舆论宽松的一代新政开始了。遗诏颁布完毕，大小臣工叩头，响起了一片哭声。徐阶将遗诏正本收起交与礼部尚书高仪，由礼部安排誊抄复制，驿站五百里加急，分送全国十三道（省）、布政司，十三道各衙门宣读后，再行誊抄，令各府州、县于各城门口张挂。就这样，嘉靖遗诏从上到下宣读、公布，不出一月，神州大地家喻户晓：新皇帝坐龙庭了。嘉靖遗诏的颁布，使徐阶的声望达到了极致。嘉靖遗诏徐阶以嘉靖的口吻为四十五年的统治，画上了圆满的句号；徐阶以嘉靖的口吻为裕王朱载垕的登基，铺好了红地毯；徐阶以嘉靖的口吻为从大礼议始的直言得罪之臣，昭雪平反，扶正祛邪，倡导了舆论的宽松；徐阶以嘉靖的口吻指斥斋醮、大兴土木、珠宝采集，为天下百姓减轻了负担。大明王朝也由此开启了政治渐清，民困渐苏的崭新局面。只是这新局面维持的时间太短，终因经自己力荐而入阁的郭朴、高拱的杯葛，日后高拱的倒行逆施夭折了。
裕王朱载垕遵嘉靖遗诏之命登上了皇位，徐阶和张居正又起草了登极诏。这登极诏的内容都“遵奉遗诏”，它的意义在于革除弊政，布新政，收拾人心，整顿纪律诸多政纲，以新皇帝诏书的名义宣告中外，开一代新局。
有趣的是，日后徐阶把遗诏和登极诏都收进了自己的文集《世经堂集》，确认自己对此两诏书的著作权。百废待兴，首先是释放被囚言事诸臣。徐阶嘱咐，首先将海瑞放了。
且说海瑞在诏狱中，无钱通关节，不可能像严世蕃那样饮酒作乐。消息也很闭塞，嘉靖弃世，海瑞浑然不知。倒是那监狱长，私忖先皇帝去世，新皇登基，海瑞将获重用，出于私心，打算先拉拢一下关系。
突然有一天，哐啷一声，牢门打开，那监狱长走了进来，两个狱卒，手托木盘随后，在监狱长指挥下，搬来张桌子，从盘子里端出菜肴，一一摆上，旋即又取来两壶酒。
海瑞知道，这是自己人生的最后一餐，他想，死也不能做个饿鬼吧？ 就坐了下来，仰着脖子长鲸饮百川，把一壶酒一吸而光，然后夹菜，大嚼起来。
那监狱长笑了，知道海瑞误会了意思，便斥退狱卒，轻声说：“恭喜海大人，贺喜海大人。”海瑞把脸一板：“临刑之人，喜从何来？去！别扰我酒兴。”监狱长毫不计较海瑞的态度，弯下身子，与海瑞咬起耳朵来：“宫车晏驾，海大人将出狱重用了。”海瑞举在空中的筷子定格了：“这事当真？”没等监狱长回答，海瑞突然丢下筷子，捶胸顿足，号啕大哭。刚饮下的酒，吃下的菜肴，一股脑儿呕吐出来，秽气熏天，随即昏死在地上。那监狱长慌了神，海瑞死在狱中，那干系大了，立即把手伸到海瑞鼻孔处：“还好，有气息。”封建时代士大夫对皇帝的忠心，由此可见一斑。
海瑞获释，徐阶拟旨将海瑞从正六品的户部主事，调升为正五品的大理寺丞。朱载垕登基，改元隆庆。隆庆元年（公元1567年），上大行皇帝（嘉靖）谥号为肃皇帝，庙号世宗。
接着平反昭雪获罪言官。在世的纷纷起用，已死的分三等，处死的杨继盛等，复职，赠荫，朝廷为之祭奠；廷杖死的，复职，赠荫；在狱中及充军死的，复职，赠官。
增设内阁大臣。吏部侍郎陈以勤升任礼部尚书兼文渊阁大学士，礼部侍郎张居正为吏部左侍郎兼东阁大学士，进入内阁。于是，内阁由六人组成，徐阶、李春芳、郭朴、高拱、陈以勤、张居正。其中高拱、陈以勤、张居正均为隆庆皇帝裕王府的旧部。还是一朝天子一朝臣，徐阶倾心培养的张居正终于入阁，时年四十三岁。