秦宗权认为兵力十倍于朱全忠，便欲悉全力以攻汴州，将其吞并。887年3月，他令其将张晊屯兵北郊，弟弟秦贤屯板桥，各有众数万，共列三十寨，连延二十馀里。朱全忠向诸将说道："秦贼大举来攻，以为我派朱珍东出募兵尚未归还，我们兵少，只能畏怯自守而已。殊不知朱珍已回，我们应出其不意，率先发动攻击。"于是朱全忠亲自领兵攻打秦贤之寨，士卒都踊跃争先。而秦贤没有防备，被连拔四寨，斩万馀级。朱全忠又使牙将郭言募兵于河阳、陕、虢等地，得万馀人而还。蔡将卢瑭屯在万胜，夹汴水扎寨，欲断绝汴州粮运之路，朱全忠就令朱珍乘雾攻击，杀获几尽。于是蔡州兵都集合到张晊处，朱全忠再次大发兵攻击，杀二万馀人，蔡人大惧。秦宗权听说后，亲率精兵数万从郑州赶来！这回轮到朱全忠害怕了，他派人向天平节度使朱瑄求救。
天平镇与宣武镇是邻镇，其治所在郓州，濮州、曹州亦属其管辖。邻道衮州，其刺史不为人所服，朱瑄乘机将之吞并后已有众三万，朱瑄从父弟朱瑾，勇冠军中。他们久闻秦贼大逆不道，朱瑄便欣然答应，使朱瑾带军前来相救。五月时朱全忠与朱瑾合兵大战秦宗权于边孝村，朱瑾跃马横矛，身先突阵。只一阵杀得秦宗权大败，斩首二万馀级。秦宗权连夜逃走，朱瑾急追至阳武桥不及而还。自此秦宗权之势转衰。朱全忠极为感激朱瑄朱瑾兄弟，三人结拜为兄弟，约定共灭秦贼、平分其地。朱全忠称朱瑄为兄，事之极尽谦恭礼数。先前秦宗权所派出的的保守东都、河阳、许州、汝州等地之兵将，听说秦宗权败后，很多都来归附朱全忠，朱全忠声势大震。
朱全忠为人多狡诈权数。这时，欲壑难填、极度膨胀的他竟起了先吞并天平镇的念头。以怨报德之事虽说不是第一次做了，但再厚颜无耻也总得找个借口吧。于是他召诸将商议，在听其幕僚敬翔说了几句话后，朱全忠眉开眼笑，不断点头。他按敬翔所说的去做 ，先使人抓来几名罪犯在众军面前斩首，然后欺骗军士们说道这些人受了朱瑄的招诱，想要去投奔朱瑄。
于是朱全忠发难，遣其将朱珍、葛从周先用计夺曹州。朱珍诈说是受朱全忠入城犒军的，曹州刺史丘弘礼认为三人结拜，同仇敌忾，自然不疑，让朱珍领着数百人进城。哪成想，宴席时，朱珍早已令入城军士夺取城门，放大军进来。不设防备的城内兵士猝然受到攻击，很快被克，而丘弘礼也被朱珍在杯酒间拔刃杀掉。之后朱珍又攻濮州。曹州陷落、濮州被攻的消息传来，朱瑄、朱瑾如同在梦中被雷惊醒，怎么也想不到朱全忠竟会恩将仇报。朱瑄大骂道“这个逆贼真是无耻，丧尽天良。我们出兵救他于危难之中，如今不出数月，竟反过来攻击我们？将结拜视为儿戏。出尔反尔，如此作为，天必厌之！”朱瑾怒道“我定要割掉他的猪头做成溺器,取他腹内的膏脂点灯，方能泄掉我的心头之恨！”
两兄弟亲自带兵与朱珍大战于刘桥，朱瑾跃马冲杀，所向披靡，直寻朱珍挑战。朱珍亦是骁勇，前来交战。两人大战数十合难以分出胜负。然而这时朱瑄军队因寡不敌众而全面落败，被杀上万人。朱瑾只得弃了朱珍逃回。朱瑄、朱瑾逃跑时又发现退路早已被断。在汹涌而来的的追兵下，两兄弟拼死血战才得以突围，两人两骑回到郓州。
