故事应该从很久很久以前说起......
亿万年前的上古时代，人族与万族在经历了开天战争后终于成功封印了上古之神。古神被封印后，阴阳二气开始不断分离，人族与万族也迎来了最初的和平发展时期。
万族的力量来自灵魂，崇尚灵力的他们将栖息地安置在了森林，山脉，湖泊，洞穴等自然之中。人族的力量则来自肉体，虽然在开天战争中有数百位人类突破了肉体的极限取得了远超万族灵魂的力量，但付出的代价实在是太大了。这种突破肉体极限的概率本就不大，再加上极高的致死率。深思熟虑后，人族作出了发展科技放弃肉体突破的决定并将栖息地安置在了平原。
上古时代共有六位圣人，那是在开天战争中带领两族取得胜利的核心人物，也是两族中最为强大的存在。在古神封印结束后，六位圣人根据生活方式的不同建立了不同体制。人族这边，在人皇伏羲，妖皇女娲，地皇后土三位圣人的帮助下成立了世界政府。万族这边，则在东皇太一，天皇帝俊，凤皇羲和三位圣人的授意下组建了最高评议会。
世界政府，最高评议会分别代表了两族最高的权力机构。组织中的天才数不胜数，个个都是层层筛选出的精英。他们的目的只有一个，那就是快速发展自己的部族。蒸汽时代，原子时代，信息时代，生物时代......在两族天才们的努力下，科技链出现了一次又一次的技术爆炸。
正所谓屠龙者终究会成为恶龙，两族在经历了数百年的和平发展后，野心与欲望开始逐渐膨胀。
首先是对武器的研究，起初是为了做好应对‘古神的封印解除’，到后来的‘防止外星人入侵’......两组织在某个条约的约束下开始在外星球实验那些凝聚了两族顶尖科技的超时代武器。
当时的地球人已经具备了可以在太阳系航行的能力，为了不波及到地球同时又能即时地接收实验结果，两族将实验基地放在了太阳系的第五颗恒星‘法厄同’上。
前期的实验都很顺利，无论是反物质武器，灵魂武器。还是两者相结合的魂器都远远得超出了预想结果。可渐渐地，被欲望蒙蔽双眼的组织高层竟妄图染指被封印的古神。于是，在一个月黑风高的夜晚，世界政府与最高评议会派出刺客潜入了古神圣殿并在神不知鬼不觉下偷偷盗取出了三大古神的碎块。
可能是时间冲淡了人们对古神的畏惧，要知道，那可是统治了地球整个上古时期，六大圣人联手付出了巨大代价才勉强将其封印，绝对混沌的存在。即便是碎块，也是极为恐怖的存在。果然，实验当天，悲剧发生了。已经失去活力的古神碎块突然开始生长并腐蚀了在场的全部科研人员......
那是一场极其惨痛的科研事故，法厄同行星被炸得粉碎，行星的碎块变成了未来的小行星带，星球上的科研人员无一生还。这还不算完，死去的灵魂与肉体在古神碎块的影响下逐渐变成一团名为‘阿撒托斯’的恐怖造物。直到人皇伏羲的到来，才将其驱逐出太阳系。
法厄同事故的严重性甚至惊动了圣人，万族为首的三个圣人直接废除了最高评议会并处决了全部长老。东皇太一，天皇帝俊，凤皇羲和，万族的三位圣人声称将会成立代行组织以替代被抹去的最高评议会。至于代行组织的成员，他们会从旅途中找到。没多久，万族的三位圣人便开始了他们长达数个世纪的旅行。
人族这边却截然相反，世界政府虽然背着圣人们染指古神，然而经过数百年的变迁，人类对世界政府的忠诚度已经完全高于人族的三位圣人......即便这些圣人曾带领他们的祖先取得开天战争的胜利，即便这些圣人曾带领他们的祖先摆脱古神的奴役，取得了自由......
最终，在舆论声中，世界政府的处决不了了之。其实，没有人注意到的是，两族在盗取古神碎块时，已经在无意间沾染了古神的气息。这种气息就像病毒一样，无声无息地开始在栖息地里传播并慢慢放大两族心中的欲望......
