经历了暗夜下级暗夜的反复删除大家的记忆然后暗夜被封号后，师父有了正确的记忆。而在虚拟空间里的暗夜还在为自己的报仇计划着，虚拟空间里的奕芯的复制人也因为做坏事而无法出来，暗夜没有正确的记忆，而奕芯的复制人还是在欺骗暗夜说奕芯做过多少愚蠢的事，其实这些事都是她自己做过的，奕芯安安静静岁月静好。因为奕芯的这一个复制人少了一些奕芯的好的基因吗，所以大家都觉得她很坏而且缺根筋的感觉。她破坏了真实奕芯的形象，曾在路上后背被砍了两刀，而大家说经历了这些事情她没有了大脑。她说她要学习素颐的做事风格，因为她曾经代替过素颐参加一次会议。
所以暗夜还是不知道正确的事实是什么，这种误会要是在人间可能会有颠覆真相的作用，可是在组织科学家发明了正确的记忆，不只是知道过去的所有真相，而且实时更新这些事实的真相。奕芯觉得自己就是为组织而生的。大家明白科学家不参与大家的事情，只是在暗中保护和控制大家来救奕芯。他们还对两个复制人奕芯会长洗脑说他们只有帮助奕芯才能活下去，科学家让她们两个去救奕芯，所以暗夜才会得到出山的机会。暗夜计划在虚拟空间计划好一切再出来，可是他不知道真正的记忆，所以大家最好叫他现在就出来，不要在虚拟空间浪费时间。而这边怀善的复制人还在外面控制着大家，科学家们自我保护的很好，所以科学家检测到他的射线后反而更新了系统，怀善的机器成了废铜烂铁。奕芯觉得科学家有一个圈子，科学家说只有圈子里的才叫共济会，大家对两个复制人奕芯会长说师父在他们眼里是一个孩子。奕芯希望两个复制人奕芯会长不要对科学家有所冒犯，因为大家的表面平和的宠溺，并不代表自身的一切性格都是平和的，他们都觉得师父是孩子，更何况我们。大概因为师父二十岁入会的原因，所以科学家都是有家训组织规则的继承者，个顶个的厉害，师父说科学家并不喜欢大家太花哨的装扮，简单就好。可是这也可能是我们亚洲人的风格。让大家理解奕芯的性格，是一件漫长的事情，大家整理好自己谦逊的心态，我们奕芯一起走下去。
师父回组织后就开始为奕芯报仇。相信师父的心，会公平的对每一个人。科学家知道了所有真相，也知道怀善有多坏了，可是而科学家并不太关心其他人的事情，除非大家犯错。可是科学家关注奕芯的未来，并且同意奕芯加入科学家的圈子，这样才是真的进入共济会。大家测试出奕芯不久就把师父也带进科学家的圈子了，因为师父、暗夜和奕芯都是超强人类，都是天才。
大家知道这些后都不敢出来说话了，而复制的怀善还在联系着大家，暗夜也还在计划着复仇，只有等暗夜出来，制服怀善。