崇祯琢磨了一阵之后，觉得于孝天这么做似乎有点道理，而且这么做可以控制地方官员权力过大，于是第一次点头称赞了一下。
随着于孝天掌权之后，进入到秋季的时候，崇祯开始从简报上看到了一些更好的消息，为祸中原一带的流民军因为建奴入关，于家军入京，朝廷抽调洪承畴以及大批陕兵入卫的空挡得以喘息，重新开始复振。
但是随着于孝天掌权，重新安排调配官吏以及安排洪承畴和孙传庭返回中原各省督剿流民军开始，流民军的日子很显然不好过了。
随着各种新政的实施，老百姓的负担被大副降低，许多闹得厉害的地方，朝廷直接下旨，免除了那些当地百姓积年拖欠的各种税负，而且当年的粮赋也全部减免，争取吸引离家的百姓返乡复耕。
至于很多连年遭受灾的地方，同样也下旨免去所有拖欠的税负，并且承诺将会重新丈量土地，大幅度削减之前朝廷的各种加派。
这使得老百姓们看到了希望，不再发愁交不起皇粮，所以老百姓开始渐渐的安心了下来，不愿意再轻易加入流民军为祸一方。
流民军渐渐的开始失血，许多流民军之中的乱民，听闻到了朝廷宣布的各种惠民政策之后，再也无心跟着那些匪首们混下去了，于是大批大批的开始当了逃兵，向官府投降，然后回乡重新当他们的农民。
这么一来相当多流民军无法再像以前那样嚣张了，并且在于家军精锐也投入对他们的进剿之后，各路流民军连战连败，活动范围开始被大幅挤压，不断有一股股流民军在各地强力进剿之下灰飞烟灭，匪首要么投降被捕，要么被杀，几个月下来，十余股流民军被洪承畴和孙传庭等人剿灭。
到了十二年底的时候，罗汝才和张献忠授首，只剩下了最大的一股李自成所部，被赶到了庆阳府和平凉府一带。
与此同时于孝天将各地抄没所获的大批资金以投入到赈济灾民的事情之中，着令各地官府大力赈济灾民，恢复灾民重新回到他们的土地上进行耕作，配合新政的推行，遏制了土地兼并的势头，使得老百姓看到了希望，渐渐的回归他们的故土重新复耕。
在此期间，于孝天令锦衣卫明察暗访，同时也让他的手下进行监控，着实抓住了一大批手长的官吏，这帮家伙贪习惯了，现如今经手这么大量的赈济钱粮，岂能不伸手捞钱，于是一个个撸胳膊挽袖子准备大捞一笔。
于孝天等的就是他们这么干，正愁找不到杀这帮家伙的借口，这一次他们伸手捞钱，可以说是正中于孝天的下怀。
于孝天双管齐下，在赈灾的同时，抓住了相当多官吏的脏手，这一次他可不会客气了，对付这帮贪官污吏，直接就是大开杀戒，杀的可以说是人头滚滚，甚至有的县城，从知县到下面的差役，被抓了个干净，连办事的官吏都没有了。
于孝天不管这些，这天底下最不缺的就是想当官的人，他下令拟旨，选拔大批以前想当官但是没机会的生员，直接外放到各地补缺，至于那些控制地方事务的家族性的小吏，则也使用新人补缺，不怕他们把以前的水搅浑，大不了把之前地方上的那本烂账打个结，开新账，总之确保地方事务有人管就成。
虽然这么做出现了不少的弊端，可是总好过沿袭旧制，继续让地方官场烂下去，如此雷霆手段，在大明史上，也除了当初的朱重八这么干过，就算是心狠手辣的朱棣也没于孝天如此狠辣。
于孝天还想方设法的筹措了种粮，并且在北方各地推广种植良种稻米和谷麦，让老百姓先有粮种可用，从南方调集大量粮食北运，投入对灾民的赈济之中，让老百姓起码能先有口饭吃，撑到过了年夏收之际，只要北方到了崇祯十三年夏收之后，乱象便基本上可以得到控制。
