人型生物身上穿着的东西被称为是纳米生化服，但它跟纳米材料没有一毛钱的关系。
在六千万年前来自M33星系可以称为ceph的殖民者就到访过地球，但是因为气候问题陷入了休眠。
在这个世界20世纪初的通古斯大爆炸，是三个人无意之间激活了一处ceph的基地自毁程序，三人见识过了这种被他们称为ceph的生物的恐怖与强大的科技。
其中两位分别叫做哈格瑞夫与罗许，他们借助ceph的生物实体开发出了早期的纳米生化服。
这种装甲几乎能适用一切战斗，它还有着各种强化模式，装甲模式能抵御枪炮，威力增强能让人跑得更快跳得更高，隐匿模式的隐形甚至覆盖武器。
之后在一处被称为灵山岛的地方发现了ceph的基地，就此开展了孤岛危机1的剧情。
而在灵山岛事件后，人类明面上取得了胜利，但实际上ceph在世界各地的大城市都秘密建造了巢穴。
纽约的巢穴最先复苏，人类在ceph创造的感染病毒前没有任何抵抗能力。
原本一代故事中纳米生化小队的指挥官，代号‘先知’的巴恩斯·劳伦斯，就算是有与ceph同出一源的纳米生化服，但因为种种原因还是感染了病毒。
在‘先知’死去之前，他在海边救下了来援却被覆灭的特战小队中的一员‘阿卡特兹’，将身上的纳米生化服让给了阿卡特兹。
重伤的阿卡特兹借助着纳米生化服见到了活了一百多年的创造者哈格瑞夫，并成功拯救了城市。
然而，在这个过程中，重伤的阿卡特兹神经逐渐崩坏，他的人格也消失了。储存在生化服中的先知意识被释放了出来，重新复活。
世界各地有ceph的巢穴，在纽约战斗中，CELL发现了其中的主脑，修建了X系统将其控制了起来，从主脑身上掠夺巨量的能源，通过对ceph的研究大发战争财，并逐渐控制世界。
先知也被CELL捕获了起来，准备切开他研究纳米生化服。
纳米生化服有一个最独特的性质，那就是永远只有第一任宿主才能完全匹配。生化服会逐步的记录宿主特性，并与身体融合。先知能借尸还魂，就是依靠了这一特性。
这也是为何刚刚赛可会说‘他们剥了我的皮’的原因，将纳米生化服完全剥离，痛苦不亚于剥皮。
纳米生化服与141特遣队的生化改造，两人都在暗中较劲。
拳掌之间开始了发力，脚下的水泥开始崩碎。
一旁的赛可举枪对准了麦克塔维什，这个看起来就很强大的壮汉不断在取得赢面，先知甚至被他推后了一些。
骤然间，两人收起了力气。彷佛刚才一切都没发生。
暂时间无法在力量上取得优势，而对方也没有发动其他攻击，先知决定先问问。毕竟没有人对他如此了解，从名字的问询中就展示了太多的隐秘。
“你可以叫我‘先知’！”
先知只是一个代号，而这个代号却是贯穿整个事件始终的人物。他们不是一个人，是巴恩斯·劳伦斯，是阿卡特兹，是幡然醒悟的哈格瑞夫……
赛可看着从海中爬出来跟牧羊人回合的霍尔特，在一旁举着枪来回巡视，这两个大家伙的交流才是重点。
赛可催促着说道：“如果你们不准备打，那就赶快说清楚！”
麦克塔维什转头看着没事的牧羊人，对眼前的先知说道：“我们是时空管理局下属的141特遣队，奉命来处理这个世界的覆灭危机。”
“你到底在说什么？你该不会是那群CELL的混蛋用外星章鱼制造出来的吧！”
赛可率先发表了意见，他无法理解自己认知以外的事情。
先知从上到下看着麦克塔维什，说道：“扫描显示你的骨骼已经被替换成了金属，肌肉被强化，身体每一处都有生化改造的痕迹。但是没有ceph的基因。”
