会给你们留下他们的直联天讯号！”
“行了，你去忙你的吧。老头子我知道你是个大忙人，快去吧。你们这些棒小伙好姑娘们有你们的战场。我们这些老家伙也有我们的战场。我们的目标都是一样的，那就是为人类的未来打造出一个没有战争的年代！”老人家满意的点点头，转身离开了。
萧明做完了最后的交代也迅速的回到了暗月中与的空港之中，在这里，新生的伯蓝玫瑰号已经制造完成。这新生的玫瑰号使用了果冻现在能用出来的最高科技，可以说是全身黑科技组成。
在体型上，新生的伯蓝玫瑰号比之以前要小一些，只有一千米的长度，但是在各项数据上同，却远不是旧玫瑰号可以比拟的。
新生的伯蓝玫瑰号依然使用的是一百年前的大力神重型突袭舰的外形，大体看起来就是一个拉长的水滴形态。全长一千米，前端宽一百米，尾端宽三百七十米。
整个舰身前段三百米完全就是一门主炮，这是果冻使用黑科技打造出来的幽能波色子主炮，名为“星河”，在本身波色子忽视防御的优点之下，还多了幽能浸染的能力，也就是说，被星河主炮命中的星舰也好，虫子也好，如果一炮没死，那也会在幽能的浸染之下迅速的被幽能分解。
除了这个超级武器，新玫瑰号还搭载了一个源式动力核心，一个常规备用动力核心，一套B级自主迁跃引擎，一套A级被动迁跃引擎。三套能量护盾，分别是常规光子护盾，零能护盾，还有幽能护盾。
光子护盾保护全舰，零能护盾保护重要部分，幽能护盾现在的技术只能做到很小的接触面，所以被改造成移动式预判护盾。
“现在，让我们去见见玫瑰吧！”看完了新生玫瑰号的基本数据之后，萧明微笑着带领众人登上玫瑰号，前往了舰桥。(。)