建文帝时时感受到藩王的威胁，不得不与亲信大臣齐泰、黄子澄、方孝孺等计议削藩。
随后，建文帝又先后废湘王、齐王、代王、岷王等四王，目标直指燕王朱棣，可惜建文帝并未意识到他的行动实际上已经打草惊蛇。
燕王朱棣当然不会坐以待毙，在他的封地北平起兵，发动“靖难之役”，借口“清君侧”：以诛齐泰、黄子澄为名，矛头却直指建文帝。
建文四年六月，燕军渡江直逼南京城下，谷王与曹国公李景隆开金川门迎降，南京城破。
建文帝欲出迎，左右悉散，惟内侍数人而已，乃叹曰：“我何面目相见耶！”遂阖宫自焚。
燕王立即派遣太监前往救援，无奈来不及，太监把建文帝的尸体从火中找出。
八天之后，朱棣以天子礼葬了建文帝。
当时建文帝有两个皇子：长子朱文奎七岁，次子朱文圭才两岁。朱文圭被成祖幽禁在广安宫，直到英宗天顺年间才被放出来，当时已经五十七岁，由于一直被关在宫内，出来时连牛马都分辨不清。
建文帝长子的朱文奎在建文帝亲信侍卫石阶、吴刚、公孙展、向江四人保护下，趁乱乔装逃出了皇宫。
为避朱棣追杀，先后辗转云贵、江浙一带。
无论日子多苦多难，四亲信侍卫始终对朱文奎不离不弃，一起谋求复国，创建帮会顺义帮，任石阶为帮主，其他三名侍卫为副帮主，培植势力，联络商贾，筹银筹粮，操练兵马。
后来有人泄密，朝廷派锦衣卫剿灭了顺义帮。
朱文奎临终前将爱女朱红许与石阶之子石文，托石文好好扶植爱子朱砂，相机夺回皇位。
石文夫妇为保朱氏血脉，只好流落天崖。
朱石两家此后数代皆隐山林，习文练武，单丁相传，但择偶甚严，所生子孙皆相貌俊雅。
慢慢地，朱石两家子孙谋求复国之心熄灭。
万历十年，石飞扬出生。
万历十八年，石飞红出生，其父即送石飞扬入少林护心意拳门下学艺。
万历二十六年，石飞红八岁，父母双亡。
石飞扬时年十六岁，下山拜祭父母，并在恩师圆规授意下，拜雄樱会总舵主石英钟为义父。
石英钟闯荡江湖大半生，始创雄樱会，因身体伤残，无子嗣，见石飞扬相貌俊雅，又皆是姓石的，自然喜欢，收石飞扬作义子。
石飞扬后送亲妹拜入云海天门下，途中又得圆痴大师传授予“如来神掌”与“神龙爪”两门武林绝学。
他一路行侠仗义，很快在江湖上闯出名堂。
其时吴刚后人“铁掌”吴忠、公孙展后人“飞鹰神探”公孙文、向江后人“铁笛秀才”向坤也寻来雄樱会，与石飞扬相见，好不开心。
因石飞扬继承先辈谋求复国之用的大笔遗产，富可敌国，随便捐赠石英钟一张小藏宝图，便让雄樱会势力大壮。
万历二十二年，石英钟去世，石飞扬被雄樱会众拥为总舵主，雄樱会名声更胜，引起了朝廷的注意。
云海天之子云剑清和石飞红同门习武，他对石飞红暗生情愫，不料石飞红邂逅英俊潇洒、武功高强的寇振海，竟与寇振海一见钟情，相识不久两人便向石飞扬提亲。
石飞扬看寇振海无论长相、人品、武功都不错，自然满口答应。云剑清突地绝望了，他心智为情所狂。
他本是心胸狭隘之人，自思自己得不到的也不能让寇振海得到，对石飞扬答应寇振海提亲更是满腔仇恨。
石飞红当时年幼，无意曾透露过自己的先祖母是朱家皇室之后，留下富可敌国的宝藏。
云剑清找到雄樱会首席香主、名震江湖的铁掌吴忠和丐帮新任帮主钟万强，把这个秘密告诉了他们。
他添油加醋地称石家宝藏里还有一套武功秘笈，他说只要练成了这套心法，就是武林至尊了，若得宝藏也将成为天下首富。
云剑清这么一说，说得吴忠和钟万强两人怦然心动。
吴忠当时年轻，想做雄樱会副总舵主。
石飞扬看出他的野心，偏不让他做，并让妹妹做了副总舵主，把他堵死了。
云剑清趁机出言挑拨吴忠与石飞扬的关系，说吴忠也是忠良之后，凭什么宝藏、名利、武功秘笈皆为石家所得？
云剑清察言观色，看到吴忠和钟万强既怦然心动，又愤怒异常，便趁机收买吴忠和钟万强。
