细菌战早在14世纪就已经由蒙古人首先使用，当时在进攻黑海城市卡法的时候，蒙古军队使用投石机把带有鼠疫病菌的尸体抛入了城内，致使城内居民和军队很快就感染了鼠疫。
由于鼠疫这种病传播的速度很快而且致死率达到了70%，卡法城很快就不攻自破。
不过由于当时的隔离和卫生条件所致，鼠疫蔓延到了全欧洲，并且肆虐了近300年，导致近3000万人死亡，在当时的欧洲，人们谈黑死病而色变，黑死病就是鼠疫。
由于爪哇岛上气候炎热、植被丰富、动物资源极多而且人口密集，对于鼠疫的传播和扩散都是非常有利的条件。所以，在论证了好多条方法之后，刘芾决定对爪哇岛使用细菌武器，以便用最快、最便宜、最彻底的方式，消除掉爪哇岛上的2000多万爪哇人。
会不会遭到世界舆论的谴责？刘芾认为舆论这个东西只能影响不够强大的人和团体，如果力量差距太大，舆论毫无作用，而现在这个时期，正式一个好机会，所有比南海联邦强大的国家都在打仗，所以刘芾不太怕什么舆论。
况且刘芾觉得，按照自己的布置，虽然不敢说一只苍蝇都飞不出去吧，但是想要把爪哇岛上的情况带出爪哇岛去，也非常非常的难。
那岛上的荷兰人会不会向荷兰政府发报揭发，那就不是刘芾能解决的问题了，两国已经处于交战状态了，谁会相信荷兰政府的指控呢？
会不会遭到良心的谴责？刘芾一点也没感觉到良心有啥问题，从政的人如果还有良心，那就不是一个合格的政客，需要你有良心的时候，你就要马上把良心掏出来，展现给大众，并且还要让大家看清楚，自己的良心比别人都长得大；而不需要你有良心的时候，你就得马上忘掉这个东西，仿佛世界上从来就没有这个词出现过。
至于如何把鼠疫病菌带入爪哇岛并且传染给当地人，这个就不是刘芾需要操心的事情了，据说内务部和研究所的一些技术人员将在苏拉威西岛上建立一个战俘营，哪里将关押着被封锁舰队俘虏来的爪哇人。
他们在这个战俘营中被关上一段时间后，就会感染上由研究所提供的鼠疫病菌，然后这些人就会被装上一条船，在封锁舰队的护送下，返回爪哇岛。
为了加速病菌的蔓延，这些被送来的俘虏的原籍将遍布整个爪哇岛，并且按照原籍被护送回爪哇各地。
负责这个战俘营的是内务部的特别行动队，这只队伍将接管整个战俘营所在小岛的一切防务，任何试图靠近这个小岛的船只都将会遭到水下几艘潜艇的攻击。
而负责接送战俘的海军军舰，也只能远远的停泊在海岛以外几海里的地方，再由战俘营的船只把战俘接到小岛上去；等到护送的时候，海军军舰上都将有内务部的人员负责监督，严禁一切海军人员接触战俘船只上的人，如果不听劝告和命令，这些内务部的监督人员有权对军舰上的所有人使用武力，包括舰长。
这个研究所将持续3个月的时间，在结束研究任务之后，这个岛上将遭到凝固汽油弹的洗礼，并且被标记为不适合人类居住的岛屿，由研究所监控起来。
第一波战俘在1917年7月3日，被押上了一艘500吨左右的货船，并由2艘驱逐舰护送，驶往了他们的出发地，爪哇岛上的三宝垄。
这一船30多人，都是三宝垄的本地人，是一个小家族，世代在这里经营烟草生意。当几个月以前爪哇岛被封锁之后，他们的生意就没法做了，于是大家一商量，最后决定，带上所有家当，悄悄出海，前往马来西亚去投奔亲戚吧。
因为他们都非常害怕，他们感觉到，这几百年以来，欺负当地的华人都成了爪哇岛上的一个传统节日了，从来都没出过啥问题，但是这次不一样了，那个刚刚建国没多久的南海联邦突然站出来为华人出头了，而且一口气干掉了荷兰人的多一半远东领地，并且把爪哇岛封锁的严严实实，别说做买卖了，就算是下海打渔，都时不时的会被机枪扫射。
而且以前骑在他们头上的荷兰人、白人老爷们，对这种状况毫无办法，不仅是没办法，就连他们自己都自顾不暇了，刚刚被封锁之后的几天里，有好几艘挂着荷兰旗子的船只都在海上被击沉了。
仿佛是故意给荷兰人示威，这些船只大多是刚刚出港就被击沉，船上的白人老爷们全都被淹死在海水中，而那些从海水里冒出来的黑黑的大家伙，却禁止一切打算去救人的船只接近，如果有船只胆敢不停劝阻，立刻就会被水下的其他大黑家伙击沉。
在确定沉船上的所有人都淹死之后，这些大黑家伙会慢慢的沉入海水中，继续监视港口的动静。有了这种杀神在港口外待着，只要是头脑稍微清楚点的人，都不会驾船或者坐船离开码头半步。
而他们这一大家子人，是在10天以前由三宝垄登上这艘货船，打算趁夜前往马来西亚，不过在刚刚离开港口几海里，就被一艘南海联邦的潜艇发现了，结果就是被俘，然后被送到了这个小岛上。
刚刚被送到这个小岛上的时候，这30多人的小家族发现岛上有一个由几十间木板房组成的小营地，而在营地中，已经有了上百名和他们一样的偷渡客在居住了。
他们大多按照船只、家族、出发地等信息被安排在一所或者几所木板房中，每天由穿着一身套头怪衣服、脸上的玻璃面具上还连着一个管子的人负责送饭送水。除了不准外出之外，他们的伙食和待遇还都不错，而且木板房中还有厕所。
在居住了几天的时间之后，他们会被送上自己原来的船只，然后被遣返回爪哇岛，而他们不知道的是，在这几天的生活中，他们中的一部分人已经被携带着鼠疫病菌的跳蚤叮咬过，在他们体内，已经感染上了鼠疫病菌，并且将在几天之后发作。
在遣送回爪哇岛上第一批带菌俘虏的同时，所有参与封锁爪哇岛的南海联邦部队就都收到了一条命令，命令内容就是爪哇岛上正在流行一种瘟疫，所以禁止封锁部队接触一切来自爪哇岛上的人员和物品，所以以后看见不明船只之后，只有一种选择，那就是开火击沉，并且连海上的船只碎片都不许打捞。
在运营了13天之后，岛上的战俘营在一个清晨被宣告废弃，所有的工作人员都将登上一艘客船，并由3艘潜艇陪伴着在海上漂泊10天，在确定无人感染之后，才能返回联邦的土地上。而那个小小的无人海岛，则在客船离开之后，由海军的一艘重型巡洋舰上的2架水上飞机负责投放燃烧弹，把战俘营连带着岛上的植被，全部付之一炬。