崇祯从简报上看到这么多流民军纷纷被剿灭，不由得暗自有些惭愧，他当了十几年皇帝，但是流民军却越剿越多，中原是越来越乱，可是于孝天才执掌大权半年多时间，流民军就被大批剿灭，河南开始渐渐恢复了平静，湖广一带流民军也逐渐被清剿，现如今只剩下陕西那边，流民军还没有被完全控制，其余的各省已经逐渐的恢复平静。
虽然他认为于孝天如此好杀，并不是好事，弄不好会把地方搞得无官可用，但是事实告诉他，他这种担心并没有称为现实，于孝天破格录用了大批新的官吏，充斥到那些被清洗了官场的地方去，很快就稳住了那些地方的形势。
随着大批赈灾的钱粮被投入到地方之后，老百姓第一次享受到大明子民的待遇，虽然赈济不多，可是却可以让他们勉强维生下去，只要有口饭吃，绝大多数老百姓都不愿意揭竿造反，提着脑袋和朝廷官军打仗。
加之这一段时间于孝天令都察院和新的锦衣卫强力介入赈济活动，着实捕杀了一大批按照老习惯，试图从赈济灾民的钱粮中伸手捞一把中饱私囊的官吏，使得老百姓第一次真正的领到了配发给他们的钱粮，让他们得到了真正的实惠。
为了劝耕，恢复地方农业生产，于孝天还令地方监管已经领取粮种的百姓对土地复耕，一旦发现有人懒惰，不肯下力气去复耕他们的土地，把发给他们的粮种吃掉的话，就没收他们的土地，将其打入牢中，发配到外地苦役营之中做苦力，让他们去修缮河道以及道路，这一招够狠，着实清除掉了一些好吃懒做之辈，还获取了一大批免费劳力。
总之在于孝天接掌大权之后，大明北方的局势迅速的开始被平靖了下来，这一点崇祯不得不承认于孝天做的比他强百倍，而且于孝天手腕比他毒辣的多，手中拥有一支可供他随意驱使的虎狼之师，这支军队对其极度忠诚，于孝天剑指何处，他们便杀奔何处，任何试图阻拦于孝天前进的力量，都被他们彻底碾碎。
而崇祯自问自己虽然贵为一国之主，但是却从未拥有这样一支效忠于他的军队，跟没有能力打造出这么一支雄师。
于孝天和他最大的不同，还不是他手头拥有一支这样凶猛的可供他驱使的虎狼之师，而是于孝天这个人并不求名，为了达到目的，可以不择手段，软的硬的他都可以做出来，这段时间出宫行走的曹化淳、王德化、王承恩等贴心太监，还给崇祯带回来一些小道消息。
有坊间传闻，说这半年来，大明各地有不少官吏其实是对于孝天推行新政持着反对态度的，而且许多地方的官员于地方豪强勾结起来，试图采用武力对抗于孝天的新政，但是其中很多人尚未做好准备，就莫名其妙的被人给暗杀了。
而且很多起暗杀事件，都可以直指于孝天，有刺客在数百米之外，使用火-枪，一枪致命，将暗杀的目标一下解决，往往不给他们留任何机会。
甚至于江西一个副将，因为叫嚣着要支持江西巡抚起兵进讨于孝天，结果一天晚上，他全家老少都被人在家中杀了个精光，连房子都被点火烧光，最终一点罪证都没有留下来，结果其麾下的兵马立即就被于孝天派兵接管，就地解除了武装。
而江西巡抚自己也很快就被暗杀，有人在他出门办事，落轿下轿子的一瞬间，十几个刺客在不远处一座房子的屋顶对其开枪，用火-枪将其乱枪打死，最终江西各地官府，都很快表态，愿意推行于孝天的新政。
