建立医学院，成立大明皇家医院，并不是朱载坖拍脑袋决定的。
早在见到李时珍的时候，朱载坖有已经有了这个想法。只是那时的李时珍还一门的心思在修本草纲目，朱载坖也愿成人之美。
如今朱载坖觉得，时机已经成熟，便挽留李时珍为医学院的山长，和大明皇家医院的院正。原先的那些太医院太医，都要经过李时珍的考校。能者进入医院治病救人，或是到医学院教学。滥竽充数的，则罢免其太医之职。
连地址朱载坖都已经替李时珍选好了，就在南熏坊南边，紫禁城外西南角，紧靠着翰林院。他选的这个地址，足见对于医术的重视，要建立现代医院体系。
李时珍给朱载坖把完脉，叮嘱了一些注意，又重新开了两张药方。一个方子是为了调理朱载坖的身体，另一张方子，则是固本培元温补之用。
朱载坖建立医院与医学学的旨意一下，朝中大臣们倒是没有反对的。
因为朱载坖在医院里，给了朝中大臣一些治病报销的福利，并将之形成了制度。各个品级的官员，按品级划分报销的额度。如此一来，这些官员看病，便可给自家省了一些。关键是中医十三科除了祝由科，其他十二科都集中在一起，这样看病极为方便。
还有一个不同之处，便是对于民间同样开放。
这旨意一下，天下都被震动，无不称颂朱载坖是位仁德之君圣明皇帝。
此时塘沽、上海、泉州、广州四大市舶司已经成立两月，第一批的关税银子也已经到帐。让朝中群臣惊讶不已的是，这两个月的关税银子，竟然多达二百余万两之巨。
大明的丝绸、茶叶、瓷器，历来为海外所喜。这次开海，海外诸国积压已久的购买欲完全暴发，两月之间的交易量简直惊人。
除了大部分被弗朗机人买去，还有许多都被朝鲜、日本及南海诸国所购买。
如此一来，朱载坖手中可用的银子便有了富余，正可让他做些事情。
再一次召见成国公朱希忠，朱载坖与之商议锦衣卫的用途。
朱希忠对于朱载坖，如今是非常信服。
“陛下召见老臣，问锦衣卫之事，可是有何不能公之于众的事要做。”朱希忠知道锦衣卫是特务机关，如此说也是有原因的。
“锦衣卫在成国公的手中，朕还是很放心的。只是锦衣卫以前所做之事，已让百官十分诟病，其用途应该改一改了。”朱载坖沉吟道。
朱希忠有些不解，“陛下，锦衣卫收集军政之情，拱卫陛下安危，这是太祖之时为了驾驭不法之臣而定下的，不知陛下要如何改？”
朱载坖颌首道：“世异则时移，锦衣卫所管之事太多太广，官民皆怨。又有陆炳弄权，致成先帝之殇。所以，锦衣卫要将权柄收一收，不如专职于海外军政资情收集。锦衣卫也改名，称之为情报司。”
“陛下有命，老臣自当遵从。”朱希忠是没有闲话敢说，但是却也不能糊涂，“只是陛下的安危，又有何人来担。”
“朕的安危，自然是交由亲军来负责。”朱载坖笑道：“这些亲军，必须都是上过战阵的。如今只从京营出战之兵中挑选，便可组成擅战亲军。如此，也不会再是以前的花架子。”
至于谁来监督群臣不法事，朱希忠也不再问，这位陛下显然已经有了主意。
果然，没过一会儿，黄锦便被一同召上殿来。
“内臣黄锦，见过陛下。”黄锦在嘉靖大行之后，便一直留在司礼监中，给田义打下手。
虽然朱载坖曾答应过，必定不会亏待他，可是他也不敢抱太大的希望。
朱载坖看向黄锦道：“东厂如今还可堪用？”
朱希忠心中一紧，东厂原来可是为了制衡锦衣卫而建，陛下这么问，可是锦衣卫中又出了乱子？他这颗心，便又一下子提了起来。
“东厂自先帝信重陆炳之时起，便已经投闲置散。”黄锦低头恭敬道：“若陛下有事，内臣必不让东厂偷闲。”
“如此甚好。”朱载坖点头笑道：“朕说过会重用于你，绝不食言。东厂便监督群臣诸官不法事吧，六科十三道的给事中与御使，统统调入东厂。此后不可再有风闻奏事，必由东厂查实，而交由六科给事中或由御使上本弹劾。此后，东厂便改为监察司，由你掌管，向朕直接负责。”
黄锦一下子张大了嘴，陛下给的权力有些大啊。这等于有负责监察天下的职责，那可就极其重要了。
将锦衣卫改为情报司，又将东厂改为监察司，朱载坖直接发了中旨。
百官即使有些不愿，可也不敢轻易违逆新君。与从前相比，朱载坖对于百官算是放松了绑绳，至少情报司去管大明境外之事了。而监察司虽然全面担负起了监察天下的职责，却不能随意的抓人。
其中唯一让朝中大臣们不满的，就是将科道言官都给弄到了监察司里。监察司的前身是东厂，属于内廷机构。如此一来，这些科道言官的身份，就不好界定。将来升迁，也不好安置。
但是科道言官向来不招人喜欢，这些家伙风闻奏事，早就让众臣看不入眼了。因此大家也就默认，没谁替他们说话。
朱载坖将朝堂架构修修补补，这个时候看起来，六部制其实已经有点乱。但他如此做，却也有自己的章法。不打乱旧有的朝堂格局和制度，将来便不能顺利的建立新的制度。
对于朝堂的权力分配，朱载坖还是要使其互相制约的，但不是六部制这种旧有的儒家制度体系。
但是为了减少大明的动荡，朱载坖还有一件事要做，那就是借着扩土开疆的威信，首先改革军制。