后来朱珍攻濮州，朱瑄派亲弟弟朱罕将步骑万人前往营救。朱全忠使其骁将李唐宾领兵劫击，大败其军，李唐宾于阵斩杀朱罕，万人军队所剩无几。攻克濮州后，刺史朱裕逃往郓州，朱珍就继续攻郓州。朱瑄使朱裕诈为书信一封，送给朱珍，说愿意约为内应。信中大致说道“因失濮州，朱瑄虽未治罪于我，但不满之色已写于脸上。酒席间甚至多有羞辱之词。吾与朱瑄只是族亲，枝叶疏远。听闻宣武朱公英明过人，而贵将军又勇冠诸军，朱瑄、朱瑾岂是对手？因此吾欲弃暗投明，以城降于将军！我已与手下亲信约好，子时打开城门，到时将军可带兵进入，趁机夺取城池。”
朱珍看后大喜，到了子时，果然看到城门大开，朱珍便使其副将带兵先入，自己在后跟随。当朱珍距离城门数十步，马上就要进去时，忽然城上大落木石，箭矢纷飞。而城门也随之而闭，入城之军与城外之军被隔断。朱珍急忙率军后退，先入城的数千人尽数被杀。
因朱瑄本以为朱珍已入城，所以才关闭城门。后来得知朱珍侥幸逃脱后，懊恼不已。但乘此胜，朱瑄再次夺回了曹州。
这时，淮南地区又产生了动乱。节度使高骈晚年昏庸，荒醉失政，一切政事交于妖道吕用之。牙将毕师铎本是黄巢部下的降将，欲乘机取而代之，便自高邮起兵，与宣州秦彦合兵以袭广陵，攻克扬州、杀了高骈后自称节度使。唐昭宗以为朱全忠败秦宗权有功，欲倚仗他，便让朱全忠兼做淮南节度使，讨伐毕师铎。朱全忠虽喜皇帝此举，但因正与秦宗权、二朱兄弟对抗，尚未能抽出兵力。再说那妖道吕用之逃走后投奔了庐州刺史杨行密。杨行密家本孤贫，但膂力强健，能日行三百里。当初秦宗权扰乱淮右时，频繁攻击庐州，原庐州刺史招募能战擒贼者，以杀敌的首级之数论赏。杨行密以胆力应募，杀敌无数，升为队长，后又因功大做了庐州刺史
杨行密得知扬州被克后后亲自领万人去攻广陵，短兵才接，杨行密伪遁，毕师铎之兵争相入其栅，抢掠金帛，而这时杨行密的伏兵大发，自己又回军来攻，杀得敌军大败，最终收复广陵。这时朱全忠见杨行密已据广陵，便派人来与杨行密结盟，希望能与其共同对抗秦宗权，并向皇帝上表，请求杨行密做淮南节度副使，使自己的行军司马李璠为淮南留后，并遣牙将郭言将兵千人护送。徐州节度使时溥自以为先受诏讨伐秦宗权，况且其境又与淮南相接，竟没能兼领淮南，对此甚是怨恨。李璠欲往淮南，必过其地，到泗州时遭到了时溥的袭击，赖郭言力战才得免。自此徐州、汴州两镇结仇。
杨行密得朱全忠之信后，也是心中不乐。对部下怒道“朱温让我做一副使，他的人来做留后，那将来这地盘不还是他的吗。朱温野心真是够大。哼，我百战得来的地盘岂能拱手送人！”决定立即与其决裂。但听说李璠未能到来，自己部下又劝说道“刚得淮南、百废待兴，不宜于此时结一强仇”，杨行密便表面上应允了朱全忠的联盟，实际上淮南之事全在自己的掌控之中。
那秦彦、毕师铎败后投奔秦宗权之大将孙儒，孙儒认为他们无能便将他们都杀掉，自己大举兵以攻杨行密。当时江、淮地区疾疫盛行，孙儒亦感染疾疫，为部下所杀，送其头于行密，杨行密尽得孙儒之众，声势大振。自此杨行密招合遗散，休兵养民，政事宽简，百姓甚乐。杨行密又选兵练将，以图霸道。选骁勇五千人，甲胄皆绘以黑色祥云图案，号“黑云都”，厚养于自己府第，待之如同家人。驱之使战，无不争先。