麦克塔维什说道：“我不是你们世界的人，要维护各个世界的和平稳定，需要这样的力量。”
先知伸手按下了一旁赛可的武器，说道：“赛可，冷静点，他没有说谎。”
纳米服集成了多种探测设备，能扫描人体，自然也能监测声纹和心跳测谎。
“可……可是……这么可能！”
赛可不敢置信的喃喃低语，时空管理局光听名字就能知道它的地位和职责，现在这个世界有覆灭危机？我的世界要毁灭了？
麦克塔维什这次看向了赛可，解释说道：“根据我所得到的命令，和已有的情报显示。在人类的高层中出现了叛徒，CELL已经无法收容外星ceph的主脑。”
赛可破口大骂道：“法克！我就知道这帮家伙没干好事！肯定是CELL的高层，他们跟外星人有一腿！”
然而麦克塔维什略带叹息的看了赛可一眼后，说道：“并且X系统的传递中枢是CELL创造的毁灭性武器，它能利用无线输电远离将ceph主脑的能量输送道太空卫星，能量转换为基本粒子。全力输出几乎能贯穿地球。而他们应对穹顶牢笼收容失效的唯一方法就是用这武器对着纽约来一发……”
赛可已经不想再说什么了，内忧外患下他已经不想再思考了，他无力的蹲在一旁，现在只想来根烟。
“这样的卫星，CELL一共有十二颗！”
赛可抬起头看了麦克塔维什一眼，又低下了头。按照反抗军的计划，他们会和先知一同推翻CELL技术的核心，炸毁X系统中枢。
而按照麦克塔维什的说法，炸毁X系统将会让收容的ceph主脑逃出来，让CELL朝地球来一炮。
‘算了，累了，毁灭吧……’
这时候，一旁的海洋中出现了一些波澜，隐形的小型飞行器缓缓降落在众人面前。
一个靓丽的少女和在驾驶室抽烟的克里斯出现在了现场，少女跳下飞行器对着麦克塔维什点头示意。
瑞贝卡·钱伯斯，从十八岁大学毕业就加入了浣熊市的STARS小队担任医疗官。而在后续的故事中，她就像是被卡普空忘记了一般，只在一部CG电影中出现过。
但出场戏份少不代表她的能力弱，十八岁大学毕业，经历过生化危机，更是在红后的培养下成为了小浣熊内首屈一指的生物学家。
面对ceph散发出的病毒，小浣熊才应该是最佳应对人选。
但纳米生化服技术却是141特遣队的预定战利品，一种能拟合身体的生物作战服，可以充当保护和内衬，甚至还能让他们在太空短时生存。
在故事的最后，先知从卫星轨道坠落地球，反而融合了整个纳米生化服重现人类外貌。
这样的装备，才是141特遣队需要的。他们需要纳米生化服作为战斗机甲的内衬和保护。
而瑞贝卡这位前线生物学家就被申请了过来协助行动，作为回报，幽灵带了一支小队也去协助小浣熊。
在生化病毒的作用下，现在的瑞贝卡也像是大学刚毕业那样年轻。
她提着一个箱子来到了先知旁边，打开露出里面的装置。
指着一个针刺位置，瑞贝卡说道：“把手放在这里，我需要提取一点你的组织细胞。”
先知没有行动，而是等待着说明，他现在能依仗的就这一身纳米生化服，虽然刚才的解释说明没有探查出谎言，但对方也是改造人，不能不警惕。
“呃，好吧，看来只能用口头说明了。这台机器能提取你的生物信息，将一些情报内容插入到你的衣服中，这样就不用通过文字影像的物理媒介留存信息了，这也算是一种保密手段。”
随着瑞贝卡的说明，先知将信将疑的伸出了手，同时他身上的纳米生化服有了轻微的变化，看样子先知也做了防御准备。