而大明全国各地，像这样的暗杀事件，据说遍地都是，没有一万起，起码也有好几千起之多，虽然所有人都知道这是于孝天的手下暗中所为，但是也拿他没有办法，搞得大明上下那些试图和于孝天对抗的人，无不心惊胆战，连门都不敢出，坐在家里面都提心吊胆。
崇祯听罢之后感到一阵阵的心寒，对于孝天又有了一层更深的了解，这家伙着实为达目的完全无所顾忌，不管是采用什么手段，只要达到他所要的目的就行。
还是崇祯十二年底，刚刚开放了半年不到的海禁，在年底的时候，于孝天对四个开放的商埠所获的关税进行了统计，仅仅是半年时间，设在松江府、宁波府、泉州府、广州府的四个市舶司，就为大明收获了三百七十万两白银的关税，而且这些关税直接入户部藩库，几乎顶上了大明初年一年全国的税赋。
这么一来大明一直以来都捉襟见肘的财政困境，也随之得以解决，于孝天于是再接再厉，把天津大沽口、山东的浮山所、浙江温州府三个地方也开放，各增设一个市舶司，并且将市舶司正式直接隶属于朝廷的户部统管。
新任的户部尚书周方作这一下可就乐坏了，以前谁当户部尚书谁头大，大明到处都伸手要钱，可是户部却永远没有足够的钱用，现如今随着开海禁之后，单单是市舶司就给户部赚回来这么多银子，户部总算是不用再为天天缺钱感到头疼了。
当然谁都不会嫌钱多的，于孝天赚钱的能力强，但是花钱的速度比谁都快，这家伙出手大方，往往户部刚刚收到一些钱粮，马上就被他又一转手给花了出去。
崇祯十三年初，于孝天公布了一个新政，那就是将目前大明官吏的薪俸，在原有基础上直接由高到低提高两到四倍，官职低的涨工资幅度最大，而官职高的涨工资幅度稍低，但是比之以往，还是提高了很多。
另外对于以前需要官员自己掏腰包养活的一些人员，比如一些原来朝廷并不负责开发饷钱的衙役，现如今于孝天指令朝廷给各地制定定员定额，其薪俸也由朝廷来承担其薪俸。
这么一来，对于地方官员来说，就免去了他们一项极为沉重的负担，不需要他们自己再自掏腰包去养活这些必须替他们跑腿办事的人员了。
而有明以来，明朝的官吏俸禄一直没有改善，朱元璋立国之初，便制定了从俭养政的政策，使得大明官员的薪俸一直处于很低的状态。
而大明官员想要活的体面一些，仅仅靠着这微薄的俸禄是根本玩儿不转的，他们除了养活一大家子人以及迎来送往正常的支出之外，还要养活一些替他们跑腿办事的人员，这些替他们跑腿办事的人员，也需要他们自掏腰包来养活。
所以他们不得不想办法从其它地方弄钱，要不然的话当官非但过不上体面的生活，弄不好还搞得倾家荡产。
这也是朱元璋立国之后，虽然对官吏们采取了极为严苛的管理，甚至推出了剥皮萱草的办法，杀了很多官吏，可是却依旧没有办法彻底制住整个大明上下官吏的贪-腐之风，而薪俸太低无疑是一个很重要的原因，官吏拿不到丰厚的薪俸，还要过体面的日子，还要养活很多人，不想办法捞钱，是不可能的事情。
现在于孝天针对这个弊政，大幅度提高官吏们的薪俸，并且将以前一些需要官吏们自掏腰包养活的体制之外的人，也纳入到体制之内，由国家给予俸禄，使其可以体面的生活。
但是仅凭这一项，就想高薪-养廉是绝对不成的，这也是于孝天改组锦衣卫，将其归入都察院之下，来监控各地地方官员的初衷。
这时候都察院和其下辖的新锦衣卫，其实就成了一个监察部门，专司监察官吏们平时做事，查办他们之中贪赃枉法之人。