葡萄牙人第二次派出到达印度的舰队由一位傲慢的贵族卡布拉尔带领，他在到达印度后，十分蛮横的要求当地的小邦国要把香料优先买给他，这严重损害了当时垄断香料贸易的穆斯林商人的利益，而穆斯林在各个小国都拥有重大的影响力，于是最后冲突不可避免的爆发了。
最开始时，那位带领舰队的葡萄牙贵族卡布拉尔武力洗劫一艘穆斯林商船，而且杀死了船上的所有人，这引起了当地穆斯林的愤怒，于是他们联合起来袭击了葡萄牙人在印度的商站，并杀死了五十多名葡萄牙人，这下让卡布拉尔更加愤怒，炮轰了商站所在的那座印度人的重要港口，洗劫了港口中的商船，并且屠杀了六百多名无辜的船民。
葡萄牙人的残暴行为，自然使得当地的穆斯林商人对他们无比仇视，但当时印度西海岸小国林立，葡萄牙人在那个邦国内的屠杀，却引起与这个邦国有仇的一些国家的示好，于是葡萄牙利用印度人的分裂，很快又在印度西海岸的其它地方站稳脚根，不过他们与穆斯林商人之间的仇恨却更加不可化解了。
两年之后，达.伽马再次带着庞大的葡萄牙舰队到达印度，这个葡萄牙贵族出身的航海家比之前的卡布拉尔更加的强硬和蛮横，他刚到达到印度，就俘虏了一艘到麦加朝圣的船只，船上近四百人全都被他屠杀，其中有相当一部分是女人和儿童。
另外达.伽马还用武力威胁印度西海岸的小邦国，并与另外一个邦国签订了对葡萄牙十分有利的商贸协议，而且在此期间，达.伽马还与当地的邦国发生了海战，不过他仅仅用了四艘战船，就打败了对方五十多艘船。而且葡萄牙人自身的损失极小，之所以造成如此悬殊的战果，最关键的就是技术上的巨大差距。
葡萄牙人使用的战船正是欧洲最流行的克拉克船。这种船正是大名鼎鼎的盖伦船的前身，比印度人的战船要强大上无数倍。而且他们的船上还装载着重炮，印度人的那种原始战船在他们面前，根本就没有任何还手之力。
经过这场海战之后，葡萄牙人终于完全的在印度站稳了脚根，而且他们也把海上贸易从穆斯林商人手中抢走了一部分，而且这时他们的力量虽然还没能完全征服整个印度西海岸，但却也已经成长为当地的一个不可忽视的势力。并且开始一步步蚕食穆斯林商人的海上贸易。
等到1504年，也就是正德皇帝登基的前一年，葡萄牙正式与印度一个名叫柯钦的小邦国结盟，并且在对方的帮助下。建造了一座真正属于葡萄牙人的港口——曼努埃尔，这座港口是以当时葡萄牙国王的名字命名，由此可知这座港口的重要性，而且在同一年，葡萄牙仅用了三艘战船。就打败了印度人的一百五十艘战船，这场战役印度人被击沉二十五艘，死亡了上万人，但是葡萄牙人竟然是零伤亡。
对于上面这个战果，周重一开始是不信的。但是若望神父和奇拉瓦却是一起发誓，这上战果绝对是真的，而且还被葡萄牙人载入史册，不但欧洲人知道，就连那些被打败的印度人也承认，而且这个悬殊的战果并不仅仅是特例，后来还有更让人惊讶的战果。
1507年霍尔木兹之战，葡萄牙出去六艘船近五百人，对战波斯人的170艘战船，结果波斯人被击沉三十多艘战船，战死三千多人，葡萄牙人却又是零死亡，仅仅有十一个人受伤。
1509年第乌海战，葡萄牙十二艘战船，埃及、奥斯曼和印度联合出动150艘战船，结果又是葡萄牙大胜，这次虽然不是零伤亡，但却也损失极小。而且在第乌海战之后，穆斯林全面退出印度洋，葡萄牙人从此成为印度洋的主宰。
通过上面一系列海战的悬殊战果，周重终于看清了一个事实，那就是欧洲人在航海和武器方面已经全面超越阿拉伯人和印度人，所以才会在海战中出现一边倒的局面，而且周重也不得不承认，虽然中原地区在航海方面也曾经一度走在世界的前列，但是经过这么多年的海禁，造船和航海技术都出现大幅度倒退，现在估计也同样不是葡萄牙人的对手。