针刺入了纳米生化服中，先知从装备中感受到的是一些神经细胞被注入，这些神经细胞储存的记忆被释放了出来。
那是时空管理局的存在说明，以及一些对于这个世界的情报预测。
而这时，先知也知道为什么刚刚麦克塔维什看赛可的眼神为何那么奇怪了。
先知对蹲在地上的赛可说道：“赛可，我们得离开了！”
站起的赛可随意的让枪挂在胸前垂落，无所谓的说道：“你跟他们去吧，我反正找你来是想要摧毁X系统，但我们的想法在一开始就是错的。你选择了相信他们，我选择相信你。”
没有人能用几句话就让人信服自己完全陌生的事物，罗夏当初忽悠红后还展现空间能力和自己的各种装备呢！
作为战友的赛可选择相信先知，相信这个从一开始就站在抵御ceph入侵最前线的男人。
克里斯在一旁看着戏，随即看向了一旁，接着对麦克塔维什说道：“地狱犬发现了有人靠过来了，刚刚的尸体还有半分钟就会被发现，要我动手吗？”
“不用，我们尽快离开。”
随着麦克塔维什的话音落下，一架轨道突击艇骤然跃迁在众人面前。克里斯慢悠悠的将自己的小飞船开进突击艇里。
麦克塔维什对着失落的赛可说道：“我们还需要你指明位置，接下来拯救世界的行动需要反抗军的努力！”
“走吧，赛可，接下来也需要你帮忙！”
先知对着赛可伸出了手，跨越几十年后，战友的手又握在了一起。
轨道突击艇，能配得上这个名字的装备有着绝强的护甲护盾，还有最强的动力。
看着一旁的克里斯、瑞贝卡和牧羊人纷纷抓住了一旁的护栏，赛可也默默伸手将手放在了上面。
“我们要去穹顶的另一侧，在围墙下有一处反抗军集结地。希望我不会把灾难带给他们……”
刚刚说完，赛可就感受到了一股巨力，他整个人就像是被车撞了一般腾空而起，一旁的先知连忙抓住了他。
可是赛可带来的两个行动人员就没有那么好运了，他们仅仅的贴在了轨道突击艇后方的舱门上，挂在上面一动不动。
随着两个倒霉蛋的落地，突击艇也来到了赛可说的位置。
钢铁穹顶如同天幕一般将一切都包裹在了里面，而赛可说的位置，却在里面。
揉了揉自己手腕上的抓痕，赛可说道：“我知道一处泄洪渠，我们要趴着才能过去。或许对你来说有点小？”
赛可说的是麦克塔维什，他现在的身高爬防洪渠，的确是强人所难。
克里斯在一旁无所谓的说道：“或许我们有更干脆点的办法！”
干脆点直接把天幕轰开，大摇大摆的把突击艇开进去。
瑞贝卡忍不住用手肘顶了一下克里斯，然后对着赛可笑了笑，示意他无视自己旁边的傻子。
最总众人还是选择了跟随赛可的引路，他们可不会选择破坏穹顶，那是阻挡ceph主脑的第一道防线，破坏它就是在协助主脑逃脱。
那狭小的排水渠对于先知来说通过都很艰难，赛可坏笑着带头爬了进去，接着是瑞贝卡。
而当赛可出来时，他转头却看到了站在一旁的麦克塔维什。
“法克！你怎么过来的？”
“走过来！”
麦克塔维什自然不会说他们身上都有信标，只需要瑞贝卡过来之后开一个传送门就能进来。
在彻底解决这个世界的隐患之前，麦克塔维什不会轻易暴露这种工具。
“走吧，我们去见见反抗军。”
麦克塔维什催促着赛可，赛可嘟囔着开始胡乱猜想。
带路的他没有看到，麦克塔维什将一把武器交给了先知，两人心有灵犀的互相点头，然后跟了上去。
而原本应该在的瑞贝卡、克里斯和牧羊人则消失了踪迹。