其实，钟万强不用云剑清说服，心中也想杀石飞扬。
因为，他心爱的女子伊莉：恒山派的女弟子、武林第一美女，在石飞扬与另一少女成亲那天，在太湖边上自尽了。
她是武林武功高强、才色双绝的美女，令天下英豪为之倾倒，石飞扬与她也曾经一起共过患难，也曾生死相依，但石飞扬不知何故，却没有娶她为妻。
钟万强要为伊莉报仇，尽管伊莉从未爱过他，也很讨厌他。但钟万强认为她之所以讨厌自己，便是因为石飞扬的出现，让他的美梦成为泡影。
同时，他也意识到，只要石飞扬活着，自己就永无机会作武林霸主，唯有除去石飞扬，自己才能扬威武林。
云剑清和吴忠、钟万强在寇振海成亲前的三天，三人合力设计将寇振海击伤跌入太湖，再由云剑清引锦衣卫潜往雄樱会秘密总舵，杀了雄樱会总舵近二百人。
恰好云海天夫妇听到徒儿石飞红成亲，也赶来祝贺，不料发生变故，便与石飞扬拼死力战，护石飞红携婴儿逃走，双双伤亡。
雄樱会总舵一干人与锦衣卫交手前，吴忠与云剑清装作到处寻找寇振海，溜出了雄樱会总舵。
待吴忠回到总舵，看到了满地鲜血，与自己曾经生死相依的弟兄一个个尸首分家。
他心中悲痛万分，蓦地清醒过来，便找云剑清大打一场，两人均受重伤。
吴忠大骂云剑清卑鄙，害人害己，害死了石飞扬夫妇，还害死了自己的父母。
他那一骂也骂醒了云剑清。
云剑清把剑递给吴忠，让吴忠杀了他，并告诉吴忠：钟万强是宫中侍卫，由万历帝派出宫中，潜藏江湖，找寻朱文奎后人下落。自朱棣即位起，朱家每位天子皆是如此，武林潜藏的宫中侍卫高手后人不少。
吴忠想起自己也参与了阴谋，下不了手，扔下剑就跑，欲到太湖投湖。
其妻肖玲玲从血水中爬出，称石飞扬并没有死，只是身负重伤，被圆痴大师救走了。
吴忠即施救爱妻，夫妇俩从此暗中摸索石飞扬下落。
云剑清清醒过来，心中愧疚万分，也曾想过自杀，恰好钟万强想趁雄樱会群雄与锦衣卫交手时潜入雄樱会总舵搜索藏宝图，他搜不到藏宝图，便救醒云剑清。
钟万强无论武功和奸计都在云剑清之上。
他走出皇宫，在之前潜藏的一些掌门高手引领下，投入丐帮，一路十分卖力地为丐帮建功立业，得到了帮主的信任。
他毒杀前帮主，迫不及待地做了帮主，并清除异己，领同由皇宫出来的丁华江、吴柱国等人作了会中长老，牢牢控制天下第一大帮。
钟万强救了云剑清之后，便对云剑清道：“兄弟，石飞红下落不明，有朝一日，她若知你设计害了她家人和雄樱会众弟兄，绝不会饶你。咱俩何不联手做到底？只要找到藏宝图和武功秘笈，金银珠宝尽归你，武学秘笈咱俩一起练，然后抓到石飞红，强迫她做你的夫人，这可是一石三鸟啊。”
钟万强后面这话击中了云剑清的要害，其实在他心目中，得到石飞红比什么都重要。
云剑清原本清醒的心智又糊涂起来，忙道：“钟兄，请指教，小弟如何才能得到红妹？”
钟万强阴险地笑了笑道：“你自创帮会，表面行侠仗义，暗探石飞红的下落，钟某派丐帮弟子相助于你。如何？”
云剑清此后便依言而行，创立了六合帮，从此表面上行侠江湖，以仗义扶弱为己任。
他瞒着帮众，暗地里却与钟万强勾结，拐骗民女，烧抢掳掠，积蓄财富，壮大六合帮。
后来云剑清多次遇上石飞红，但无论如何也骗不了石飞红的藏宝图。慢慢地，他也死心了，决计诛杀石飞红，彻底掩藏当年引兵屠杀雄樱会的阴谋。
天启初年，石飞红因石剑之事轰动江湖，被扣留在丐帮总舵里，云剑清与钟万强借故离开，暗中煽动武林中人围杀雄樱会，好在雄樱会好汉武功高强，舍身相护石飞红逃离。
随后，魏秋婷又及时出现相助，吴忠夫妇也暗助赖得出、来伙添二人逃离，妙悟真人更为护石飞扬名声而自断经脉。
钟万强诡计一败涂地，只好另想法子铲除雄樱会。
岂料石飞扬出事前声名甚好，石飞红甚得东南武林中人相护，雄樱会始终无事。
丁华江策划的雄樱会内讧事件又因石剑资助公孙文而功亏一篑。