据若望神父和奇拉瓦所知，葡萄人在印度的势力已经不再仅仅局限于曼努埃尔这一个港口了，他们已经占据了印度人的一个重要港口城市果阿，并且将政治、经济和军事忠心都迁到了那里，而葡萄牙人在印度则常年驻扎着二十条军舰，以及超过两千名的士兵，虽然数量看似不多，但是仪仗着先进的船只和武器，他们已经实际的控制了整个印度西海岸，同时也垄断了那里的海上贸易，每年为葡萄牙输送着巨额的财富。
周重听到葡萄牙在印度竟然拥有这么多的船只和士兵，再想到明年他们就要大举进攻马六甲城，这让他的脸色也一下子变得难看起来，虽然他们南洋商会的实力增长很快，但是商会中的成员也不过才一千人，真正能够用来海上作战的也才不过五六百人，就算他动员其它商会，最后恐怕也不过才能招募到一千人。
另外需要注意的是，无论是南洋商会还是其它商会的人，他们都只是民间武装，根本无法与真正的军队相比，再加上他们的船只和武器也比不过葡萄牙人，到时就算周重带着这一千人去援助马六甲城，恐怕最后所起的作用也十分有限，万一自己一方受到巨大的人员损失，而且又没能阻止葡萄牙占领马六甲的话，那么后果之严重，恐怕就连周重也无法承受。
想到这里，周重的脸色也不一下子难看起来，对于葡萄牙人在南洋的扩张之路，他也有所了解，马六甲是沟通太平洋与印度洋的交通要道，同时也是东南亚的门户，若是让葡萄牙占领那里，那么他们也就打开了东南亚的大门，同时也对大明沿海造成了巨大的威胁。
想想历史上大明几代海盗王与葡萄牙之间的复杂关系，以及明末时郑芝龙父子与葡萄牙人之间的战争，虽然他们能够暂时打退了葡萄牙对大明沿海的入侵，但当时南洋已经落入西方各国手中，他们进可攻退可守，很快就能卷土重来，最后到了清末时，更是演变为各国入侵中原大地，天朝上国终于沦落成任人欺凌之辈，往日的光辉再也不复存在。
抛开这些大的方面不说，若是让葡萄牙人进入到东南亚，那么对于周重这些走私商人来说，绝对不是一件好事，因为这标志着日后的海上贸易中，他们又多了一个实力强横的对手，这也意味他们从走私赚取的利润将会急骤减少。
甚至周重忽然发现，到时自己这些人其实和之前印度那边的穆斯林商人的处境十分相似，葡萄牙人翻过好望角后，终于打通了欧洲与印度洋之间的航线，从而与穆斯林商人展开竞争，而现在马六甲海峡就是东南亚和大明沿海的好望角，若是放任葡萄牙占据那里，那么对周重这些走私商人来说，绝对是一场灾难的开始。
不行！我绝对不能让葡萄牙人占据马六甲海峡！只见坐在客厅里的周重忽然站了起来，然后在客厅里来往的走动几趟，无论是于公还是于私，周重都不能让让葡萄牙得逞，只可惜他自己现在的实力有限，就算是赌上老本，却也没有太大的把握，这让周重是心急如焚。
不对，我还有一个办法！本来心急如焚的周重忽然灵光一闪，想到之前想过的一个可能，当下脸上也不禁露出了几分笑容，本来他还在踌躇这件事该不该做，不过现在看来，这已经是他唯一的希望，只能尽力一试了！
周重想到的办法其实很简单，既然自己的实力不够，那就只能求助了，而在整个大明有实力帮助他的，也只有那位以玩物丧志闻名的正德皇帝了，而且刚好他也答应了足利一辉，要与他们足利家的使者一起进京去见正德皇帝，刚好到时可以想办法说服对方。
说起来这个时期的大明虽然军力衰退的厉害，除了北方的边军还保持着相当强的战斗力外，中部和南部的军队几乎已经在和平的生活中丧失了大半的战斗力，海上力量更是随着海禁的施行而萎缩的厉害。
不过正所谓烂船还有三斤钉，就算大明的军队再怎么腐败，但总归还是有一些比较精锐的军队，比如以周重最熟悉的海上力量为例，他就知道在广州和宁波这两个允许各国进贡队伍进出的港口周围，就驻扎着两支依然保持着相当战斗力的舰队，若是能说服正德皇帝，让他明年葡萄牙人进攻马六甲时，调动这两支舰队前去援助，那么绝对可以挫败葡萄牙入侵南洋的脚步，到时他也可以趁虚而入，将自己的势力伸到马六甲城中！