时间有陆陆续续地过了几百年，人族与万族虽还在继续发展，但万族因为失去了三位圣人与最高评议会，没多久便被人族超越。科技差距的拉开，也让某些人心中的黑暗逐渐浮出水面。
时历上古时代末期，万族的三位圣人终于从长途中归来。与三圣一同回到万族圣地的还有一位名叫通天的男人。万族人对通天并不陌生。虽然在开天战争中是由人族与万族的六位圣人带领两族取得了胜利，但两族中不乏有着仅次于六位圣人的能人志士。像祝融，共工，鲲鹏等都是赫赫有名的强者。三清之一的通天更是其中的佼佼者，在开天战争时凭其独创的诛仙剑阵立下了无数战功。据说如果不是战争结束，通天也许会成为第七位圣人。
据万族三圣所说他们在通天的身上看到了万族的未来并决定要让通天成为代行组织的首领。万族的其他人却不这么认为。三圣已经离去了几个世纪，在这几百年中人类的发展已经远远超过万族。在实力的绝对碾压下已经发生了无数次万族同胞惨遭不平等对待甚至是被杀害的事件。通天即便再强大，本质也是人类，如果让其成为代行组织的首领，万族很有可能将会在未来的某天被人族彻底消灭。讨论一时陷入了僵局......不曾想，还没等万族讨论出结果，通天就做出了一件改变世界的事。
通天自幼父母双亡，少年时解救了三个万族女孩。女孩们虽然是在古神的滋养下长大的异族，但心地善良的通天还是收留了她们并为三人分别取名为云霄，琼霄，碧霄，也就是后来的三霄。兄妹四人一起生活，一同战斗，直到封印上古之神。通天终于成为了三清之一，三霄也长成了亭亭玉立的美人。本以为古神被封印后兄妹四人会迎来和平安宁的生活，不曾想，通天旅途归来后三霄竟然出事了......
等通天赶到时，云霄正在丰都城最大的一座青楼中**着。据知情者透露，云霄被拐卖到丰都城后遭受了无数非人的虐待并被训练成了第一名妓。琼霄与碧霄则被卖给了世界政府的研究机构。年纪最小的碧霄最为机灵，以一对翅膀的代价从机构中逃了出来。而琼霄......各个器官已经被肢解出体外的琼霄竟然没有死去，身上的管子正不停地从体外的脏器中抽着什么液体，据说这种痛苦已经持续了几十年......
通天爆发了......盛怒之下的通天屠杀了整座丰都城，主谋们更是被通天抽出灵魂钉在柱上焚烧。灵魂燃烧的哀嚎声响彻丰都，据说直到百年后灵魂才会燃烧殆尽，而丰都城最终也变为了鬼城酆都。
然而，通天的愤怒并没有平息，尤其在看到琼霄的惨状后，通天彻底失控了。虽然旅行的一路上他也见到了人类所做的残忍之事，但他怎么也想不到人心竟然可以黑暗到这种程度，他开始觉得自己当初拯救人族摆脱古神的奴役是否正确。尤其一想到妹妹们这些年的惨状，这股对人类的恨意便更为突出。
滔天的能量席卷了整个盘古大陆，失控的能量直接以世界政府为中心撕碎了盘古大陆。是的，大陆板块在亿万年前确实是连在一起的。只不过在这次冲击下被撕裂成六大板块，又经过了数亿年的板块漂移，才有了如今地球七大洲的模样。
这是一场毁灭性的事件，人族三圣一齐出手才制止住了失控的通天。人类虽然没有灭亡，但在这场冲击下文明直接倒退回了农耕时代。为了留住人类文明种子，在冰河期到来前人族三圣耗尽最后的能量，将人类基因埋藏在海洋后陷入了长眠。万族三圣则将未受波及的万族带到了他们旅行中发现的一处与世隔绝的静寂之所，也就是后来的阴间。
三霄灵魂的特殊性不会破灭，迟早有一天会再度转世。为了能再次遇到她们，恢复理智的通天选择了隐姓埋名，没入尘世......
上古时代结束了，人类的文明又从海洋中重新开始。单细胞生物，两栖类，人猿，智人，古代人......虽然出现了几亿年的文明断层，但凭借基因中对祖先的记忆人类还是重新发展了起来。
而通天，在等待漫长岁月后通天终于等到了三霄的转世。不曾想四人的相遇竟又是以悲剧收尾，只不过，这次，是通天选择了牺牲自己......
上古时代......
古代......
近代与现代......
通天与三霄的灵魂缱绻旖旎，据说直到现在，他们的灵魂仍旧纠缠不清......