大礼议最终以震惊朝野的伏门事件和大礼案狱收梢，但余震还是不断，朝中忠良大伤元气，幸进之徒长袖善舞。但嘉靖毕竟不可能把朝中大臣驱逐一空，留任的大臣中虽有二三十人改换门庭，投靠张璁、桂萼，但绝大多数与张璁之流依然是水火不相容。
就在徐阶守制的三年里，朝中每议决一事都会引发两阵营之间的火拼。嘉靖四年（公元1525年）议嘉靖之父“献皇帝”神主是否应进太庙，引发了一场余震；嘉靖五年（公元1526年），为“献皇帝”在京城立庙，又引发纷争。大凡纷争起，不论缘由，无关是非，总是张璁、桂萼之流胜出。他们只需一句话，嘉靖就会点头。这句万试万灵的话翻译成白话就是：“臣等大礼议意见与廷臣相反，所以廷臣总是与臣等为敌，反对臣等的意见。”有时还会作秀，假意要辞官回乡。嘉靖心知肚明，张璁等人一走，朝中又尽是反对派了，岂能容得？所以处处向着张璁、桂萼，是非功罪颠倒，黑白善恶不辨，朝中是一片乱象。一言以蔽之，朝廷患上了大礼议综合症。
世事已不可为，正直的大臣就纷纷求退。俗话说，撒尿也离你三条田埂。不当官，回老家总可以吧。嘉靖四年（公元1525年）七月，兵部尚书金献民致仕；嘉靖五年（公元1526年）五月，刑部尚书赵鉴致仕；同年十一月，大学士费弘要求致仕，未准；嘉靖六年（公元1527年）二月，大学士费弘、石珤同时致仕；同年三月，户部尚书秦金致仕，兵部尚书王时中托病回乡；同年六月，提督两广军务的姚镆请求致仕获准；同年八月，南京吏部尚书朱希周请求致仕，获准。
正直大臣开溜，张璁之流像明星似的窜升了。嘉靖六年（公元1527年）十月，张璁被擢升为礼部尚书兼文渊阁大学士、预机务，也就是进入了权力中心的内阁。桂萼提升为刑部尚书。
兄终弟及，嘉靖接了正德的皇位，但这一对难兄难弟，都置民生于不顾，肆意胡为。比起正德对天下的危害，嘉靖有过之而无不及。
张璁、桂萼神清气爽，针对朝中反对派连连出手，施以打击。
嘉靖六年（公元1527年）三月，桂萼出重拳指向科道官。科指的是六科，即吏、户、礼、兵、刑、工科的给事中，这六科直接隶属于皇帝，属于言官的性质，官职虽低（给事中、左右给事中只为副七品），权力很大，有权直接向皇帝报告，弹劾官员，参与官员的选拔，皇帝的御前会议，审理有罪官员，甚至有权封还皇帝的诏书，凡科道官认为皇帝旨意不妥，可拒绝执行。道指的是全国十三道监察御史，分管十三个道（省）的稽查工作，也属言官范畴。科道官利用自己的优势，不断弹劾张璁、桂萼，桂萼之流恨之入骨。嘉靖六年（公元1527年）五月，桂萼上书称，原首辅杨廷和广植私党。虽伏门事件斥逐多人，但遗奸犹在，奏请皇上恩准，仿效宪宗初年举措，令科道官互相揭发！面对面也好，背靠背也罢，不相互揭发就是不忠。桂萼引宪宗初年事，纯属无稽之谈，目的是为进一步驱逐言官。是非不分的嘉靖立即恩准，而且下达比例，按比例淘汰。由此，十三道在已驱逐十名的基础上，又淘汰四名；六科在已驱逐四人的前提下，又淘汰四人。由上海知县提上来的御史郑洛书，也只能卷铺盖走人。
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