嘉靖阅后怒发冲冠，浑身发抖，竭尽全力把《治安疏》掷在地上，在万寿宫满地乱走，大呼：“快快抓来，别让这畜生逃了！”
说海瑞的《治安疏》不合时宜，怎的不合时宜了？
严嵩在内阁凡二十一年，到晚年弊端丛生，一片乱象。其时前后弹劾严嵩的不下三十余人，最为著名的有“越中四谏”、“戊午三子”，还有杨继盛等，可谓前仆后继，壮烈异常。试问此时的海瑞何以不呈上《治安疏》，而偏要待到严嵩倒台？嘉靖四十一年（公元1562年）严嵩倒台之后，四年之间徐阶实施“三语新政”，**要官买官之风已杀，严氏党羽大部罢斥，正人君子破格提拔，劝谏嘉靖放宽舆论，言官议政不拘不杀，东南倭平，盐税降低，朱衡、潘季驯治河大展拳脚，良好的政治局面初步形成。海瑞为甚在此时此刻来个《治安疏》引起轩然大波，分散内阁精力，得个直谏之名，于事却丝毫无补，此中原因，耐人寻味。
此次览疏，嘉靖暴怒，下旨说：“海瑞，畜生，辱骂皇上有悖为人臣的道理，着锦衣卫捕获交给镇抚司，严厉查处幕后主使和他的同谋。”
如果海瑞被论死，宽松的舆论又被扼杀，对建言者的杀戒重开，后果不堪设想，徐阶不得不集中精力应对。
法司审讯议罪，刑部尚书黄光升进退维谷。不定海瑞死罪，嘉靖定然不依，弄不好三法司也被一锅端掉；论海瑞死罪吧，自己名节难保。束手无策之际，他又约同张守直、张永亮，同去徐府求救。
徐阶正为此事发愁，见三位法家到，立即延请入府，共商良策。坐停之后，三人大叹苦经。四个人都想保住海瑞，但无计可施。危急关头，徐阶一反谨慎之态，直截了当授计，说：“与圣上的独处，我比诸君多，圣上的性格，我也比诸君了解为多。欲救海瑞，为今之计，劳驾三位，先论死。”三人大吃一惊：“ “
论死？”徐阶立即解释:圣上性疑，凡论拟轻罪，必怒而重处，海瑞必死无疑。拟重罪，反倒冷静，未必马上听从。”于是，三法司议拟海瑞“子骂父律”处死。
当嘉靖从太监黄锦那儿得知海瑞已备好棺材，诀别妻子时，沉默了；又看到三法司“论死”的奏本，觉得法司还是能体会圣心，维护帝王权威的，怒气稍稍平息。嘉靖反复取读《治安疏》，说：“此人可比比干，但朕非纣王。”于是海瑞奏疏“留中”达数月之久，不拟旨批红就不杀，不杀就有救。徐阶赢得了喘息之机。
一波未平，一波又起。因袁炜告病，徐阶不愿独自擅政，阁臣又增三人，他们是李春芳、郭朴、高拱。嘉靖有天突然召见阁臣，说想宣布退位，把皇位让给儿子。此时景王已死，嘉靖膝下唯独裕王一个儿子。他说：“海瑞说我不上朝的话没错，可朕病得久了，怎能上朝？朕想专事玄修，传位于裕王，卿等票拟施行。”嘉靖内心剧痛，心力交瘁，撂挑子了！风云突变。
四位阁臣紧急商议，由徐阶拟本呈上：“臣等捧读圣谕，不胜惊悚！不胜惊悚！海瑞就是孟子所谓的禽兽，《治安疏》不必放在心上，传位一事，臣等不敢闻。谨将圣谕封还。”
封还当天，嘉靖又下谕旨说：“不依朕的传位，海瑞带头，将来指斥联不理朝政的大臣会更多。”徐阶接第二道谕旨后回家，张氏一见大惊：“老爷斑白的头发怎么全白了？”
几天之内，徐阶须发皆白。郭朴、高拱经徐阶荐举三月份才入阁，内阁的运转尚不熟谙，李春芳又是个好好先生，如此棘手的大事，只能是徐阶全力承担，加上嘉靖、裕王父子关系疏远，迄今尚未将裕王册立为太子。此番嘉靖撂挑子，朝中大臣不明所以，如果上表拥立裕王，一旦嘉靖震怒，连得裕王的地位也难保。所以徐阶不得不全力周旋。
徐阶再次复奏，针对嘉靖恐怕今后更多的大臣指斥自己不理朝政的担心开导说：“海瑞的话，凡是有见识的人，都认为是狂妄错误的，自然不会有人跟着来指斥。”徐阶又批海瑞“沽名钓誉”、“不足与他计较”，又称“主圣则臣直”，结论还是将嘉靖圣谕退了回去。
嘉靖执拗之性大发，第三道谕旨下达，依然要传位。徐阶再次封还，并第三次上奏称：“臣等捧读，不胜惊惧！不胜惊惧！”拒绝了嘉靖要求传位的要求，并恳请嘉靖“勿生疑”。嘉靖三次传谕，徐阶三次复奏，处死海瑞的时间就被延宕下来。对此，嘉靖稍有不满，曾说：“徐相国庇护海瑞。”
徐阶三复疏，终于安定了大局。嘉靖继续做他的皇帝，海瑞仍然被关押牢中，死亡的威胁远去了。
这一年，大明军队抵御鞑靼的能力得到了提高，俺答进犯，被徐阶破格提拔的总兵官马芳击退。流窜福建广东的海寇吴平基本剿平。蓟辽总督赵炳然击败锡林阿部。但固原、偏头关两战，明军还是败北。给事中沈束，拘押十八年，终于释放。而张居正多了一职，掌翰林院事。
时光荏苒，转眼到了十一月，嘉靖病重。